Välkommen
till MOBA02 Cellens Kemi och TEK287 Biokemi!
Nedan specificeras förkunskapskrav och lärandemål för kursen.
Du förväntas sedan tidigare kurser vara insatt i:
-
Aminosyrornas namn, en- och tre-bokstavskoder, samt struktur,
Proteinstruktur (primär-, sekundär, tertiär- och kvarternärstruktur),
Nukleotidernas namn och enbokstavskoder,
Nukleinsyrornas uppbyggnad (DNA, mRNA).
Grundläggande metabolism; glykolys, citronsyracykel, respiration.
Repetition av dessa kunskaper sker lämpligen genom läsning i kursboken av kapitel
2 (aminosyror och proteinstruktur), och kapitel 4 och 5 (DNA och RNA).
Under denna kurs kommer du att ha stor nytta av att kunna aminosyrornas struktur
och proteinstruktur, och vi ger en repetitionsföreläsning om detta i början av kursen.
Efter avslutad kurs kommer du att ha en grundlig förståelse för:
-
hur proteinstruktur bestäms och hur den avgör ett proteins funktion.
hur enzymer katalyserar livsviktiga reaktioner.
hur dessa reaktioner regleras.
vanliga katalytiska mekanismer.
enzymkinetik och hur denna används för att studera enzymer.
cellens metabolism, inklusive glykoneogenes, glykogenmetabolism,
fettsyremetabolism, samt omsättning av proteiner och aminosyror.
tillvägagångssättet för att utveckla nya mediciner.
teorin bakom metoder som används för proteinupprening och -studier, såsom
elektrofores-, kromatografiska, centrifugerings- och spektroskopiska metoder,
samt röntgen-kristallografi.
bioinformatik och dess användningsområden.
Du kommer dessutom att ha uppnått färdighet i:
-
laborativ biokemi, inklusive proteinupprening, affinitetskromatografi,
elektrofores, och aktivitetsmätning med fluorometri.
försöksplanering.
analys av biokemiska data, inklusive enzymkinetiska beräkningar.
sökning i proteindatabaser och litteraturdatabaser efter bioinformatisk
information, samt tolkning med hjälp av bl.a. PDB viewer.
att diskutera biokemiska begrepp och fenomen med betoning på resonemang
framför utantillkunskaper.
LÄSANVISNINGAR
MOBA02 Cellens kemi
TEK287 Biokemi
Biochemistry, 7th edition, by Berg,Tymoczko and Stryer, 2012, Freeman.
Avsnitten nedan utgör läskursens omfång. Hela kapitlet ingår, utom när annat
specificeras. Till samtliga dessa avsnitt finner du instuderingsfrågor i pärmen.
Instuderingsfrågorna bildar utgångspunkt för gruppövningarna.
Kap 2: Protein Composition and Structure (repetition)
Kap 3: Exploring Proteins and Proteomes
Kap 6: Exploring Evolution and Bioinformatics
Kap 7: Hemoglobin
Kap 8: Enzymes: Basic Concepts and Kinetics
Kap 9: Catalytic Strategies
Kap 10: Regulatory Strategies
Kap 15: Metabolism: Basic Concepts and Design
Kap 16: Glycolysis and Gluconeogenesis
Kap 20.3 & 20.4: The Pentose Phosphate Pathway
Kap 21: Glycogen Metabolism
Kap 22: Fatty acid Metabolism
Kap 23: Protein Turnover and Amino Acid Catabolism
Kap 24: Biosynthesis of Amino Acids
Kap 29.3 & 29.4: RNA Splicing & Catalytic RNA
Kap 30.1 - 30.5: Protein Synthesis
Kap 36: Drug Development
