Institutionen för Ekologi, miljö och geovetenskap, Umeå universitet
Ht 2013
23 September 2013 - 17 January 2014
18/6/2014
Genetik and Evolution 22.5 hp
Lecturers: Department of Ecology and Environmental Sciences
Barbara Giles (BEG), Course coordinator, tel 090-786-55 21
Pär Ingvarsson (PKI)
Folmer Bokma (FB)
Ulla Carlsson-Granér (UCG)
Xiao-Ru Wang (XRW)
Anders Nilsson (AN)
Agneta Andersson (AA)
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
Assistenter Elisabet Åkerlund (EÅ), Karin Olofsson (KO), Per Hedström (PH), Mariana Sjöström (MS)
Literature: Biology - A Global Approach, 10th Edition, Campbell and Reece, (parts/all of Units 2 - 7)
Lokal:
Tider:
Föreläsningar, lab, grupprum: Kolla varje dag
See specified times; ca 8.30 - 11.30 & ca 12.30 - 15:30.
OBL:
Obligatoriska moment
DATE
Föreläsningssal
Grupprum
Labsal
ACTIVITY
Week 39: Läs kap 7, 16, 17, 18, 12
LECTURER
Mån 22.9
am
8:30 - 9:30 - Kursinformation, registrering
10:00 - Livets uppkomst - varför studera genetik & evolution?
KB5C2
NC250
BEG
NC290
BEG
Inläsning (s. 161-197; 369-388 - VIKTIG ) s. 140-161; 351-370
pm
Ons 24.9
am
8:30-11:30 - DNA:ts transkription, translation och
NC290
kromosomers uppbyggnad - mutationer (läs s. 389-415) s. 371-396
förberedelse MitosLab
BEG
pm
Tis 23.9
am
Inläsning (Chap 25)
8:30 - Cellens byggnad och den genetiska materialets
struktur
Insläsning - s. 421-447
pm
Tors 25.9
am
8:30-11:30 - Control of gene expression (läs s. 421-447)
pm
Fre 26.9
am
pm
Insläsning - s. 286-304, 308-322
NC250
s. 274-291, 294-309
8:30-11:30 - Cellcykler - mitos (s. 286-304) s. 274-291
NC250
12:30 - OBL Gruppdiskussion-överföring av genetisk information,
utlämning av skriftlig uppgift; förberedelse MitosLab
NC250
Week 40: Läs Kap 13,14, 15
Mån 29.9
am
8:30 - Insamlings expedition OBL
pm
12:30 Säkerhetsgenomgång; Lab - mitos OBL
BEG
EÅ
UCG
NC440
EÅ, MS
1
DATE
Tis 30.9
am
ACTIVITY
LECTURER
8:30-11:30 - Livscykler - meios (s. 308-322)
Insläsning - s. 323-347
pm
Ons 1.10
am
Inläsning - s. 348-360
s. 294-307
pm
NC280
EÅ
?
BEG
NC440
EÅ
?
BEG
NC290
EÅ
?
BEG
NC250
EÅ
?
BEG
?
EÅ
?
EÅ
?
BEG
NC250
BEG
NC250
BEG
NC250
BEG
(s. 332-350)
12:30 - Räkneövning 2 OBL
8:30 - Rekombination, koppling och kartering (s. 348-367)
(s. 332-350)
12:30 Lab - Bananfluga Lab 2 OBL
pm
Ons 8.10
am
8:30 - 3-punktstest - räkneövningen 3 OBL
pm
Tors 9.10
am
pm
Fri 10.10
am
BEG
s. 308-331
12:00-15:00 -Diskussion, frågastund, feedback på uppgift OBL
pm
Tors 2.10
am
8:30 - Mendel-en gen, två gener, genetiska lagarna (s. 323-347)
s. 308-331
12:30 Lab - Bananfluga Lab 1 OBL
pm
Fre 3.10
am
8:30 - Mendels genetik - sannolikhet och statistik (s. 323-347)
s. 308-331
12:30 - Räkneövning 1 OBL
pm
Week 41: Läs Kap 15 + TentaInläsning
Mån 6.10
am
8:30 - Utvidgning av Mendelsk genetik, könsbestämning
(s. 323-347)
s. 308-331
pm
Tis 7.10
am
NC290
Inläsning
Inläsning
Inläsning
10:00 - Frågastund
Inläsning
Week 42: Läs kap 21, 23, supplementary material
Mån 13.10
am
9:00-14:00 Tenta - genetik Östra Paviljongen - Skrivsal 1
Inläsning
pm
Tis 14.10
am
8:30 - Mutations, Chromosomes and Gene duplication
Multigene traits
Inläsning - s. 360-365 (s. 343-348)
pm
Ons 15.10
am
8:30 - Populationsgenetik - genetisk variation i populationer
Hardy-Weinberg modellen
Inläsning - s. 544-551; suppl (s. 515-522)
pm
Tors 16.10
am
8:30 - Utvidgning Hardy-Weinberg model,
pm
Inläsning - s. 544-551; suppl
(s. 515-522)
2
DATE ACTIVITY
Fre 17.10
am
SEMESTERDAG
LECTURER
pm
Week 43: kap 21, 23, supplementary material
Mån 20.10
am
8:30 - parningsystem -påverkan på genetiska variation
12:30 - Räkneövning 1 OBL
pm
Tis 21.10
am
8:30 - Naturlig selektion 1 (läs s. 551-563, suppl.)
