KURSPLAN HÖGSKOLAN I KALMAR Naturvetenskapliga institutionen KURS KE3000 Fördjupad biokemi 15 högskolepoäng Advanced biochemistry 15 higher education credits Utbildningsnivå: Grundnivå Huvudområde: Kemi, Biomedicin Nivå: C Utbildningsområde: Medicin 100% Fastställd av Naturvetenskapliga Institutionen 2007-09-05. Senast reviderad 2008-08-21 Litteraturrevidering. Kursplanen gäller fr.o.m. höstterminen 2008. Kursen ingår i programmet Biomedicinsk kemi och ges även som fristående kurs. FÖRVÄNTADE STUDIERESULTAT Studenten skall efter avslutad kurs kunna: -redogöra för drivkraften och dynamiken bakom proteiners veckning och interaktioner; -redogöra för post-translationell proteinmodifiering; -redogöra för membranproteiners biokemi och dynamik; -redogöra för kvantitativa aspekter på ligand-receptorinteraktioner, bl.a. sett ur ett farmakologiskt perspektiv; -redogöra för receptormedierade intracellulära signaleringsvägar och deras reglering -redogöra för några typiska enzymmekanismer; -tillämpa enzymkinetik; -redogöra för eukaryot genexpression och dess reglering på samtliga nivåer; -redogöra för syntes av membranlipider; -redogöra för biokemin bakom syntes av eikosanoider; -redogöra för syntes och översiktligt för nedbrytning av vanliga biogena aminer; -redogöra för människans C1-metabolism och dess metabola betydelse; -redogöra för metabol adaptation vid normala fysiologiska respektive vissa patologiska tillstånd hosmänniska; -redogöra för metoder för strukturbestämning av proteiner; -redogöra för, tillämpa och värdera biokemiska separations- och analystekniker som olika centrifugeringstekniker, kromatografiska tekniker, elektroforetiska tekniker samt tekniker för studier av biomolekylära interaktioner; - med bioinformatik lösa en biokemisk frågeställning samt -självständigt planlägga, laborativt genomföra, dokumentera, utvärdera samt på ett vetenskapligt sätt skriftligt och muntligt presentera ett laborativt projekt. KURSENS INNEHÅLL Drivkrafter och dynamik bakom bildning av proteinstrukturer. Posttranslationell proteinmodifiering och dess biokemiska betydelse. Membranreaktioner och membranproteiners biokemi och dynamik. Ligand-receptorinteraktioner. Receptormedierade signaleringsvägar och deras reglering samt koppling till metabolismreglering och genexpression. Några typiska enzymmekanismer. Tillämpad enzymologi. Bioinformatik. Reglering av eukaryot genexpression genom genomorganisation, kemisk modifiering av DNA/RNA, DNA/RNA-bindande proteiner (inkl. sk enhancers, silencers, insulators) RNAi samt genom olika metaboliter. Biogena aminers och eikosanoiders metabolism. C1-metabolismen och dess metabola betydelse. Organmetabolism och metabol adaptation vid fysiologiska och patologiska tillstånd hos människa. Strukturbestämning av proteiner. Fördjupad kunskap om och tillämpning av biokemiska separationsmetoder och analystekniker för att studera proteiners biokemiska egenskaper, enzymers aktivitet, intracellulära signaleringsförlopp samt protein-proteininteraktioner. UNDERVISNING OCH EXAMINATION Undervisningsmomenten utgörs av föreläsningar, laborationer, gruppdiskussioner och seminarier. Deltagande i laborationer, gruppdiskussioner och seminarier är obligatoriskt. De laborativa momenten examineras i form av laborationsrapporter, som redovisas enskilt och skriftligt, muntligt respektive som poster. Seminariemomenten examineras efter enskild muntlig redovisning. Examination av teoretiska moment sker genom skriftlig tentamen vid kursens slut. En första omtentamen erbjuds inom sex terminsveckor. Antalet tentamenstillfällen är begränsat till sex gånger. På kursen som helhet, omfattande såväl teoretiska som laborativa moment, skall sättas något av betygen underkänd, godkänd eller väl godkänd. Bedömningskriterier för betyget godkänd framgår av Förväntade studieresultat (se ovan). Kursen bedöms med betygen Underkänd, Godkänd eller Väl godkänd. BEHÖRIGHETSVILLKOR Biokemi 15hp eller motsvarande. KURSVÄRDERING En skriftlig kursvärdering genomförs i slutet av kursen. Utvärderingsresultatet sammanställs i en kursrapport, vilken arkiveras hos institutionens administration. Resultatet av föregående års utvärdering och eventuellt vidtagna åtgärder kommuniceras med programansvarig och med studenterna vid kursens början. KURSLITTERATUR Obligatorisk litteratur Berg, Jeremy M., Tymoczko, John L. & Stryer Lubert. Biochemistry, 6:e upplagan. WH Freeman, 1026 sidor. ISBN 0-716-678724-5. Wilson, Ed. K. & Walker John. 2005. Principles and Techniques of Biochemistry and Molecular Biology. 6:e upplagan.. Cambridge University Press, New York. ISBN: 0521535816 | ISBN-13:9780521535816. Laborationskompendier i fördjupad biokemi, 2006, Högskolan i Kalmar. Valda vetenskapliga artiklar