Spridningen av ebolavirus i Afrika - en översiktsstudie Det dödligaste utbrottet av ebolafeber någonsin pågår än idag i Västafrika. Kan vi lära oss av detta samt tidigare utbrott för att förstå hur bakomliggande ebolavirus sprids? Emil Östholm Independent Project in Biology Självständigt arbete i biologi, 15 hp, vårterminen 2015 Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala universitet Sammandrag Spridningen av ebolavirus är ett pågående fenomen vars studerande involverar forskare från flera fält. Ebolavirus orsakar ebolafeber, en dödlig sjukdom, hos människor, schimpanser och gorillor. Samtliga utbrott av ebolafeber har ägt rum i ekvatoriella Afrika. Ett fåtal utbrott hos människor skedde mellan år 1976 och år 1979, varpå 15 år utan ett enda utbrott följde. Sedan 1994 har utbrotten skett mer fortlöpande, även utbrott hos schimpanser och gorillor har bekräftats sedan dess. Det finns fem arter av ebolavirus, de flesta är dödliga för människoapor. Samtliga ebolavirus är zoonotiska. Arten Zaire ebolavirus är den vars spridning är bäst känd och mest studerad. Ebolavirus finns endemiskt i naturen hos sina reservoararter. Ett virus orsakar med fördel inte sjukdom hos sina reservoararter. Människoapor är därför troligtvis inte del av en reservoar, men de kan ha en förstärkande funktion gentemot andra arter under ett utbrott. Flera arter fladdermöss har visats vara i kontakt med ebolavirus, och vissa har visats vara infekterade utan att vara sjuka. Fladdermöss, särskilt flyghundar, misstänks därför vara en viktig del av ebolavirus reservoarer. Vilka fladdermöss som funnits vara i kontakt med ebolavirus har visats bero på deras parningsstrategi, de arter som parar sig två gånger per år tenderar att vara i kontakt med ebolavirus i större utsträckning. Vi människor kommer i kontakt med fladdermöss när vi jagar dem, fladdermöss är stapelföda i delar av ekvatoriella Afrika. Släktskap mellan, och geografiska spridningsmönster för, vissa medlemmar av Zaire ebolavirus ligger bakom hypoteser om var utbrott av ebolafeber kan äga rum i framtiden. Vissa virus har visats spridas som en våg genom centrala Afrika, men andra utbrott har inte följt detta mönster. Det är därför svårt att förutsäga var nästa utbrott kan ske. Genom att studera i vilka miljöer tidigare utbrott har ägt rum kan däremot riskområden urskiljas. Regnskog under torrperioder fanns vara kopplade till hög risk. Kunskapen om ebolavirus spridning är otillräcklig, och forskningen är idag alltför fokuserad på Zaire ebolavirus spridning och fladdermöss som reservoarer. Framtida studier måste höja blicken och öka omfånget, fler arter av både virus och möjliga reservoarer måste inkluderas. Inledning Ett år och fyra månader senare kämpar fortfarande befolkning och vårdpersonal med det utbrott av ebolafeber som hittills krävt över 10 000 människoliv i Västafrika (WHO 2015a). Utbrottet spårades av Marí Saéz m.fl. (2015) till smittan av en tvåårig pojke i Guinea i december 2013. Smittan utgjorde utbrottets indexfall, den smitta som misstänks ligga bakom samtliga efterföljande sjukdomsfall. Att en pojke lekandes i en ihålig trädstam (Marí Saéz m.fl. 2015) orsakar över 10 000 dödsfall är inte bara talande för svårigheten både i att förhindra och i att hantera utbrott av ebolafeber, utan också för vikten av att försöka. Ebolavirusets historia är kort men händelserik. Det upptäcktes i och med att det orsakade de första kända utbrotten av ebolafeber 1976. De två utbrotten ägde rum samtidigt i nuvarande Kongo-Kinshasa och Sydsudan, dåvarande Zaire och Sudan (WHO 1978a, 1978b). Sedan dess har över 20 utbrott hos människor rapporterats i ekvatoriella Afrika (Walsh & Haseeb 2015), det dödligaste av dem pågår idag i Guinea, Liberia och Sierra Leone (WHO 2015b). Parallellt med ebolavirusets historia av smitta hos människor har även schimpanser (Pan troglodytes) och västliga gorillor (Gorilla gorilla) lidit stort av flertalet dödliga utbrott (Rouquet m.fl. 2005, Lahm m.fl. 2007, Wittmann m.fl. 2007). I kombination med dessa arters 1 bevarandestatus, som är hotad för schimpans och kritiskt hotad för västlig gorilla (Oates m.fl. 2008, Walsh 2008), blir ebolavirusets dödlighet ett reellt hot mot arternas överlevnad. Ebolavirus verkar inte vara i ständigt omlopp i någon av de ovan nämnda människoaporna (en grupp även vi människor tillhör). Ett utbrott hos oss inträffar när viruset smittar från de djur hos vilka det alltid cirkulerar. Att identifiera dessa djur är en pågående strävan som inleddes redan när viruset upptäcktes (Breman m.fl. 1999, Leirs m.fl. 1999, Ogawa m.fl. 2015). Genom denna strävan samt försök att förstå vilka miljöfaktorer som korrelerar med utbrott (Pigott m.fl. 2014) kan en förståelse fås för var riskerna för utbrott är som störst och hur de förhindras. Jag beskriver i denna uppsats spridningen av de ebolavirus som orsakar sjukdom hos människoapor. Mitt fokus ligger på den virusspridning som föranleder ett utbrott snarare än den påföljande spridningen bland de drabbade. Då utbrott av ebolafeber är svåra att hantera är ett förebyggande arbete angeläget, kunskap om föranledande spridning är därför essentiell. Genom att sammanställa och utvärdera befintlig forskning på området kan jag identifiera kunskapsluckor och peka ut en riktning för framtida forskning i syfte att täppa till dem. Därför redogör jag för kunskapen om utbrott av ebolafeber hos människoapor och ger en överblick av den forskning som försöker förstå hur ebolavirus sprids. Då det finns flera typer av ebolavirus som sprids oberoende av varandra kommer jag att beskriva dessa. Äldre forskning och resulterande hypoteser om spridning utvärderar jag utifrån senare utbrott när de kan tillföra nya perspektiv. Zoonoser och deras spridning De virus och andra mikroorganismer som kan smitta mellan olika djur kallas zoonoser. Följaktligen är ebolavirus zoonoser som har människor som en av sina potentiella värdar, arter som kan infekteras av viruset. Olika värdar är annorlunda från varandra vad avser deras känslighet för smitta och i vilken utsträckning de dör som följd av den. Den extremt höga dödligheten ebolavirus har hos människoapor (Beeching m.fl. 2014) har så vitt vi vet inte möjliggjort ständig smitta hos arterna. Utbrott hos oss verkar inte ske i en obruten följd. Hur kan vi då förklara ebolavirusets fortlevnad? Allmän spridningsteori Ödet för en smittsam mikroorganism kan beskrivas med ett mått, ”Basic Reproduction Number”, som förkortas R0. Måttet redogör för hur många nya individer en infekterad individ teoretiskt i snitt smittar i en population där alla andra kan bli smittade (Real & Biek 2007). R0 beskriver hur en smitta kan spridas i en population strax efter att den introducerats. Om R0 > 1 leder den första smittan till ett utbrott, annars lyckas inte zoonosen etablera sig hos värdpopulationen. För att studera det långsiktiga ödet för en smitta kan vi använda oss av det tidsberoende måttet överförbarhet, Rt. Nishiura & Chowell (2009) definierar Rt som det antal nya individer en infekterad individ i snitt faktiskt smittar i en population vid tiden t. Om Rt = 1 kommer antalet smittade i populationen att förbli konstant över tid, är Rt > 1 kommer antalet smittade att öka och om Rt < 1 är det zoonosens öde att dö ut i populationen. Det faktiska värdet på Rt är av olika anledningar obeständigt. Värdet beror på en rad omständigheter, hur viruset sprids mellan individer, såsom luftburet eller via kroppsvätskor; hur virulent, sjukdomsalstrande, viruset är och även hur den smittade populationen är strukturerad vad gäller täthet och åldersfördelning (Nishiura & Chowell 2009). Rt kan även variera genom det dynamiska förhållandet mellan virus och värd. Dynamiken uppstår allt 2 eftersom ett virus sprids genom en population och lämnar efter sig individer som inte kan smittas på nytt, antingen för att de är döda eller för att de har blivit friska och immuna (Nishiura & Chowell 2009). Då populationer inte är oändligt stora riskerar ett virus att göra antalet individer mottagliga för smitta för lågt. Därmed minskar Rt, och viruset dör ut i populationen. Reservoarer, tillfälliga värdar och förstärkare, olika värdar är olika För att förklara hur ebolaviruset på nytt kan smitta människoapor behöver vi hitta en reservoar. Ashford (2003) definierar en reservoar som ”ett ekologiskt system där ett smittoämne kan överleva på obestämd tid”. En zoonos reservoar kan därför utgöras av flera arter i vad jag kallar ett värdsystem, där olika värdar kan ha olika funktioner. De sporadiska utbrotten av ebolavirus hos människoapor är kortlivade likt dagsländor, redan när ebolavirus upptäcktes fanns därför misstanken att vi inte uppfyller kriterierna för en reservoar. Redan efter de första utbrotten 1976 söktes viruset hos djur (WHO 1978b). Taylor m.fl. (2001) uppskattar att 75% av uppkommande infektionssjukdomar orsakas av zoonoser, sökandet efter en alternativ reservoar var därför befogat. En värd kan vara reservoar för ett virus när populationen är ständigt smittad i en ganska konstant utsträckning (Rt = 1), detta kallas för endemi (Real & Biek 2007). De värdar som inte kan uppehålla en endemisk smitta, till exempel vi människoapor, är så kallade tillfälliga värdar (Ashford 2003). Hos dessa värdar är R0 > 1, men Rt kommer att sjunka allt eftersom färre individer blir mottagliga för smitta tills det att utbrottet