(s. 523-533; suppl.)
pm
Inläsning
Ons 22.10
am
8:30 - Naturlig selektion 2 (läs s. 551-563, suppl.)
(s. 523-533; suppl.)
12:30 - Räkneövning 2 OBL
pm
Tors 23.10
am
8:30 - Genetisk drift - migration (läs suppl.)
12:30 - Räkneövning 3 OBL
pm
Fre 24.10
8:30 - Adaptation
am
pm
BEG
NC230
EÅ
NC230
BEG
NC230
BEG
NC230
EÅ
N230
BEG
???
EÅ
NC290
PKI
NC280
PKI
EMG
EÅ + KO
EMG
NC280
EÅ + KO
PKI
EMG
EÅ + KO
NC280
PKI
Inläsning - s. 565-581; (s. 534-552)
Week 44: Läs kap 24, supplementary material
Mån 27.10
am
8:30 - Mikroevolution - artbildningsprocesser 1 (läs s. 565-581)
(s. 534-552)
Lab - DNA extraction and PCR OBL
pm
Tis 28.10
am
8:30 - Lab - Restriction enzyme treatment OBL
09:30 - Mikroevolution - artbildningsprocesser 2
pm
NC230
12:45 - Lab - Screen restriction site variation OBL
Förbereda artbildningsdiscussion
Ons 29.10
am
8:30 -Human evolution (s. 804-810)
(s. 774-779)
12:30 - Diskussion - artbildningsprocesser OBL
pm
Tors 30.10
8:30 - Molekylär evolution I
am
NC250
PKI
Inläsning - förberedelse för diskussion om human evolution
pm
Fre 31.10
8:30 - Molekylär evolution II
am
NC250
PKI
NC250
PKI
NC250
PKI
pm
12:30 - Literature discussion - human evolution OBL
Week 45: Förbereda för evolutionstentamin
Mån 3.11
8:30 - Literature discussion - Molekylär evolution OBL
am
pm
Tis 4.11
am
Inläsning
pm
Inläsning
10:00 - Frågastund
NC280
BEG, PKI
3
DATE ACTIVITY
Ons 5.11
am
Inläsning
LECTURER
pm
Inläsning
Tors 6.11
09:00 - 14:00 Tenta - Evolution Östra Paviljongen - Skrivsal XX
am
pm
Fre 7.11
am
pm
SEMESTERDAG
Week 46:
Mån 10.11
8:30 - 9:00 - Introduktion fördjupningsuppgift - OBL
am
NC230
BEG, UCG
NC230
FB
12:30-14:30 - History life on earth, Groups treated in systematics NC230
FB
9:00-11:30 - Origin of life, history of life on earth, major mass
extinctions, continental drift & phylogeography, major transitions
12:45 -16:30 - video “life in the rocks”, discussion of video
pm
NC230
FB
Tis 11.11
Inlämning labrapport
am
8:30 - principles of developmental biology,
NC230
FB
ontogeny and phylogeny, homology, synapomorphy, pleisiomorphy
12:30 -15:00 - video “rare glimpses”, discussion of video
pm
NC230
Ons 12.11
am
8:30 - Phylogenetics (systematics) history
NC230
(Socrates to today, Linneaus, Darwin, Hennig), parsimony, distance matrix, algorithms
fokus på grupper i systematik delen)
12:30 -15:00 - phylogenetics exercise distance matrix OBL
pm
Tors 13.11
am
8:30 - reading time / tree thinking article OR
OPTIONAL - 8:30 - likelihood lecture
pm
12:30-13:00 - Question time
13:00 -Test Exam OBL
Fre 14.11
am
8:30-10:00 - Discussion “exam” results (OBL)
10:00-11:30 – article presentations
pm
12:30 -15:00 - article presentations
Week 47:
FB
FB
NC230
FB, JG?
NC230
FB
NC230
NC230
FB
NC230
NC230
FB
NC230
Mån 17.11
am
10:00-12:00 - klassificering och dess förhållande till släktskap
NC230
AN
Inläsning - (s. 553-566, 597-599, 602-606, 610-620, Kap 27)
pm
Tis 18.11
am
8:30 - Bakterier/ Arkeer 1
NC230
AA
NC430
AA+MS
pm
LAB???
