Industrial Biotechnology Bioetanol till bilen ‐ en mikrobiell produktionsutmaning. Lisbeth Olsson Industriell bioteknik, Kemi‐och bioteknik, Chalmers [email protected] Industrial Biotechnology Varför bioethanol? • • • • Drivmedel till transportsektorn Minskat utsläpp av drivhusgaser Nationell energiproduktion Hållbar produktion 2 Processöversikt Industrial Biotechnology Sukros Stärkelse Lignocellulose Produktion av enzymer med hjälp av jäsning Hydrolys av polymert material Jäsning Produkter 3 Industrial Biotechnology Lignocellulosa material Lignin kan brytas ner till aromatiska föreningar Hemicellulosa bryts ner till glukos, galaktos, mannos, xylos och arabinos Cellulosa bryts ner till glukosenheter Industrial Biotechnology Lignocellulosamaterial är svårt att bryta ner, och det bildas inhibitorer vid nedbrytningen Industrial Biotechnology • En jäsningsprocess eller en fermenterings‐ process är en bioteknologisk process, där levande celler används som katalysator •En jäsningsprocess kan foregå i industriell skala Levande cellers kemi Kolkälla Råvara Syre Kvävekälla Produkter Koldioxid Biprodukter Produkter Industrial Biotechnology Viktiga egenskaper för en mikrobiell cellfabrik i industriella processer •Högt utbyte och produktivitet •Minimal biproduktbildning •Konsumtion av flera sockerarter samtidigt • Stresstolerance •Hög etanoltolerance •Tolerance mot inhibitorer •Processrobusthet Zaldivar et al. (2001) AMB, 56, 17 Metabolic enginering Industrial Biotechnology Möjliggör väldefinierade förbättring av definerade egenskaper i det cellulära maskineriet. Det är en iterativ process som omfattar syntes, analys och design Substrat Substrat ME Produkt Produkt Biprodukt Celler Celler 0.8 0.6 0.4 0.2 0.0 60 10 50 1 Biomass Glucose Xylose Xylose consumption rate 0.1 40 30 20 0.01 10 0.001 0 50 100 150 0 200 150 200 S. cerevisiae TMB 3001 innehåller XR och XDH från P. stipitis och endogent XKS (Eliasson et al. 2000) Glycerol, ethanol, xylitol (g L-1) Time (h) 25 Glycerol Ethanol Xylitol 20 15 10 5 0 9 Roca et al (2004) AMB, 63, 578 0 50 100 Time (h) Glucose, Xylose (g L-1) 1.0 Biomass (g L-1) Odlingsmedium: Definerat medium, 50 g/l xylos + 20 g/l glukos Mål för metabolic engineering Xylose consumption rate (g gDW-1 h-1) Industrial Biotechnology Industrial Biotechnology Redoxreaktioner begränsar etanolproduktionen i Saccharomyces cerevisiae Kunskap om reguleringen av redoxmetabolismen i S. cerevisiae är begränsad Industrial Biotechnology 325 biokemiska reaktioner omfattar oxidation/reduktion; redox kofaktorer medierar elektronflöde i cellen NADPH: reduktiva reaktioner (biosyntetiska) NAD+: oxidativa reaktioner (katabola), Regenerering av kofaktorer är nödvändigt 11 Industrial Biotechnology Redoxbalans och xylosmetabolism 2-ketoglutarate + NH4+ GDH2 2-ketoglutarate + NH4+ NADPH GDH1 XR + NADP xylitol glutamate xylose NADH GS-GOGAT glutamate NAD+ NAD+ 2-ketoglutarate + NADH NH4+ GS-GOGAT glutamate ATP ADP XDH xylulose XKS xylulose-5-P Kolfluxen omdirigeras från xylitol till etanol. Ökad produktion av NADPH och NAD+ Roca et al (2003) AEM, 69, 4732 Industrial Biotechnology Metabolic engineering av xylosemetabolismen genom modulering af redoxmetabolismen Överuttryck av XR and XDH (from Pichia stipitis) Överuttryck av endogent XKS (Eliasson et al. 2000) S. cerevisiae TMB 3001 Överuttryck GDH2 Deletetion GDH1 Överuttryck GS‐GOGAT (GLN1/GLT1) Den rekombinanta stammen visade: •12 % förbättrad xyloskonsumtion •16 % förbättrat etanolutbyte •45 % minskat xylitolutbyte De genetiska förändringarna ledde också till ändringar i cellens metabolism i orelaterade delar av det metabola mätverket Roca et al (2003) AEM, 69, 4732 Industrial Biotechnology Förbättrad galaktosekonsumption Framgångsrika metabolic engineering stragier blev funna både när strukturella gener och regulatoriska gener fick ändrad uttrycksnivå Identified after physiological investigations 70 % ökad galaktos‐ konsumtion 40 % ökad galaktos‐ konsumption Oestergaard et al (2000) Nature Biotechnol. 18, 1283, Bro et al (2005) AEM, 71, 6465 Industrial Biotechnology Industriella förhållade leder till mikrobiella stressreaktioner och suboptimal produktion 220 1000 200 160 DP4+ Maltotriose Maltose Glucose 140 Glycerol Ethanol Cell count 120 100 100 80 60 40 20 0 10 0 10 20 Devantier et al (2005) AM B, 68, 622 30 40 15 Time (h) 50 60 70 80 Cell count (mill/g) Concentration (g/kg) 180 Industrial Biotechnology Stambakgrund Fysiologisk karakterisering visade att laboratotriestammen växte dåligt under industriella förhållanden mRNA array analys visade att den celluläre responsen mot stress var förhöjd Devantier et al (2005) Ind Biotechnol, 1, 51 Industrial Biotechnology Stambakgrunden är väldigt viktig för hur tolerant jästen är mot de inhibitorer som finns i lignocellulosahydrolysat Panagiotou and Olsson (2007) BB, 96, 250 17 Industrial Biotechnology Produktion av kemikalier med hjälp av bioteknologi Drivkrafter • Billiga råmaterial • Förnyelsebara råmaterial • Utnyttjande av den biodiversitet naturen erbjuder • Teknologi tillgänglig för design av avancerade cellfabriker • Ren teknologi • Minskat beroende av oljebaserad produktion Industrial Biotechnology Mer biologteknologisk produktion i framtiden Industrial Biotechnology Utmaningar för framtiden Billigare och mer effektiva processer kan erhållas genom att: •Använda den postgenoma teknologiplatformen •Design av cellfabriker som kan utnyttja förnyelsebara råmaterial •Förståelse för hela processen och växelverkan mellan de olika processtegen •Den kemiska industrin har stort intresse av bioteknologisk produktion, men har begränsade kompetenser Otero et al (2007) AdvBiotechnol Biochem Eng 108, 1