är över. En tillfällig värd som smittas från en reservoar och hos vilken viruset sprider och förökar sig likt ett kedjebrev, kan fungera som en förstärkare om viruset därefter går vidare till att smitta en annan art. Ett exempel på ett virus med ett känt värdsystem är Nipahvirus, en zoonos med olika arter av hundfladdermöss som reservoar och tamgrisar som förstärkare (Epstein m.fl. 2006). Två utbrott av Nipahvirus hos människor i Bangladesh och Malaysia har direkt kopplats till kontakt med antingen fladdermöss, reservoaren, eller tamgrisar, förstärkaren (Chua 2003, Rahman m.fl. 2012). Det är det motsvarande värdsystemet hos ebolaviruset som är av största vikt att förstå för att få ett grepp om dess spridning. Ebolavirus – struktur och släktskap Virus är små och mycket enkelt uppbyggda, de klassificeras därför enligt de få karaktärsdrag virus kan besitta. Karaktärsdragen rör generellt virusets arvsmassa eller dess proteinhölje. Den enkelsträngade RNA-molekylen som bär ebolavirusets sju gener är negativt laddad och omges av ett trådlikt proteinhölje (Beer m.fl. 1999) som mest liknar ett godissnöre med en knut. Dessa karaktärsdrag och genetiska analyser placerar släktet Ebolavirus inom den taxonomiska familjen Filoviridae, i sin tur placerad inom ordningen Mononegavirales (Suzuki & Gojobori 1997, Kuhn m.fl. 2010). Släktskapet inom Filoviridae Spridningen av ebolavirus kan förstås bättre i ljuset av deras släktskap. Kunskap om släktskapet för det ebolavirus som ligger bakom ett utbrott ger en större noggrannhet över spridningens geografiska mönster. Dessutom kan spridningens historia härledas ur en jämförelse mellan släktskap och utbrottens geografi (Walsh m.fl. 2005), på samma sätt som släktskap hos oss människor berättar en historia om vår spridning över världen. 3 Familjen Filoviridae definierades efter upptäckten av två släkten, Marburgvirus och Ebolavirus (Kiley m.fl. 1982). Negredo m.fl. (2011) fann en ny sorts filovirus, en medlem i familjen Filoviridae, i Spanien 2002. Detta nya släkte upptäcktes i fladdermöss, och gavs namnet Lloviuvirus (Negredo m.fl. 2011). Enligt Negredo m.fl. (2011) är släktet Lloviuvirus närmast släkt med släktet Ebolavirus, båda har släktet Marburgvirus som systergrupp. Figur 1. Släktträd för Filoviridae. Längden på grenarna motsvarar inte tid till grenarnas sammanlöpning. Sammanslaget träd från Towner m.fl. (2008) och Negredo m.fl. (2011). Inom virologi betonas vikten av att skilja begreppet art från de organiska medlemmarna inom arten (Regenmortel 2003). Ebolafeber orsakas av ett ebolavirus, en kroppslig enhet, och inte av en art, ett abstrakt begrepp. Ebolavirusen utgör släktet Ebolavirus, och släktet utgörs, för nuvarande, i sin tur av fem arter (Figur 1). Jag följer namngivningen av Kuhn m.fl. (2010) och kallar de fem arterna Bundibugyo ebolavirus, Reston ebolavirus, Sudan ebolavirus, Taï Forest ebolavirus och Zaire ebolavirus. Medlemmarna inom arterna kallar jag för egna översättningar av deras populärnamn, i samma ordningsföljd, Bundibugyovirus (förkortas BDBV), Restonvirus (RESTV), Sudanvirus (SUDV), Taïskogsvirus (TAFV) och Ebolavirus (EBOV). Dessa namn och tillhörande förkortningar avser alltså de artbestämda virusen. Då Kuhn m.fl. (2010) benämner medlemmar av Zaire ebolavirus som Ebolavirus vill jag förtydliga att jag med ebolavirus (utan versal) syftar på samtliga medlemmar i släktet Ebolavirus (skrivs kursivt), och att jag med Ebolavirus (med versal) avser specifikt medlemmar av arten Zaire ebolavirus. När ytterligare förtydligande är motiverat använder jag även förkortningen EBOV. Ebolafeber - smitta och sjukdom Medlemmar från fyra av fem arter ebolavirus har orsakat ebolafeber med olika grad av dödlighet hos människor, Restonvirus är undantagen (Feldmann & Geisbert 2011). Jag kommer därför inte diskutera detta virus vidare. 4 Ebolavirus smittar människor först genom kontakt med levande eller döda smittbärande djur, varpå smitta främst sker människa till människa via kroppsvätskor (Dowell m.fl. 1999). Efter en inkubationstid (symptomfri period) på 2-21 dagar drabbas de smittade av ebolafeber, en allvarlig blödarfeber med en dödlighet på upp till 90% (Feldmann & Geisbert 2011). Ett fåtal personer har visats bära ebolavirus utan att drabbas av ebolafeber, vad som skyddade dem är okänt (Leroy m.fl. 2000). Det finns idag inget beprövat vaccin mot ebolavirus, att förhindra utbrott skulle därför kräva att smittan från naturen stoppades. Ebolavirusens historia i Afrika I en bomullsfabrik i Nzara i nuvarande Sydsudan insjuknade arbetare under juni 1976 i en blödarfeber utan tidigare motstycke i regionen (WHO 1978a). Brist på kunskap om orsaken till blödarfebern ledde till att detta utbrott förstärktes i det sjukhus som tog emot de smittade, efter fem månader och 151 konstaterade dödsfall kunde utbrottet förklaras vara över (WHO 1978a). Detta är det första kända utbrottet ebolafeber. De ebolavirus som låg bakom detta utbrott och det samtida utbrottet i Kongo-Kinshasa kopplades redan från början till det Marburgvirus som låg bakom sitt första utbrott 1967 i Tyskland och dåvarande Jugoslavien (Martini 1973, WHO 1978a). Marburgviruset är trådlikt, finns endemiskt i Afrika och orsakade likt de flesta ebolavirus en allvarlig blödarfeber (Martini 1973). Kiley m.fl. (1982) beskrev familjen Filoviridae utifrån dessa likheter i struktur och ekologi. Samtliga utbrott av ebolavirus hos människor, gorillor och schimpanser presenteras i Figur 2. Referenser för dessa utbrott sammanfattas i Appendix (Tabell 3). Utbrott hos människor mellan 1976 och 2015 Medan vårdpersonal kämpade med utbrottet i nuvarande Sydsudan i september 1976 började ett andra utbrott av ett än mer dödligt ebolavirus nära floden Ebola i norra Kongo-Kinshasa (WHO 1978b). De ebolavirus som låg bakom utbrotten döptes till Sudanvirus och Ebolavirus, efter var utbrotten ägde rum (Kuhn m.fl. 2010). Ebolavirus Ebolavirus (EBOV) har legat bakom flest utbrott hos människor, dessa utbrott har också varit de dödligaste. Samtliga utbrott orsakade av Ebolavirus hos människor sammanfattas i Tabell 1. Värt att uppmärksamma är att 17 år gick utan ett utbrott orsakat av Ebolavirus (15 år om Sudanvirus räknas med) mellan 1977 och 1994. Av vikt för flera hypoteser om Ebolavirus spridning är de tio utbrotten i Gabon och Kongo-Brazzaville från 2001 till 2003 (Leroy m.fl. 2004a). Tabell 1. Samtliga utbrott orsakade av EBOV hos människor. För de utbrott som skett i nära anslutning till varandra (t.ex. utbrotten i Gabon 1994) är dödsfall respektive dödlighet sammanslagna, här visat som streckade över och under, detta då det är svårt att avgöra vilket utbrott en smitta och eventuellt dödsfall hör till. Ytterligare information om utbrotten sammanfattas i Appendix. År 1976 1977 1994 1994 1995 Land Kongo-Kinshasa Kongo-Kinshasa Gabon Gabon Kongo-Kinshasa Bekräftade dödsfall Dödlighet (%) 280 88 1 100 5 31 60 254 81 1996 1996 2001 2001 2001 2001 2001 2001 2001 2002 2002 2003 2005 2007 2008 2014 2014 Gabon Gabon Gabon Gabon Gabon Kongo-Brazzaville Kongo-Brazzaville Kongo-Brazzaville Kongo-Brazzaville Kongo-Brazzaville Kongo-Brazzaville Kongo-Brazzaville Kongo-Brazzaville Kongo-Kinshasa Kongo-Kinshasa Guinea Kongo-Kinshasa 21 45 57 75 224 85 29 10 186 14 10835 49 83 83 72 45 42 74 Det pågående utbrottet i Västafrika bekräftades i mars 2014, med det spårades till ett ursprung i Guinea december 2013 (Baize m.fl. 2014). Viruset spred sig snabbt till de angränsande länderna Liberia och Sierra Leone (Baize m.fl. 2014). Inget av länderna har än idag förklarats vara fritt från smitta. Den epidemiologiska utredning som inleddes under utbrottet kan statuera exempel avseende svårigheterna med att spåra utbrott och bekräfta deras källor. Marí Saéz m.fl. (2015) intervjuade i april 2014 invånarna i byn Meliandou i södra Guinea, nära gränsen mot Liberia, där utbrottets indexfall, en tvåårig pojke bodde med sin familj. De sökte en förklaring till hur viruset smittade från djurriket och undersökte byn och dess invånare på jakt efter en misstänkt. Jakt och konsumtion av ”bushmeat”, kött från vilda djur som ofta misstänks ligga bakom smitta, var ovanligt i byn. Barnen i byn lekte ofta i en ihålig trädstam i anslutning till en stig som användes av byns kvinnor i syfte att ta sig till floden för att tvätta. Trädstammen hade fattat eld mars 2014 då invånarna i byn såg hur ett ”regn av fladdermöss” strömmade ur den. Marí Saéz m.fl. (2015) identifierade med hjälp av aska arten som Mops condylurus, en insektsätande fladdermus som har misstänkts, men inte bevisats, bära ebolavirus (WHO 1978a). Skulle barnens oskyldiga lek ligga bakom ett utbrott av sådan storleksordning finns enligt mig ingen tid att förlora vad gäller att hitta ebolavirus i naturen. Sudanvirus Sudanvirus har efter Ebolavirus (EBOV) orsakat flest utbrott av ebolafeber, dessa har dock en lägre dödlighet och en mer östlig förekomst. Samtliga utbrott orsakade av Sudanvirus hos människor sammanfattas i Tabell 2. Tabell 2. Samtliga utbrott orsakade av SUDV hos människor. För utbrotten i Uganda 2012 är dödsfall respektive dödlighet sammanslagna, här visat som streckade över och under, detta då det är svårt att avgöra vilket utbrott en smitta och eventuellt dödsfall hör till. Ytterligare information om utbrotten sammanfattas i Appendix. År 1976 1979 2000 2004 Land Bekräftade dödsfall Dödlighet (%) (Syd)sudan 151 53 (Syd)sudan 34 65 Uganda 224 53 (Syd)sudan 7 41 6 2011 2012 2012 Uganda Uganda Uganda 1 100 17 71 Taïskogsvirus En ny typ av ebolavirus, Taïskogsvirus, upptäcktes 1994 då en forskare blev smittad efter en obduktion av en vild schimpans i Elfenbenskustens regnskog, hon insjuknade men överlevde (Le Guenno m.fl. 1995). Bundigbuyovirus År 2007 upptäcktes Bundigbuyovirus i Uganda där det låg bakom ett utbrott av ebolafeber med den lägsta dödligheten någonsin där 37 avled (25%) (Towner m.fl. 2008). I det senaste utbrottet orsakat av ett Bundigbuyovirus smittades 52 i Kongo-Kinshasa 2012 varav 25 avled (48%) (WHO 2012b). Utbrott hos andra människoapor Taïskogsvirus upptäcktes genom att det smittade från en grupp schimpanser som drabbats av ett ebolautbrott (Le Guenno m.fl. 1995). På detta vis upptäcktes det första utbrottet av ett ebolavirus hos andra än människan (Formenty m.fl. 1999). Ebolavirusen är ett hot mot andra människoapors fortlevnad. Under åren 1998 till 2000 observerade Huijbregts m.fl. (2003) en kraftig minskning av antalet schimpanser och gorillor jämfört med tidigare undersökningar i nordöstra Gabon. Med försiktighet uppskattade Walsh m.fl. (2003) att populationerna halverats i storlek mellan 1983 och 2000. Schimpanser och gorillor som avlidit till följd av ebolafeber upptäcktes i samband med utbrotten hos människor i området 1994 och 1996 (Georges-Courbot m.fl. 1997). Ebolavirus misstänktes därför ligga bakom minskningen (Huijbregts m.fl. 2003). Misstanken förstärktes genom den uppsjö av utbrott hos människor, från 2001 till 2003, som ägde rum i Gabon och Kongo-Brazzaville. I varje enskilt utbrott kunde den ursprungliga smittan spåras till en kontakt med ett avlidet djur, kadaver av människoapor låg bakom sex av tio smittor (Leroy m.fl. 2004a). Förutom utbrottet av Taïskogsvirus hos schimpanser 1994 har Ebolavirus (EBOV) legat bakom samtliga utbrott hos andra människoapor. Det senaste fyndet av ebolasmittade kadaver av människoapor var två gorillor som dog i samband med utbrottet i Kongo-Brazzaville 2005. Utbrott hos vilda populationer kan dock vara svåra att upptäcka, mörkertalet kan vara högt. Den förödande effekt Ebolavirus har på populationer av människoapor (Bermejo m.fl. 2006) försvåras av det utdragna förlopp en populations återhämtning från ett utbrott kan ha. Genton m.fl. (2012) fann att en population gorillor som kraftigt decimerats av ebolafeber fortfarande hade en lång väg tillbaka till tidigare storlek, sex år senare. 7 Figur 2. Karta över ebolavirus utbrottshistorik, 1976 till 2014. Övre kartan klassificerar utbrotten enligt drabbad art, tillhörande närbild ger högre upplösning i tid och plats för området. Undre kartan klassificerar utbrotten efter virusart. Samtliga utbrott i Gabon och Kongo-Brazzaville orsakades av EBOV. Reservoarer – jakten på utbrottens källa Under utbrotten i nuvarande Kongo-Kinshasa och Sydsudan 1976 inleddes ett sökande efter spridare av ebolavirus i naturen som pågår än idag. För att undersöka de bakomliggande orsakerna till utbrotten har forskare använt sig av metoderna immunofluorescens och ELISA som kan påvisa smitta hos djur och människor (WHO 1978a, WHO 1978b, Breman m.fl. 1999, Leroy m.fl. 2004b). De båda är serologiska tester, med hjälp av vilka antikroppar för smittoämnets antigen söks. Med andra ord testas om ett djur eller människa har varit i kontakt 8 med ett ebolavirus. När en sådan kontakt kan påvisas kallas det seroprevalens i individen. I nästan alla serologiska tester har forskare sökt efter antikroppar mot specifikt Ebolavirus (EBOV), medlemmar av de andra arterna antas också kunna upptäckas till viss del med denna metod. Att testa seroprevalens kan vara enkelt, men att tolka resultaten är svårt. Den vanligaste tolkningen är att en individ med seroprevalens har varit infekterad av ett ebolavirus någon gång under dess liv. Det räcker inte för att påstå att en art är reservoar för ebolavirus, i bästa fall tyder det endast på kontakt med reservoaren. Det går inte heller att spåra utbrott genom seroprevalens, ett utbrott äger rum på en specifik tid och plats, men seroprevalens är inte tidsspecifik. Ett annat problem är att de tidigare testerna ofta gav falska positiva resultat där de felaktigt angav seroprevalens hos individer. Särskilt de tidiga testerna med immunofluorescens gav sådana resultat, utredare spekulerade därför felaktigt i att ebolafeber var en ovanlig konsekvens av infektion (Heymann m.fl. 1980). Bättre kontroller och metoder i senare artiklars metoder ger mig en ökad tilltro till dem. För att bevisa en pågående infektion måste ett ebolavirus identifieras i en värd. Att från ett värdprov artbestämma arvsmassa tillhörande ett ebolavirus är ett gott bevis (Leroy m.fl. 2005). Mängden arvsmassa från virus i värdens vävnader är mycket litet, för att upptäckas måste mängden ökas med hjälp av en polymeraskedjereaktion (PCR). Därefter kan den genetiska koden avläsas och jämföras med kända arvsmassor från ebolavirus, är de tillräckligt lika tyder det på en pågående infektion i värden. Eventuell virusevolution kan dock tänkas vara en felkälla för denna metod då ett virus arvsmassa kan förändras bortom igenkänning. Människoapor som förstärkare Utbrott av ebolafeber i människoapor är en katastrof i sin egen rätt, kampen mot ebolavirus kan inte bara föras å vår egen arts vägnar. Men många gånger har dessa utbrott övergått till utbrott hos människor. Hur ebolavirus smittar och sprids bland människoapor måste därför studeras inte bara ur deras perspektiv, utan även ur vårt. Vilken roll har egentligen människoapor i de utbrott av ebolafeber som drabbar människor? För att en art ska vara reservoar för ebolavirus måste detta virus kunna finnas endemiskt hos en population (Rt = 1). Boots m.fl. (2004) visade med en modell att ett virus optimala strategi för att långsiktigt överleva i en population är att antingen vara extremt dödligt eller inte dödligt alls. En serologisk undersökning på primater i delar av Västafrika från 1985 till 2000 visade att schimpanser har en ständig kontakt med ebolavirus (Leroy m.fl. 2004b). Att avfärda människoapor som del av reservoarerna för ebolavirus, som så många studier har gjort, kan därför vara felaktigt. Eftersom en reservoar kan vara ett system av flera värdarter (Ashford 2003) kan det inte uteslutas att människoapor spelar en roll i det. Att utbrott slår så hårt mot så pass välbevakade arter som människoapor talar dock enligt mig för att de konstanta kedjor av utbrott som skulle krävas för endemi hos dem skulle upptäckas. Jag anser dessutom att det krävs fler värdarter för att förklara att flera utbrott hos människor har ägt rum utanför människoapornas utbredning eller utan någon bevisad kontakt med dem. Leroy m.fl. (2004a) visade att schimpanser och västliga gorillor åtminstone hade en förstärkande funktion då de låg bakom sex utbrott av ebolafeber i Gabon och KongoBrazzaville från 2001 till 2003. Utbrottens indexfall visades ha varit i kontakt med kadaver som bar på Ebolavirus. Dessa Ebolavirus var alla olika varandra, enligt Leroy m.fl. (2004a) tyder det på att dessa apor själva varit del av olika utbrott och att smittoöverföring inom arten är ovanligt. 9 Spridning till och från människoapor Från en smittad gorilla eller schimpans kan smittan spridas till människor via olika vägar. Under utbrottet av Taïskogsvirus hos schimpanser 1994 smittade ofta mödrar sina nyfödda (Formenty m.fl. 1999). Under ett utbrott av Ebolavirus hos gorillor 2004 var risken att smittas större för de gorillor som levde i sociala grupper (Caillaud m.fl. 2006). Walsh m.fl. (2007) visade att vissa sociala grupper av gorillor ofta rör sig och äter i områden som delas dels med andra gorillor, men även med schimpanser. I dessa sociala grupper identifierades flera olika beteenden med vilka smitta riskerade överföras. Till exempel kan flera individer i följd äta på samma bit mat, både schimpanser och gorillor kan äta i samma träd samtidigt och avföring kan landa på mat längre ner i trädet. Eventuellt kan ebolavirus på dessa vis smitta både inom arterna samt mellan dem. Människor har smittats av schimpanser och gorillor med ebolavirus. Detta har oftast skett i samband med att de samlat och ätit kött från kadaver, men även när barn lekt med dem (Georges m.fl. 1999, Leroy m.fl. 2004a). Hur indexfallen för utbrott hos schimpanser och gorillor smittats är okänt, men de schimpanser som åt apor (släktet Procolobus) löpte större risk att smittas under utbrottet 1994 (Formenty m.fl. 1999). Vi vet fortfarande för lite om spridningen till och mellan dessa hotade arter för att kunna förhindra och bekämpa utbrott hos dem. Fladdermöss som reservoar Det första utbrottet av ett ebolavirus, i nuvarande Sydsudan 1976, spårades till en bomullsfabrik. Utredare hittade gott om råttor i fabriken men även fladdermöss av arten Mops trevori (WHO 1978a). Inga tecken på infektion hittades med hjälp av serologiska tester på de båda arterna (Breman m.fl. 1999), men misstankarna riktades tidigt mot fladdermöss som naturlig reservoar. De expeditioner som sökte efter bärare av ebolavirus i naturen testade flera arter av fladdermöss för seroprevalens, ingen testades positivt (Breman m.fl. 1999, Leirs m.fl. 1999). Belägg för fladdermöss som reservoar Misstanken mot fladdermöss förstärktes när Swanepoel m.fl. (1996) med avsikt smittade en