Bakteriofager, ett alternativ till antibiotika Liselotte Lundh Bakteriofager, eller fager som de också kallas, är ingenting nytt, utan de upptäcktes redan i början av 1900-talet. Den karakteristiska grumligheten hos bakteriekulturer upphörde utan direkt anledning, någonting livnärde sig på bakterierna, nämligen fagerna. Fager användes i början av 1900-talet till att bota bakteriella sjukdomar framför allt i Östeuropa, men efter antibiotikans upptäckt under 1940-talet övergavs fagterapin i västvärlden. Idag känns åter fagterapin aktuell på grund av den antibiotikaresistens som uppkommit hos bakterier till följd av vår överanvändning av antibiotika. Vissa sjukdomar orsakade av bakterier är idag mycket svårbehandlade med anledning av denna resistens. Fager finns naturligt i vår omvärld och generellt sett finns de överallt där bakterier finns. De infekterar och dödar bakterier genom att injicera sitt DNA och ta över bakteriernas metabolism (ämnesomsättning) samt reproducera sig själva inuti bakterien. De nyproducerade fagerna bryter sig ut ur den infekterade bakterien genom att bryta ner dess cellvägg. Därmed kan nya bakterier infekteras av de nyproducerade fagerna. Jag har med en specifik fag infekterat tre olika sjukdomsalstrande stammar av Escherichia coli-bakterier, som kan orsaka urinvägsinfektion eller diarré, från Akademiska sjukhuset i Uppsala. Denna fag ger ett snabbt infektionsförlopp, vilket är angeläget då den sjukdomsalstrande bakterien så snabbt som möjligt skall elimineras från patienten. Bakterierna odlades i ett näringsfattigt flytande medium med och utan syre. Odling utan syre användes för att få en miljö liknande den som fagerna naturligt lever i, exempelvis tarmkanalen hos djur och människor. Prover togs ut under en viss tidsperiod och odlades på agarplattor för att bestämma antalet fager som bildats och om bakteriehalten ökat eller minskat. Bakteriehalten minskade och därmed kan slutsatsen dras att fagen har de rätta egenskaperna för att döda den bakteriestammen. Däremot var fagproduktionen låg i försöken, och i slutet av provtagningsperioden ökade bakteriehalten kraftigt igen. Detta tyder på att vissa bakterier har utvecklat resistens mot fagen och därmed kan föröka sig utan risk att bli dödade av den. Resistensen uppkommer i det speciella näringsfattiga medium som användes för odling av bakterierna, oberoende av om fager är närvarande eller inte. Under min studie gjordes även försök för att förstå vilka genetiska egenskaper hos fagen som är viktiga för en lyckad fagterapi. Detta skulle ske med hjälp av s.k. hoppande gener som kan förflytta sig från en plats till en annan i genomet (arvsmassan) samt mellan olika genom. Den hoppande genen skulle sättas i en plasmid, en ringformad DNA-molekyl, och sedan föras in i en bakterie. Bakterien skulle i nästa steg infekteras av en fag och den hoppande genen skulle förhoppningsvis hamna i faggenomet. Den hoppande genen kommer där att bilda sitt specifika protein, i detta fall ett protein som ger ett grönt sken, grön fluorescens. Fager med detta protein i genomet, dvs. fagmutanter, isoleras med hjälp av den gröna fluorescensen. Fagmutanterna ska sedan jämföras med den ursprungliga fagen under nya infektionsförsök för att se hur infektionen påverkats av att just den genen inaktiverats. Det gick tyvärr inte att konstruera den hoppande genen med den metod jag använde och den kan därför inte användas till resterande försök. Projektet fortsätter med en ny metod för att konstruera den hoppande genen. Examensarbete i biologi, 20 p, HT 2004 Institutionen för biologisk grundutbildning och institutionen för cell och molekylärbiologi, Uppsala universitet Handledare: Karin Carlson