Ons 19.11
am
8:30 - Bakterier/ Arkeer 2
pm
LAB???
AA
NC430
AA+MS
4
DATE ACTIVITY
Tors 20.11
am
8:30 - Livscykler, Protister (s. 297-298; kap 28)
pm
Inläsning - (s. 297-298; kap 28)
LECTURER
NC230
UCG
5
DATE ACTIVITY
Fre 21.11
am
8:30 - Introduktion Plantae, Landväxter
(livscykler, mossor, ormbunkar mfl) - (kap 29-30)
pm
12:30 - Materialstudier: Protister OBL
Week 48:
Mån 24.11
am
8:30-11:30 - Fröväxter
Inläsning - Kap 28-31
pm
Tis 25.11
am
8:30-11:30 - Barrträd aktuell forskning
12:30 - Materialstudier: Växter OBL
pm
Ons 26.11
am
8:30-11:30 - Svampar, Fungi
Inläsning - Kap 28-31
pm
Tors 27.11
am
8:30-11:30 - Materialstudier: svamp OBL
pm
12:30 - Individuell uppgift om protister/svampar/växter/
livscyklar OBL
LECTURER
NC230
UCG
NC 430
UCG + EÅ
NC230
UCG
NC230
XRW
NC 430
EÅ
NC 430
UCG
NC230
UCG
NC230
UCG
Fre 28.11
Individuell uppgift om protister/svampar/växter/livscyklar OBL NC230?
am
pm
Arbeta på Individuell uppgift - lämnas in måndag 1/12 kl 09:00
Week 49:
Mån 1.12
am
10:00-12:00 - Introduktion till djuravsnittet,
Djurens ursprung och embryologi (s. 700-710)
pm
Tis 2.12
am
AN
NC230
AN
Museet
PH
NC230
AN
NC230
AN
Museet
PH
Inläsning - s. 700-738
10:00-12:00 - Ryggradslösa djur I & II (s. 712-738)
pm
13:00-15:00 - Materialstudier: Ryggradslösa djur I & II
Ons 3.12
am
8:30-11:30 - Blötdjur & leddjur (s. 712-738)
Inläsning - s. 712-738; s. 747-773
pm
Tors 4.12
am
10:00-12:00 - Tagghudingar & ryggsträngsdjur
pm
NC230
13:00-15:00 - Materialstudier: Blötdjur/ M: Leddjur
6
DATE
Fre 5.12
am
ACTIVITY
LECTURER
10:00-12:00 - Fiskar, grod- & kräldjur (s. 747-773)
NC230
PH
13:00-15:00 - Materialstudier: Deuterostomier/
Week 50:
Museet
AN
Mån 8.12
am
08:30-10:00 - Materialstudier: Fiskar/Grod & kräldjur
Museet
PH
pm
Tis 9.12
am
NC230
AN
Museet
PH
NC230
FB, AA, UCG
AN
pm
Inläsning
8:30 - Fåglar och däggdjur
12:30-14:00 - Materialstudier: Däggdjur/
pm
Ons 10.12
am
Inläsning
pm
Inläsning
Tors 11.12
am
10:00 - Frågastund
pm
Inläsning
Fre 12.12
am
9:00-14:00 Tenta - Flylogeni & systematik Östra paviljongen - Skrivsal XXXX
pm
Week 51:
Mån 15.12
am
08:30-11:00 - Projekt details, writing - final topic choice - OBL
am/pm eget projekt arbete
Tis 16.12
am
eget projekt arbete
pm
Ons 17.12
am/pm
Tors 18.12
am/pm
Fre 19.12
am/pm
eget projekt arbete
eget projekt arbete
eget projekt arbete
eget projekt arbete
14.12.20 - 15.01.02: SEMESTER
God jul och gott nytt år!
Week 2: Projekt work
Ons 7.1
am/pm
Tors 8.1
am/pm
Fre 9.1
am/pm
eget projekt arbete
eget projekt arbete
eget projekt arbete
Week 3: Projekt & PRESENTATION
Mån 12.1
am/pm eget projekt arbete
Tis 13.1
am/pm
eget projekt arbete
????
BEG
7
DATE ACTIVITY
Ons 14.1
am
Inlämning av skriftlig arbete kl 09:00 - få en annan arbete för bedömning
eget projekt arbete
pm
eget projekt arbete
LECTURER
8
DATE ACTIVITY
Tors 15.1
am
9:00 - student seminars & discussion
LECTURER
NC290
BEG/UCG/AN
pm
Fri 16.1
am
12:30 - student seminars & discussion
NC290
BEG/UCG/AN
9:00 - student seminars & discussion
NC290
BEG/UCG/AN
pm
12:30 - student seminars & discussion
NC290
BEG/UCG/AN
Muntlig kursutvärdering
9