varierad samling arter med Ebolavirus. Bland annat leddjur, däggdjur, fåglar och växter fanns representerade. I tre arter av fladdermöss kunde viruset smitta, föröka sig och följa med i avföring, allt utan att orsaka sjukdom hos sin värd. Hayman m.fl. (2010) kunde senare visa att en fladdermus levde över ett år efter att den testats positivt för seroprevalens för Ebolavirus. Att inte göra sin värd sjuk är en bra strategi för ett virus fortlevnad (Boots m.fl. 2004) och därför ett tecken på att värden kan vara en naturlig reservoar. Inte förrän Leroy m.fl. (2005) letade efter tecken på kontakt med ebolavirus under utbrotten i Gabon och Kongo-Brazzaville (2001-2003) kunde misstankarna mot fladdermöss bekräftas. Både seroprevalens och arvsmassa från Ebolavirus (EBOV) bekräftades hos tre arter av flyghundar (Pteropodidae), fruktätande fladdermöss, Hypsignathus monstrosus, Epomops franqueti och Myonycteris torquata. Dessa arter är än idag de enda, förutom människoapor, som visat sig bära på Ebolavirus i naturen. Huruvida dessa arter är tillräckliga reservoarer på egen hand eller om Ebolavirus cirkulerar mellan dem är okänt, provtagningarna skedde med flera års mellanrum. Studien fann att ingen av de individer som bar på arvsmassa samtidigt bar på antikroppar, och vice versa. Möjligen hade inte immunförsvaret hunnit utveckla antikroppar i de individer som bar på Ebolavirus (Leroy m.fl. 2005). Fler arter av flyghundar 10 samt en fladdermus i släktet Mops har sedan dess visat seroprevalens för Ebolavirus (Pourrut m.fl. 2009). De fladdermöss som hittades i samband med utbrottet i Sudan 1976 tillhörde också släktet Mops (Hayman m.fl. 2012). De belägg som finns för fladdermössens centrala roll i spridningen av Ebolavirus (EBOV) rättfärdigar en djupdykning i deras ekologi och utbredning, varifrån vi kan dra lärdomar om risker där människor och fladdermöss möts. Fladdermöss ekologi och utbredning Många zoonoser har en bevisad reservoar i fladdermöss, bland annat Lyssavirus, som orsakar rabies, och Nipahvirus (Freuling m.fl. 2011, Rahman m.fl. 2012). Hur fladdermöss sprider dessa virus kan ge en fingervisning om hur de sprider Ebolavirus och vilka aspekter av deras ekologi som har en betydelse. På grund av de många misslyckandena med att hitta Ebolavirus i naturen blir dessa analogier än mer relevanta. Rahman m.fl. (2012) fann en koppling mellan ett utbrott av Nipahvirus i Bangladesh och drickandet av sav från dadelpalm. Flyghundar, en känd reservoar för Nipahvirus, sågs ofta i de dadelpalmer som saven samlats från. Seltzer m.fl. (2013) fann att flyghundar åt av fikonträd och spred dess frön. Fikonträd är även matplatser för både gorillor och schimpanser. De har som tidigare beskrivits, till och med setts i träden samtidigt (Walsh m.fl. 2007). Denna kontakt mellan apor och fladdermöss kan ligga bakom utbrott hos aporna på samma sätt som en liknande kontakt låg bakom utbrottet av Nipahvirus hos människor i Bangladesh. Att förstå hur Ebolavirus (EBOV) sprids inom olika arter av fladdermöss är viktigt för att kunna förutse när och var risken för utbrott hos människoapor är som störst. Amman m.fl. (2012) visade att ovan beskrivna Marburgvirus, har en cyklisk förekomst i en art av flyghund som förmodas fungera som reservoar. Förekomsten av smitta följer parningssäsongerna, två per år, och når sin kulmen fyra till sju månader efter att ungarna föds. Under ungarnas första halvår i livet smittas de i en med tiden ökande utsträckning. Studien fann ett samband mellan tiden för flyghundarnas två parningssäsonger och tiden för utbrott av Marburgvirus. Rousettus aegyptiacus, arten som studerades, har även uppvisat seroprevalens för Ebolavirus (Pourrut m.fl. 2009). Just två parningssäsonger per år, en vanlig strategi hos flyghundar, visades av Hayman (2015) vara en överrepresenterad strategi bland de fladdermöss som har funnits vara seropositiva för Ebolavirus (EBOV). Exempelvis har de tre bevisade bärarna av Ebolavirus, H. monstrosus, E. franqueti och M. torquata två parningssäsonger per år (Pourrut m.fl. 2007). Hayman ger stöd till hypotesen att fladdermössens benägenhet att vara reservoar för Ebolavirus avgörs av deras ekologi snarare än hur viruset infekterar dem. Experimentet av Swanepoel m.fl. (1996) visade att även andra fladdermöss än flyghundar kan bära och öka mängden Ebolavirus. Flyghundar verkar dock vara överrepresenterade bland fladdermöss som misstänkta reservoarer för Ebolavirus, fastän de bara utgör ca 15% av antalet fladdermusarter. Enligt Hayman var de flesta fladdermusarter med två synkroniserade parningssäsonger per år flyghundar, vilket stämmer överens med den ekologiska hypotesen. Jag anser det vara rimligt att fokusera vidare sökande på de arter som följer denna parningsstrategi, samt ta hänsyn till när förekomst av smitta kan förväntas vara som störst. De flyghundsarter som av Leroy m.fl. (2005) visades bära Ebolavirus har en utbredning som stämmer väl överens med geografin för utbrott hos de tre människoaporna, inklusive 11 människan (Figur 3). Både H. monstrosus och M. torquata täcker de flesta utbrotten väl på egen hand. Det enda utbrott som inte täcks av någon arts kända utbredning är det i Uganda år 2000. Detta utbrott hade sin början på en begravning men ett indexfall identifierades aldrig, därför identifierades inte heller smittovägen från naturen (Okware m.fl. 2002). Figur 3. Utbredningar för de tre förmodade reservoararterna enligt Leroy m.fl. (2005), E. franqueti, H. monstrosus och M. torquata med samtliga utbrott hos människoapor. Utbredningar erhållna från IUCN (2008a, 2008b, 2008c). Människor och fladdermöss Om nu fladdermöss är reservoarer för Ebolavirus, hur kan vi förklara att utbrott hos människor sker? Det pågående utbrottet i Västafrika samt utbrotten i Kongo-Kinshasa 2007 och 2014 har spårats till människornas kontakt med fladdermöss (Leroy m.fl. 2009, Marí Saéz m.fl. 2015). Utbrottet av ett Ebolavirus i Kongo-Kinshasa 2007 började en kort tid efter en migration av många arter av flyghundar. Stora mängder flyghundar jagades och åts när de passerade området för utbrottet, och en koppling hittades mellan indexfallet och en man som köpt skjutna och blodiga flyghundar. Två av de arter som av Leroy m.fl. (2005) visats bära Ebolavirus observerades i migrationen (Leroy m.fl. 2009). Utbrottet i Kongo-Kinshasa 2014 spårades också till ätande av kött från vilda djur. Vilket djur det gällde angavs inte i undersökningen (Maganga m.fl. 2014). Fladdermöss jagas för sitt kött i stora delar av Ekvatoriella Afrika. Flyghunden Eilodon helvum har visats vara seroprevalent för Ebolavirus och jagas i stor utsträckning, de bevisat infekterade H. monstrosus och E. franqueti jagas i mindre utsträckning (Mickleburgh m.fl. 2009, Hayman m.fl. 2010). Undersökningen av Leroy m.fl. (2009) visade dock att de flyghundar som såldes och åts var de som gick att få tag på, jakten på de migrerande fladdermössen var urskillningslös. Andra möjliga reservoarer Studien av Leroy m.fl. (2005) citeras ofta som ett bevis för att fladdermöss är en reservoar för ebolavirus, men många frågetecken kvarstår. Både experimentet av Swanepoel m.fl. (1996) och testerna av Leroy m.fl. (2005) använde sig av Ebolavirus, inga av de andra sjukdomsorsakande typerna (SUDV, BDBV och TAFV) har påvisats i annat än 12 människoapor. De olika arterna inom släktet Ebolavirus är genetiskt olika och ger olika sjukdomsförlopp (Feldmann & Geisbert 2011, Carroll m.fl. 2013), det är därför osäkert om vi kan generalisera slutsatser om reservoarer för alla medlemmar i släktet. Dessutom har resultatet från Leroy m.fl. (2005) ännu inte reproducerats, tio år senare. Fastän misstankar mot fladdermöss är rättfärdigade, anser jag att vi måste lyfta blicken och förbli vaksamma på fler rörliga delar i värdsystemet för samtliga ebolavirus. Många arter av bland annat leddjur, fåglar och däggdjur har hamnat under luppen hos de utredare som sökt efter ebolavirus i naturen, dock så har det lyst med sin frånvaro hos andra än fladdermöss. Morvan m.fl. (1999) hittade spår av RNA från Ebolavirus (EBOV) i flera arter av gnagare men kunde inte påvisa pågående infektion i någon av dem. Inte heller fann de antikroppar mot Ebolavirus. Experimentet av Swanepoel m.fl. (1996) där arter infekterades avsiktligt med Ebolavirus citeras ofta som ett argument mot andra djurgruppers roll som reservoar. Dock så testades väldigt få representanter per grupp, då en mycket stor mångfald utelämnades anser jag argumentet vara tunt. Hur ebolavirus sprids Går det att se ett mönster i var och när utbrott har ägt rum hos människoapor, och vad kan det i så fall säga oss om vart nästa kan ske? Utifrån geografiska mönster för utbrotten och släktskapet bland de virus som ligger bakom dem har i huvudsak två hypoteser formulerats för hur ebolavirus sprids. Återigen är det Ebolavirus (EBOV) som har fått stå i centrum för forskningen. Den ena hypotesen antyder att Ebolavirus ständigt finns i sin naturliga reservoar och att utbrott äger rum vid den ovanliga händelsen att människoapor kommer i kontakt med reservoaren (Leroy m.fl. 2004a). Den andra hypotesen riktar blicken mot ett mönster, både geografiskt och genetiskt, som tyder på att en särskild stam av Ebolavirus (EBOV) sprider sig som en våg med jämn hastighet (Walsh m.fl. 2005). Dessa hypoteser är enligt mig inte oförenliga, men ställs ändå ibland felaktigt mot varandra. Även tillsammans har de dock svårt att förklara samtliga utbrott av Ebolavirus. Jag kommer ändå att utgå ifrån hypoteserna för att förklara de mönster de beskriver och utvärdera dem i ljuset av utbrott som ägt rum efter att hypoteserna beskrevs. Eftersom människor, gorillor och schimpanser drabbas likartat av ebolavirus och fler utbrott ger en högre upplösning på spridningsmönster, kommer jag att slå samman utbrotten för alla tre arter och utvärdera dem tillsammans. Ebolavirus har en ständig reservoar Serologiska tester på människor och schimpanser i bland annat Gabon och Kongo-Brazzaville visade att båda arterna verkar ha varit i kontakt med ebolavirus innan det först bröt ut hos människor, samt under de 15 år då inga utbrott rapporterades (Gonzalez m.fl. 2005). Seroprevalens påvisades dessutom i länder som än idag är förskonade från utbrott av ebolafeber, såsom Centralafrikanska republiken (Gonzalez m.fl. 2005). Dessa resultat antydde att ebolavirus ständigt cirkulerade i Gabon och Kongo-Brazzaville, två länder som upplevt flera samtida utbrott. Leroy m.fl. (2004a) fann att de många utbrotten som drabbade människor, gorillor och schimpanser i länderna från år 2001 till år 2003 orsakades av olika smittor av genetiskt olika Ebolavirus. Olikheterna mellan dessa virus arvsmassor var stora jämfört med 13 förändringstakten som observerades i arvsmassan hos det Ebolavirus som låg bakom utbrottet i Kongo-Kinshasa 1995 (Rodriguez m.fl. 1999). Det senare Ebolavirusets arvsmassa hade förändrats mycket lite under de smittor det orsakade under utbrottet (Rodriguez m.fl. 1999). Utifrån den höga graden av seroprevalens och de olika Ebolavirus som orsakade parallella utbrott gavs stöd till hypotesen om att Ebolavirus har en ständig reservoar i området. Slutsatsen av Leroy m.fl. (2004a) var att många olika typer av Ebolavirus cirkulerade i naturen i dessa länder, och att utbrott sällan äger rum eftersom kontakt mellan människoapor och reservoaren är ovanligt. Ebolavirus sprids som en våg Walsh m.fl. (2005) fann mönster, både geografiska och genetiska, i var och när utbrott orsakade av Ebolavirus (EBOV) uppstått sedan dess upptäckt i Kongo-Kinshasa 1976. Efterföljande utbrott verkade följa en sydvästlig riktning med en konstant hastighet, tills utbrottet 1996 i Booué, Gabon, varpå utbrotten rörde sig österut. Samtliga utbrott orsakade av Ebolavirus hos människor som ägt rum innan studien gjordes passade in i det geografiska mönstret, vilket lade grunden till hypotesen att Ebolavirus sprids som en våg (Walsh m.fl. 2005), jag kallar den våghypotesen. Dessutom tydde släktskapet mellan dessa Ebolavirus på att varje utbrott hade sitt ursprung i det föregående (Walsh m.fl. 2005). Alla Ebolavirus hade alltså sitt ursprung i en enda stam med en gemensam förfader nära det första utbrottet 1976, vilket gav stöd åt våghypotesen (Walsh m.fl. 2005). Walsh m.fl. (2005) såg de många utbrotten i Gabon och Kongo-Brazzaville från 2001 till 2003 som del av den östliga fronten för vågen. Detta stod i kontrast mot slutsatsen av Leroy m.fl. (2004a) som ansåg de genetiska olikheterna för stora för att koppla samman virusen bakom dessa utbrott. Walsh m.fl (2005) påstod att Ebolavirusens genetiska olikheter och den observerat låga genetiska förändringstakten (Rodriguez m.fl. 1999) inte sade emot en våglik spridning av en enda virusstam. De ansåg att antalet smittosteg från en människa till en annan i utbrottet där förändringstakten studerades var för få och därmed inte gick att dra slutsatser från, vilket var vad Leroy m.fl. (2004a) gjorde. Förändringstakten som krävdes för att de observerade olikheterna och en våglik spridning skulle sammanfalla stämde egentligen väl överens med förändringstakten för andra RNA-virus (Walsh m.fl. 2005). Det geografiska mönster våghypotesen utgår ifrån visas i Figur 4 tillsammans med nyare utbrott och utbrott hos andra människoapor. Våghypotesen och fladdermöss En senare studie av Biek m.fl. (2006) fann att de Ebolavirus (EBOV) som hittades i H. monstrosus, E. franqueti och M. torquata, de arter av flyghundar som av Leroy m.fl. (2005) bekräftades bära virus, hade en gemensam förfader så sent som 1999. Detta var precis vad Walsh m.fl. (2005) fann för de Ebolavirus som låg bakom utbrotten de studerat mellan 2001 och 2003. Resultaten väckte frågor. Var infektionen i dessa flyghundar en ny företeelse, och vilken var i så fall reservoaren för Ebolavirus innan 1999? Biek m.fl. (2006) föreslog tre förklaringar till dessa motstridiga resultat. En möjlig förklaring var i linje med Walsh m.fl. (2005) våghypotes. Dessa Ebolavirus hade en så pass sen gemensam förfader eftersom ett mycket litet antal virus låg bakom koloniseringen av området vid vågens front (Biek m.fl. 2006). Av samma anledning är afrikanska folkslag de genetiskt mest diversa i världen, andra folkslag har sitt ursprung i ett fåtal kolonisatörer som utvandrat ur Afrika. 14 En annan möjlig förklaring var att Ebolavirus har en fluktuerande men ständig närvaro i dessa tre arter, med toppar och dalar gällande antal infekterade individer (Biek m.fl. 2006). Dalarna kunde orsaka så kallade genetiska flaskhalsar där mycket få virus ligger bakom efterföljande återhämtningar och toppar. Den gemensamma förfadern bör då kunna hittas i den senaste av dessa flaskhalsar, i detta fall runt år 1999 (Biek m.fl. 2006). Seroprevalens hos de tre arterna är ovanligt under utbrott (ca 5-7%) och än mer ovanligt efter utbrott (ca 1%), därmed kan flaskhalsar uppstå mellan utbrott, vilket talar för denna förklaring (Pourrut m.fl. 2007). Möjligen är resultatet ett argument för att reservoaren utgörs av fler arter än dessa flyghundar, och att flyghundarna själva smittats av en enda virusstam från denna reservoar inte långt innan utbrotten hos människor 2001 till 2003 (Biek m.fl. 2006). Vad säger nyare utbrott oss? Våghypotesen förklarade mönstret väl i de utbrott som studien innefattade. Senare studier som innefattat fler och nyare utbrott gjorde det dock tydligt att den inte erbjöd tillräcklig förklaring. Wittmann m.fl. (2007) tog, förutom utbrotten i studien av Walsh m.fl. (2005), även med utbrott hos gorillor och schimpanser i beräkningen, samt ytterligare ett par utbrott hos människor som ägde rum mellan 2001 och 2005 i Gabon och Kongo-Brazzaville (Wittmann m.fl. 2007). Vad de fann var Ebolavirus (EBOV) som bildade en egen välavgränsad grupp utanför den stam som Walsh m.fl. (2005) påstod låg bakom dittills samtliga utbrott orsakade av Ebolavirus. Geografiskt stämde de nya utbrotten in väl på mönstret Walsh m.fl. (2005) förutsåg, men genetiskt krävdes en annan förklaring. Ebolavirusen i den nya gruppen hade en gemensam förfader år 1998, tillsammans med virusstammen från våghypotesen hade de en gemensam förfader år 1975 (Wittmann m.fl. 2007). Alltså måste dessa två virusstammar ha spridit sig sydväst, oberoende av varandra, i ungefär samma takt. De Ebolavirus (EBOV) som låg bakom utbrotten i Kongo-Kinshasa 2007 och 2008 var inte heller del av virusstammen som antogs orsakat de utbrott som förklarades med våghypotesen, deras relativa positioner inom Ebolavirusens släktträd var dock tvetydiga (Grard m.fl. 2011). Utbrotten följde inte heller det geografiska mönstret i Walsh m.fl. (2005) våghypotes, den östliga riktningen stämde någorlunda men spridningstakten var dubbelt så hög. Utbrottet av Ebolavirus i Kongo-Kinshasa 2014 orsakades av ett Ebolavirus som faller inom virusstammen från våghypotesen (Maganga m.fl. 2014). Detta virus jämfördes dock inte med tillräckligt många av stammens medlemmar för att kunna bedöma om det stämmer överens med våghypotesens genetiska mönster. Geografiskt stämmer det mycket väl överens med våghypotesen, både i riktning och spridningstakt. Det pågående utbrottet i Västafrika är kraftigt avvikande från våghypotesen. Det äger rum långt ifrån alla tidigare utbrott, men det orsakande Ebolaviruset är del av virusstammen från våghypotesen (Dudas & Rambaut 2014). Ebolavirusets (EBOV) spridning har i ljuset av nyare utbrott visat sig vara mer komplicerad än vad våghypotesen beskriver. Även om våghypotesen förklarar de utbrott den baserades på, samt utbrottet i Kongo-Kinshasa 2014, har Ebolavirus bevisligen smittat människoapor oberoende av den våglika spridningen. Ingen av de båda hypoteserna, ständig reservoar eller våglik spridning, kan på egen hand beskriva spridningen av Ebolavirus. Vaksamhet bör iakttas på de risker våghypotesen förutser, men förklaringar måste även sökas till de utbrott som avvikit från den. 15 Figur 4. Walsh m.fl. (2005) våghypotes visad i sin ursprungliga form (övre kartan), och med senare utbrott samt utbrott hos andra människoapor inräknade (undre kartan). Miljön och årstiden påverkar risken för utbrott Reservoarerna för de olika ebolavirusen är dåligt kända, men genom att studera under vilka omständigheter som utbrott har ägt rum kan arbetet med att finna reservoarer förbigås och de förhållanden som ökar risken för utbrott hittas. Till exempel, en art som är del av reservoarens värdsystem kan ha specifika krav på sin levnadsmiljö, samt vara infekterad i större utsträckning vissa tider på året. Utan att identifiera arten kan när och var utbrott har skett lära oss att förstå vid vilka miljöer och tider risken för utbrott ökar. Perioder av torka verkar öka risken för utbrott Torrperioder är variabla runt ekvatorn i Afrika. De kan inträffa en eller två gånger per år och sammanfalla antingen med norra halvklotets vinter eller sommar, alternativt både och (Pourrut m.fl. 2007). Hos schimpanser och gorillor har perioder av hög dödlighet, där ebolavirus förmodas vara en orsak, inträffat under torrperioderna (observation av Pourrut m.fl. (2007)). Under dessa perioder har de tre arter av flyghundar som visats bära Ebolavirus sina två parningssäsonger (Pourrut m.fl. 2007). Dessa observationer kan kopplas samman eftersom seroprevalens för Marburgvirus hos en art av flyghund kulminerade fyra till sju månader efter parningssäsongen (Amman m.fl. 2012). Om fluktuationen i antal infekterade är densamma för Ebolavirus hos sin förmodade reservoar kan trenden hos gorillor och schimpanser förklaras. Det är också möjligt att kontakt mellan apor och fladdermöss under torrperioder ökar på grund av en större konkurrens om frukt dem emellan (Pourrut m.fl. 2007). 16 Klimat och växtlighet placerar fler länder i riskzonen Genom att studera i vilka miljöer utbrott har ägt rum hos människoapor tog Pigott m.fl. (2014) reda på vilka miljöfaktorer som visade ett samband med risken för utbrott. Bland annat vegetation, höjd över havet och temperatur visade på sådant samband, tillsammans stämde de väl överens med miljön i en typisk regnskog. Baserat på dessa resultat konstruerade de sedan en modell som visade vilka områden som var känsliga för smitta från naturen. Flera länder som undgått utbrott består av dessa områden, bland annat Nigeria, Tanzania och Madagaskar (Pigott m.fl. 2014). Denna typ av studie är dock gjord ad hoc, det vill säga att forskarna anpassat sin modell för att de tidigare utbrotten ska passa in. Baserat på så pass få utbrott blir det enligt mig svårt att täcka egentliga riskområden. Till exempel gjorde Peterson m.fl. (2004) en liknande studie som inte förutsåg platsen där det pågående utbrottet i Västafrika inleddes. Innan reservoarerna för samtliga ebolavirus är identifierade måste ändå beredskap finnas i de länder som enligt Pigott m.fl. (2014) riskerar utbrott. Diskussion Sökandet efter ebolavirus reservoarer har inte gett definitiva svar. Rollen som schimpanser och gorillor spelar i spridning av ebolavirus är fortfarande oklar, men det lutar åt att de som mest har en förstärkande funktion gentemot människan. Vad gäller ebolavirus i andra arter än människoapor är sökandet präglat av ett fokus på Ebolavirus (EBOV), inga direkta bevis gällande reservoarer finns för medlemmar av de andra arterna av virus i Afrika. Det finns många tecken på att flera arter av flyghundar ingår i reservoaren för Ebolavirus. Flera studier har sökt att förstå om det finns mönster i när och hur utbrott av Ebolavirus uppstår, med olika resultat. Beroende på vilken del av Ebolavirusens släktträd som studeras framträder olika mönster. En del av trädet verkar ha spridits som en våg sedan första utbrottet 1976. Inkluderas hela släktträdet blir dock inget mönster tydligt, att förutsäga var och när framtida utbrott kommer äga rum är därför svårt. Miljön och tiden på året påverkar var och när risken för utbrott av ebolavirus är som störst. Utbrott hos schimpanser och gorillor verkar sammanfalla med torrperioder, detta kan ha sin förklaring i en cyklisk frekvens av infektioner i flyghundar. Risken för utbrott av ett ebolavirus är störst i regnskogar och liknande miljöer. Snart 40 år senare – ebolavirus gäckar oss fortfarande Hur ebolavirus sprids är fortfarande en olöst gåta. De epidemiologiska, serologiska och experimentella undersökningar som gjorts misslyckas med att upptäcka trender som är tillräckligt generella för att möjliggöra förebyggande arbete. Nästan alla resultat från sökandet efter reservoarer har varit specifika för Ebolavirus (EBOV), om det går att generalisera resultaten för medlemmar av de andra arterna är oklart. Det måste testas i vilken utsträckning seroprevalens för andra typer av ebolavirus kan hittas när man testar för Ebolavirus. Serologiska undersökningar har varit fåtaliga de senaste tio åren, de senare av dem är dessutom endast fokuserade på fladdermöss (Pourrut m.fl. 2009). Med tanke på hur begränsad kunskapen om ebolavirus reservoarer är måste ett större nät kastas med avseende på de testade arternas mångfald. Få av de många tidigare undersökningarna gav tillfredsställande resultat, men fler arter måste testas, oftare, och på fler platser än vad som görs idag. Samtliga utbrott som upptäcks ökar kunskapen om spridningen av ebolavirus. Schimpanser och gorillor måste därför övervakas i större utsträckning för att i god tid upptäcka de utbrott 17 som drabbar dem. Dels kan detta leda till att indexfallen kan spåras och att det säkerställs på vilket sätt de blivit smittade, dels kan insatser för att skydda dessa hotade arter tillämpas tidigt. Senare forskning har blivit bättre på att inkludera utbrott hos samtliga människoapor (Wittmann m.fl. 2007, Pigott m.fl. 2014), men framtida studier måste använda sig av den ökade upplösning dessa utbrott ger. Vi har en lång väg kvar tills vi kan agera i förebyggande syfte snarare än reagera när ett utbrott redan skett. Det pågående utbrottet i Västafrika har väckt internationell uppmärksamhet och lär rikta både intresse och pengar till forskning på hur ebolavirus sprids. Dock bör inte vidare forskning endast utgå från omständigheterna till detta utbrott. Inte bara Ebolavirus och fladdermöss orsakar utbrott, forskningen bör förbli bred och omfattande till dess att vi förstår spridningen av samtliga ebolavirus. Tack Hildur för stödet och expertisen. Christer, Elisabeth, Janne, Jeff, Jennie och Jonas för läsningen och råden. Annie, Helena, Pauline och Sofia för återkoppling, samt Lage för handledning. Appendix Tabell 3. Samtliga rapporterade utbrott av ebolavirus med tillhörande information där den är given av referensen. Vissa koordinater erhållna från egen sökning utifrån angivna ortnamn. År 1976 1976 1977 1979 1994 1994 1994 1994 1995 1996 1996 1996 1996 1996 2000 2001 2001 2001 2001 2001 2001 2001 2001 Smittad art Människa Människa Människa Människa Människa Människa Människa Schimpans Människa Människa Människa Schimpans Schimpans Schimpans Människa Gorilla Gorilla Människa Människa Människa Människa Människa Människa Art av virus SUDV EBOV EBOV SUDV TAFV EBOV EBOV TAFV EBOV EBOV EBOV Ej angivet EBOV Ej angivet SUDV Ej angivet EBOV EBOV EBOV EBOV EBOV EBOV EBOV Longitud (°) Latitud (°) Referens 28,248631 4,633031 WHO 1978a 18,256756 0,045274 WHO 1978b 19,21263 2,92331 Heymann m.fl. 1980 28,248631 4,633031 Baron m.fl. 1983 -6,93944 5,69 Formenty m.fl. 1999 12,9833 1,4 Georges m.fl. 1999 12,9166 1,4833 Georges m.fl. 1999 -6,70732 5,587779 Formenty m.fl 1999 18,81619 -5,04098 Khan m.fl. 1999 13,1 1,1166 Georges m.fl. 1999 11,95 0,1 Georges m.fl. 1999 12,975781 1,089622 Lahm m.fl. 2007 11,57 -0,06 Georges-Courbot m.fl. 1997 11,807655 -0,449607 Lahm m.fl. 2007 32,4825 3,136944 Okware m.fl. 2002 14,2747 0,7055 Pourrut m.fl. 2005 14,333334 0,776611 Wittmann m.fl. 2007 13,966667 1,016667 Pourrut m.fl. 2005 14,349444 0,648611 Pourrut m.fl. 2005 14,310278 0,683333 Pourrut m.fl. 2005 15,024167 -1,058333 Pourrut m.fl. 2005 14,227778 0,124722 Pourrut m.fl. 2005 14,659167 -0,319444 Pourrut m.fl. 2005 18 2001 2001 2001 2002 2002 2002 2002 2002 2002 2002 2002 2002 2002 2003 2003 2003 2003 2004 2004 2005 2005 2007 2007 2008 2011 2012 2012 2012 2014 2014 Människa Schimpans Schimpans Gorilla Gorilla Gorilla Gorilla Gorilla Gorilla Människa Människa Schimpans Schimpans Gorilla Gorilla Människa Schimpans Gorilla Människa Gorilla Människa Människa Människa Människa Människa Människa Människa Människa Människa Människa EBOV Ej angivet EBOV Ej angivet Ej angivet Ej angivet Ej angivet Ej angivet Ej angivet EBOV EBOV Ej angivet Ej angivet Ej angivet Ej angivet EBOV EBOV EBOV SUDV EBOV EBOV EBOV BDBV EBOV SUDV SUDV BDBV SUDV EBOV EBOV 14,679167 13,950085 13,953973 14,4938 14,4839 14,165 14,2644 14,4852 14,4823 14,345278 15,6025 14,4885 14,374875 14,7029 14,5075 15,384444 14,554855 15,175833 28,38359 15,011233 14,838333 21,356667 30,116667 21,421667 32,49944 30,5042094 27,615833 32,49944 -10,061178 20,433333 0,494444 0,545851 0,718353 0,2395 0,2354 1,1669 0,731 0,2348 0,2346 -0,19 0,194444 0,2387 0,54194 0,6987 0,2987 -0,598333 0,289595 0,906333 4,57548 0,764972 0,891944 -5,168611 0,766667 -5,351944 0,83306 0,5614965 2,773889 0,83306 8,616067 -0,616667 Pourrut m.fl. 2005 Lahm m.fl. 2007 Leroy m.fl. 2002 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Pourrut m.fl. 2005 Pourrut m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Rouquet m.fl. 2005 Boumandouki m.fl. 2005 Wittmann m.fl. 2007 Wittmann m.fl. 2007 WHO 2004 Wittmann m.fl. 2007 Nkoghe m.fl. 2011 Leroy m.fl. 2009 Towner m.fl. 2008 Grard m.fl. 2011 Shoemaker m.fl. 2012 WHO, 2012b WHO, 2012a WHO, 2012b Baize m.fl. 2014 Maganga m.fl. 2014 Referenser Amman BR, Carroll SA, Reed ZD, Sealy TK, Balinandi S, Swanepoel R, Kemp A, Erickson BR, Comer JA, Campbell S, Cannon DL, Khristova ML, Atimnedi P, Paddock CD, Kent Crockett RJ, Flietstra TD, Warfield KL, Unfer R, Katongole-Mbidde E, Downing R, Tappero JW, Zaki SR, Rollin PE, Ksiazek TG, Nichol ST, Towner JS. 2012. Seasonal pulses of marburg virus circulation in juvenile Rousettus aegyptiacus bats coincide with periods of increased risk of human infection. PLoS Pathogens 8: e1002877. Ashford RW. 2003. When is a reservoir not a reservoir? Emerging Infectious Diseases 9: 1495–1496. Baize S, Pannetier D, Oestereich L, Rieger T, Koivogui L, Magassouba N, Soropogui B, Sow MS, Keïta S, De Clerck H, Tiffany A, Dominguez G, Loua M, Traoré A, Kolié M, Malano ER, Heleze E, Bocquin A, Mély S, Raoul H, Caro V, Cadar D, Gabriel M, Pahlmann M, Tappe D, Schmidt-Chanasit J, Impouma B, Diallo AK, Formenty P, Van Herp M, Günther S. 2014. Emergence of Zaire Ebola virus disease in Guinea. The New England Journal of Medicine 371: 1418–1425. 19 Baron RC, McCormick JB, Zubeir OA. 1983. Ebola virus disease in southern Sudan: hospital dissemination and intrafamilial spread. Bulletin of the World Health Organization 61: 997– 1003. Beeching NJ, Fenech M, Houlihan CF. 2014. Ebola virus disease. BMJ 349: g7348. Beer B, Kurth R, Bukreyev A. 1999. Characteristics of Filoviridae: Marburg and Ebola Viruses. Naturwissenschaften 86: 8–17. Bermejo M, Rodríguez-Teijeiro JD, Illera G, Barroso A, Vilà C, Walsh PD. 2006. Ebola outbreak killed 5000 gorillas. ScienceNew Series 314: 1564. Biek R, Walsh PD, Leroy EM, Real LA. 2006. Recent common ancestry of Ebola Zaire virus found in a bat reservoir. PLoS Pathogens, doi 10.1371/journal.ppat.0020090. Boots M, Hudson PJ, Sasaki A. 2004. Large shifts in pathogen virulence relate to host population structure. ScienceNew Series 303: 842–844. Boumandouki P, Formenty P, Epelboin A, Campbell P, Atsangandoko C, Allarangar Y, Leroy EM, Kone ML, Molamou A, Dinga-Longa O, Salemo A, Kounkou RY, Mombouli V, Ibara JR, Gaturuku P, Nkunku S, Lucht A, Feldmann H. 2005. Clinical management of patients and deceased during the Ebola outbreak from October to December 2003 in Republic of Congo. Bulletin De La Société De Pathologie Exotique (1990) 98: 218–223. Breman JG, Johnson KM, Groen G van der, Robbins CB, Szczeniowski MV, Ruti K, Webb PA, Meier F, Heymann DL, Teams EVS. 1999. A search for Ebola Virus in animals in the Democratic Republic of the Congo and Cameroon: Ecologic, virologic, and serologic surveys, 1979–1980. Journal of Infectious Diseases 179: 139–147. Caillaud D, Levréro F, Cristescu R, Gatti S, Dewas M, Douadi M, Gautier-Hion A, Raymond M, Ménard N. 2006. Gorilla susceptibility to Ebola virus: The cost of sociality. Current Biology 16: 489–491. Carroll SA, Towner JS, Sealy TK, McMullan LK, Khristova ML, Burt FJ, Swanepoel R, Rollin PE, Nichol ST. 2013. Molecular evolution of viruses of the family Filoviridae based on 97 whole-genome sequences. Journal of Virology 87: 2608–2616. Chua KB. 2003. Nipah virus outbreak in Malaysia. Journal of Clinical Virology: The Official Publication of the Pan American Society for Clinical Virology 26: 265–275. Dowell SF, Mukunu R, Ksiazek TG, Khan AS, Rollin PE, Peters CJ, Commission de Lutte contre les Epidémics à Kikwit. 1999. Transmission of Ebola hemorrhagic fever: A study of risk factors in family members, Kikwit, Democratic Republic of the Congo, 1995. The Journal of Infectious Diseases 179: 87–91. Dudas G, Rambaut A. 2014. Phylogenetic analysis of Guinea 2014 EBOV Ebolavirus outbreak. PLoS Currents, doi 10.1371/currents.outbreaks.84eefe5ce43ec9dc0bf0670f7b8b417d. Epstein JH, Field HE, Luby S, Pulliam JRC, Daszak P. 2006. Nipah virus: Impact, origins, and causes of emergence. Current Infectious Disease Reports 8: 59–65. Feldmann H, Geisbert TW. 2011. Ebola haemorrhagic fever. The Lancet 377: 849–862. Formenty P, Boesch C, Wyers M, Steiner C, Donati F, Dind F, Walker F, Guenno BL. 1999. Ebola virus outbreak among wild chimpanzees living in a rain forest of Côte d’Ivoire. The Journal of Infectious Diseases 179: 120–126. Genton C, Cristescu R, Gatti S, Levréro F, Bigot E, Caillaud D, Pierre J-S, Ménard N. 2012. Recovery potential of a western lowland gorilla population following a major Ebola outbreak: results from a ten year study. PLoS One 7: e37106. Georges A-J, Leroy EM, Renaut AA, Benissan CT, Nabias RJ, Ngoc MT, Obiang PI, Lepage JPM, Bertherat EJ, Bénoni DD, Wickings EJ, Amblard JP, Lansoud-Soukate JM, Milleliri JM, Baize S, Georges-Courbot M-C. 1999. Ebola hemorrhagic fever outbreaks in Gabon, 1994-1997: Epidemiologic and health control issues. The Journal of Infectious Diseases 179: 65–75. 20 Georges-Courbot MC, Sanchez A, Lu CY, Baize S, Leroy E, Lansout-Soukate J, TéviBénissan C, Georges AJ, Trappier SG, Zaki SR, Swanepoel R, Leman PA, Rollin PE, Peters CJ, Nichol ST, Ksiazek TG. 1997. Isolation and phylogenetic characterization of Ebola viruses causing different outbreaks in Gabon. Emerging Infectious Diseases 3: 59– 62. Gonzalez JP, Herbreteau V, Morvan J, Leroy EM. 2005. Ebola virus circulation in Africa: a balance between clinical expression and epidemiological silence. Bulletin De La Société De Pathologie Exotique 98: 210–217. Grard G, Biek R, Tamfum J-JM, Fair J, Wolfe N, Formenty P, Paweska J, Leroy E. 2011. Emergence of divergent Zaire Ebola virus strains in Democratic Republic of the Congo in 2007 and 2008. Journal of Infectious Diseases 204: 776–784. Hayes CG, Burans JP, Ksiazek TG, Del Rosario RA, Miranda ME, Manaloto CR, Barrientos AB, Robles CG, Dayrit MM, Peters CJ. 1992. Outbreak of fatal illness among captive macaques in the Philippines caused by an Ebola-related filovirus. The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene 46: 664–671. Hayman DTS. 2015. Biannual birth pulses allow filoviruses to persist in bat populations. Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences 282: 20142591. Hayman DTS, Emmerich P, Yu M, Wang L-F, Suu-Ire R, Fooks AR, Cunningham AA, Wood JLN. 2010. Long-term survival of an urban fruit bat seropositive for Ebola and Lagos bat viruses. PLoS ONE 5: e11978. Heymann DL, Weisfeld JS, Webb PA, Johnson KM, Cairns T, Berquist H. 1980. Ebola hemorrhagic fever: Tandala, Zaire, 1977-1978. The Journal of Infectious Diseases 142: 372–376. Huijbregts B, De Wachter P, Obiang LSN, Akou ME. 2003. Ebola and the decline of gorilla Gorilla gorilla and chimpanzee Pan troglodytes populations in Minkebe Forest, northeastern Gabon. Oryx 37: 437–443. IUCN (International Union for Conservation of Nature) 2008a. Epomops franqueti. I: IUCN 2015. IUCN Red List of Threatened Species. Version 2014.3. http://www.iucnredlist.org. Hämtad 2015-04-13. IUCN (International Union for Conservation of Nature) 2008b. Hypsignathus monstrosus. I: IUCN 2015. IUCN Red List of Threatened Species. Version 2014.3. http://www.iucnredlist.org. Hämtad 2015-04-13. IUCN (International Union for Conservation of Nature) 2008c. Myonycteris torquata. I: IUCN 2015. IUCN Red List of Threatened Species. Version 2014.3. http://www.iucnredlist.org. Hämtad 2015-04-13. Khan AS, Tshioko FK, Heymann DL, Guenno BL, Nabeth P, Kerstiëns B, Fleerackers Y, Kilmarx PH, Rodier GR, Nkuku O, Rollin PE, Sanchez A, Zaki SR, Swanepoel R, Tomori O, Nichol ST, Peters CJ, Muyembe-Tamfum JJ, Ksiazek TG, Kikwit C de L contre les E à. 1999. The reemergence of Ebola hemorrhagic fever, Democratic Republic of the Congo, 1995. The Journal of Infectious Diseases 179: 76–86. Kiley MP, Bowen ET, Eddy GA, Isaäcson M, Johnson KM, McCormick JB, Murphy FA, Pattyn SR, Peters D, Prozesky OW, Regnery RL, Simpson DI, Slenczka W, Sureau P, van der Groen G, Webb PA, Wulff H. 1982. Filoviridae: a taxonomic home for Marburg and Ebola viruses? Intervirology 18: 24–32. Kuhn JH, Becker S, Ebihara H, Geisbert TW, Johnson KM, Kawaoka Y, Lipkin WI, Negredo AI, Netesov SV, Nichol ST, Palacios G, Peters CJ, Tenorio A, Volchkov VE, Jahrling PB. 2010. Proposal for a revised taxonomy of the family Filoviridae: classification, names of taxa and viruses, and virus abbreviations. Archives of Virology 155: 2083–2103. 21 Lahm SA, Kombila M, Swanepoel R, Barnes RFW. 2007. Morbidity and mortality of wild animals in relation to outbreaks of Ebola haemorrhagic fever in Gabon, 1994-2003. Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene 101: 64–78. Le Guenno B, Formenty P, Wyers M, Gounon P, Walker F, Boesch C. 1995. Isolation and partial characterisation of a new strain of Ebola virus. The Lancet 345: 1271–1274. Leirs H, Mills JN, Krebs JW, Childs JE, Akaibe D, Woollen N, Ludwig G, Peters CJ, Ksiazek TG, Members SG. 1999. Search for the Ebola virus reservoir in Kikwit, Democratic Republic of the Congo: Reflections on a vertebrate collection. The Journal of Infectious Diseases 179: 155–163. Leroy EM, Baize S, Volchkov VE, Fisher-Hoch SP, Georges-Courbot MC, Lansoud-Soukate J, Capron M, Debre P, McCormick JB, Georges AJ. 2000. Human asymptomatic Ebola infection and strong inflammatory response. The Lancet 355: 2210–2215. Leroy EM, Epelboin A, Mondonge V, Pourrut X, Gonzalez J-P, Muyembe-Tamfum J-J, Formenty P. 2009. Human Ebola outbreak resulting from direct exposure to fruit bats in Luebo, Democratic Republic of Congo, 2007. Vector Borne and Zoonotic Diseases 9: 723– 728. Leroy EM, Kumulungui B, Pourrut X, Rouquet P, Hassanin A, Yaba P, Délicat A, Paweska JT, Gonzalez J-P, Swanepoel R. 2005. Fruit bats as reservoirs of Ebola virus. Nature 438: 575–576. Leroy EM, Rouquet P, Formenty P, Souquière S, Kilbourne A, Froment J-M, Bermejo M, Smit S, Karesh W, Swanepoel R, Zaki SR, Rollin PE. 2004a. Multiple Ebola virus transmission events and rapid decline of central African wildlife. Science 303: 387–390. Leroy EM, Telfer P, Kumulungui B, Yaba P, Rouquet P, Roques P, Gonzalez J-P, Ksiazek TG, Rollin PE, Nerrienet E. 2004. A serological survey of Ebola virus infection in central African nonhuman primates. The Journal of Infectious Diseases 190: 1895–1899. Maganga GD, Kapetshi J, Berthet N, Kebela Ilunga B, Kabange F, Mbala Kingebeni P, Mondonge V, Muyembe J-JT, Bertherat E, Briand S, Cabore J, Epelboin A, Formenty P, Kobinger G, González-Angulo L, Labouba I, Manuguerra J-C, Okwo-Bele J-M, Dye C, Leroy EM. 2014. Ebola virus disease in the Democratic Republic of Congo. New England Journal of Medicine 371: 2083–2091. Marí Saéz A, Weiss S, Nowak K, Lapeyre V, Zimmermann F, Düx A, Kühl HS, Kaba M, Regnaut S, Merkel K, Sachse A, Thiesen U, Villányi L, Boesch C, Dabrowski PW, Radonić A, Nitsche A, Leendertz SAJ, Petterson S, Becker S, Krähling V, CouacyHymann E, Akoua-Koffi C, Weber N, Schaade L, Fahr J, Borchert M, Gogarten JF, Calvignac-Spencer S, Leendertz FH. 2015. Investigating the zoonotic origin of the West African Ebola epidemic. EMBO Molecular Medicine 7: 17–23. Martini GA. 1973. Marburg virus disease. Postgraduate Medical Journal 49: 542–546. Mickleburgh S, Waylen K, Racey P. 2009. Bats as bushmeat: a global review. Oryx 43: 217– 234. Morvan JM, Deubel V, Gounon P, Nakouné E, Barrière P, Murri S, Perpète O, Selekon B, Coudrier D, Gautier-Hion A, Colyn M, Volehkov V. 1999. Identification of Ebola virus sequences present as RNA or DNA in organs of terrestrial small mammals of the Central African Republic. Microbes and Infection 1: 1193–1201. Negredo A, Palacios G, Vázquez-Morón S, González F, Dopazo H, Molero F, Juste J, Quetglas J, Savji N, de la Cruz Martínez M, Herrera JE, Pizarro M, Hutchison SK, Echevarría JE, Lipkin WI, Tenorio A. 2011. Discovery of an Ebolavirus-like filovirus in Europe. PLoS Pathogens 7: e1002304. Nishiura H, Chowell G. 2009. The effective reproduction number as a prelude to statistical estimation of time-dependent epidemic trends. I: Chowell DG, Hyman DJM, Bettencourt 22 DLMA, Castillo-Chavez C (red.). Mathematical and Statistical Estimation Approaches in Epidemiology, ss. 103–121. Springer, Nederländerna. Nkoghe D, Kone ML, Yada A, Leroy E. 2011. A limited outbreak of Ebola haemorrhagic fever in Etoumbi, Republic of Congo, 2005. Transactions of The Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene 105: 466–472. Oates JF, Tutin CEG, Humle T, Wilson ML, Baillie JEM, Balmforth Z, Blom A, Boesch C, Cox D, Davenport T, Dunn A, Dupain J, Duvall C, Ellis CM, Farmer KH, Gatti S, Greengrass E, Hart J, Herbinger I, Hicks C, Hunt KD, Kamenya S, Maisels F, Mitani JC, Moore J, Morgan BJ, Morgan DB, Nakamura M, Nixon S, Plumptre AJ, Reynolds V, Stokes EJ & Walsh PD. 2008. Pan troglodytes. The IUCN Red List of Threatened Species. Version 2014.3. <www.iucnredlist.org>. Hämtad 2015-04-17. Ogawa H, Miyamoto H, Nakayama E, Yoshida R, Nakamura I, Sawa H, Ishii A, Thomas Y, Nakagawa E, Matsuno K, Kajihara M, Maruyama J, Nao N, Muramatsu M, Kuroda M, Simulundu E, Changula K, Hang’ombe B, Namangala B, Nambota A, Katampi J, Igarashi M, Ito K, Feldmann H, Sugimoto C, Moonga L, Mweene A, Takada A. 2015. Seroepidemiological prevalence of multiple species of filoviruses in fruit bats (Eidolon helvum) migrating in Africa. The Journal of Infectious Diseases, doi 10.1093/infdis/jiv063. Okware SI, Omaswa FG, Zaramba S, Opio A, Lutwama JJ, Kamugisha J, Rwaguma EB, Kagwa P, Lamunu M. 2002. An outbreak of Ebola in Uganda. Tropical Medicine & International Health 7: 1068–1075. Peterson AT, Bauer JT, Mills JN. 2004. Ecologic and geographic distribution of filovirus disease. Emerging Infectious Diseases 10: 40–47. Pigott DM, Golding N, Mylne A, Huang Z, Henry AJ, Weiss DJ, Brady OJ, Kraemer MUG, Smith DL, Moyes CL, Bhatt S, Gething PW, Horby PW, Bogoch II, Brownstein JS, Mekaru SR, Tatem AJ, Khan K, Hay SI. 2014. Mapping the zoonotic niche of Ebola virus disease in Africa. eLife 3: e04395. Pourrut X, Délicat A, Rollin PE, Ksiazek TG, Gonzalez J-P, Leroy EM. 2007. Spatial and temporal patterns of Zaire Ebolavirus antibody prevalence in the possible reservoir bat species. The Journal of Infectious Diseases 196 Suppl 2: 176–183. Pourrut X, Souris M, Towner JS, Rollin PE, Nichol ST, Gonzalez J-P, Leroy E. 2009. Large serological survey showing cocirculation of Ebola and Marburg viruses in Gabonese bat populations, and a high seroprevalence of both viruses in Rousettus aegyptiacus. BioMed Central Infectious Diseases 9: 159. Rahman MA, Hossain MJ, Sultana S, Homaira N, Khan SU, Rahman M, Gurley ES, Rollin PE, Lo MK, Comer JA, Lowe L, Rota PA, Ksiazek TG, Kenah E, Sharker Y, Luby SP. 2012. Date palm sap linked to Nipah virus outbreak in Bangladesh, 2008. Vector Borne and Zoonotic Diseases 12: 65–72. Real LA, Biek R. 2007. Infectious disease modeling and the dynamics of transmission. I: Childs SRSJE, Mackenzie PJS, Richt VMOJA (red.). Wildlife and Emerging Zoonotic Diseases: The Biology, Circumstances and Consequences of Cross-Species Transmission, Current Topics in Microbiology and Immunology, ss. 33–49. Springer, Berlin Heidelberg. Regenmortel MHVV. 2003. Viruses are real, virus species are man-made, taxonomic constructions. Archives of Virology 148: 2481–2488. Rodriguez LL, De Roo A, Guimard Y, Trappier SG, Sanchez A, Bressler D, Williams AJ, Rowe AK, Bertolli J, Khan AS, Ksiazek TG, Peters CJ, Nichol ST. 1999. Persistence and genetic stability of Ebola virus during the outbreak in Kikwit, Democratic Republic of the Congo, 1995. The Journal of Infectious Diseases 179 Suppl 1: 170–176. Rouquet P, Froment J-M, Bermejo M, Kilbourn A, Karesh W, Reed P, Kumulungui B, Yaba P, Délicat A, Rollin PE, Leroy EM. 2005. Wild animal mortality monitoring and human 23 Ebola outbreaks, Gabon and Republic of Congo, 2001–2003. Emerging Infectious Diseases 11: 283–290. Shoemaker T, MacNeil A, Balinandi S, Campbell S, Wamala JF, McMullan LK, Downing R, Lutwama J, Mbidde E, Ströher U, Rollin PE, Nichol ST. 2012. Reemerging Sudan Ebola virus disease in Uganda, 2011. Emerging Infectious Diseases 18: 1480–1483. Suzuki Y, Gojobori T. 1997. The origin and evolution of Ebola and Marburg viruses. Molecular Biology and Evolution 14: 800–806. Swanepoel R, Leman PA, Burt FJ, Zachariades NA, Braack LE, Ksiazek TG, Rollin PE, Zaki SR, Peters CJ. 1996. Experimental inoculation of plants and animals with Ebola virus. Emerging Infectious Diseases 2: 321–325. Taylor LH, Latham SM, Woolhouse MEJ. 2001. Risk factors for human disease emergence. Philosophical Transactions of the Royal Society of London B: Biological Sciences 356: 983–989. Towner JS, Sealy TK, Khristova ML, Albariño CG, Conlan S, Reeder SA, Quan P-L, Lipkin WI, Downing R, Tappero JW, Okware S, Lutwama J, Bakamutumaho B, Kayiwa J, Comer JA, Rollin PE, Ksiazek TG, Nichol ST. 2008. Newly discovered Ebola virus associated with hemorrhagic fever outbreak in Uganda. PLoS Pathogens, doi 10.1371/journal.ppat.1000212. Walsh MG, Haseeb M. 2015. The landscape configuration of zoonotic transmission of Ebola virus disease in West and Central Africa: interaction between population density and vegetation cover. PeerJ 3: e735. Walsh PD, Abernethy KA, Bermejo M, Beyers R, De Wachter P, Akou ME, Huijbregts B, Mambounga DI, Toham AK, Kilbourn AM, Lahm SA, Latour S, Maisels F, Mbina C, Mihindou Y, Obiang SN, Effa EN, Starkey MP, Telfer P, Thibault M, Tutin CEG, White LJT, Wilkie DS. 2003. Catastrophic ape decline in western equatorial Africa. Nature 422: 611–614. Walsh PD, Biek R, Real LA. 2005. Wave-like spread of Ebola Zaire. PLoS Biology, doi 10.1371/journal.pbio.0030371. Walsh PD, Breuer T, Sanz C, Morgan D, Doran-Sheehy D. 2007. Potential for Ebola transmission between gorilla and chimpanzee social groups. The American Naturalist 169: 684–689. Walsh PD, Tutin CEG, Oates JF, Baillie JEM, Maisels F, Stokes EJ, Gatti S, Bergl RA, Sunderland-Groves J & Dunn A. 2008. Gorilla gorilla. The IUCN Red List of Threatened Species. Version 2014.3. <www.iucnredlist.org>. Hämtad 2015-04-17. Wittmann TJ, Biek R, Hassanin A, Rouquet P, Reed P, Yaba P, Pourrut X, Real LA, Gonzalez J-P, Leroy EM. 2007. Isolates of Zaire Ebolavirus from wild apes reveal genetic lineage and recombinants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 104: 17123–17127. WHO 1978a. Ebola haemorrhagic fever in Sudan, 1976. Bulletin of the World Health Organization 56: 247–270. WHO 1978b. Ebola haemorrhagic fever in Zaire, 1976. Bulletin of the World Health Organization 56: 271–293. WHO 2004. Ebola haemorrhagic fever in south Sudan – update. WWW-dokument 2004-0524: http://www.who.int/csr/don/2004_05_24/en/. Hämtad 2015-04-06. WHO 2009. End of Ebola outbreak in the Democratic Republic of the Congo. WWWdokument 2009-02-17: http://www.who.int/csr/don/2009_02_17/en/. Hämtad 2015-04-06. WHO 2012a. End of Ebola outbreak in Uganda. WWW-dokument 2012-10-04: http://www.who.int/csr/don/2012_10_04/en/. Hämtad 2015-04-06. WHO 2012b. Ebola outbreak in Democratic Republic of Congo – update. WWW-dokument 2012-10-26: http://www.who.int/csr/don/2012_10_26/en/. Hämtad 2015-04-06. 24 WHO 2015a. Latest available situation summary, 16 april 2015. WWW-dokument 2015-0416: http://apps.who.int/gho/data/view.ebola-sitrep.ebola-summary-20150416?lang=en. Hämtad 2015-04-17. WHO 2015b. Ebola situation report – 15 april 2015. WWW-dokument 2015-04-15: http://apps.who.int/ebola/current-situation/ebola-situation-report-15-april-2015. Hämtad 2015-04-17. 25