Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet "Monsterfiskens" släktingar Cecilia Brunhoff Havsmus, Chimaera monstrosa, är en djuphavsfisk som kan bli upp till 150 cm lång. Ögonen är stora och har grönfärgade linser. Sidofenorna ser ut som små vingar och på ryggen sitter en rörlig gifttagg. Havsmusens skelett är uppbyggt av brosk. Släktskap mellan djurarter har tidigare baserats på morfologi, d.v.s. likheter och skillnader i utseende och kroppsuppbyggnad. Havsmöss, hajar och rockor har samma typ av skelett och utgör klassen broskfiskar. Till skillnad från hajar och rockor, som har flera gälspringor, har havsmusen gällock som en benfisk. Under bildandet av benskelett bildas först brosk som så småningom ersätts av ben. Man brukar säga att utvecklingen från ett befruktat ägg till ett färdigt foster speglar artens evolutionära historia, man har därför tidigare ansett att benfiskarna har utvecklats från broskfiskar. Med molekylärbiologiska metoder har man visat att hajar faktiskt utvecklats från utdöda benfiskar, som även dagens benfiskar härstammar från. Det har länge funnits en teori om att de fyrbenta, landlevande ryggradsdjuren utvecklades från en fisk som ”tog steget upp på land”. Man har funnit fossil av utdöda fyrfota ryggradsdjur som har många fiskliknande drag. Ända sedan slutet av 1930-talet, då man fann den första levande kvastfeningen i modern tid, har forskare diskuterat om kvastfeningen eller lungfisken är den närmaste nu levande släktingen till de fyrbenta, landlevande ryggradsdjuren. Genom att sekvensera och jämföra gener från olika djurarter kan man fastställa deras släktskap med varandra. För att få klarhet i vilka fiskar de fyrbenta landdjuren utvecklats från måste man först få ordning på fiskarnas inbördes släktförhållanden. Mitokondrierna är cellernas kraftverk, de bildar cellens energi. Mitokondrierna har egen arvsmassa i form av en liten cirkulär DNA-molekyl. De tretton proteinkodande gener som finns i mitokondriellt DNA - kodar för proteiner som ingår i de processer som behövs för energiproduktionen. Jag har undersökt hur havsmusen är släkt med andra fiskar. Detta har jag gjort med hjälp av en gen som kallas ND2. Sekvensen för ND2-genen från havsmusen och nio andra fiskarter analyserades med hjälp av olika datorprogram, vars resultat åskådliggörs i form av släktträd. Som förväntat visade mina analyser att de strålfeniga fiskarna karp, torsk och forell, var närmast släkt med varandra. Denna grupp återfanns tillsammans med broskfiskarna i toppen av fiskarnas evolutionsträd, vilket inte överensstämmer med den traditionella uppfattningen över fiskarnas fylogeni, men väl med nya molekylärbiologiska rön. I en nyligen utförd studie av hajens släktskap med andra fiskar placerades kvastfeningen som nära släkting till hajen. Mina resultat visar att havsmusen och kvastfeningen är nära släkt med hajen och rockan. Fler mitokondriella gener behöver dock undersökas för att säkerställa mina resultat och för att utröna om broskfiskarna utgör en egen gren i fiskträdet. Swedish official title: Fylogenetiska analyser av havsmus, Chimaera monstrosa, baserade på ND2-genen Swedish credits: 20p E-mail address of first author: [email protected] Supervisor: Ann-Sofie Rasmussen, Department of Genetics, division of Evolutionary Molecular Systematics Submission date/time: 1998-08-03 Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Phylogenetic analyses of the ratfish, Chimaera monstrosa, based on the ND2-gene Cecilia Brunhoff Biology, Molecular Genetics Spring 1998 Abstract in English The molecular phylogeny of the ratfish, Chimaera monstrosa, has been investigated. The ratfish is traditionally placed together with sharks, rays and skates, in the class Condrichthyes, i.e. cartilaginous fishes. Since cartilage is the predecessor of bone in the development of the skeleton, cartilaginous fishes were long thought to be the ancestors of the bony fishes. That has now been questioned by recent molecular studies, suggesting that cartilaginous fishes could have arisen from bony fishes. Mitochondrial (mt) genes are often used for phylogenetic studies. The genes are tightly packed, do not recombine or contain any introns, and are almost strictly maternally inherited. Individual mitochondrial genes can produce misleading evolutionary data and might not be a true representative of the entire mt-genome. However, some genes, e.g. the ND2-gene, have been shown to recover the expected phylogenies in vertebrates. The ND2-gene was PCR amplified and sequenced. The nucleotide sequence was translated into amino acid sequence and all gaps and ambiguous sites were removed. Both the nucleotide and the amino acid sequences were aligned to the analogous sequences of nine other fish species. In accordance with two previous phylogenetic studies the sea lamprey was used as outgroup. Analyses were performed using different statistical methods. Both data sets and all methods gave compatible results. In a recent study the traditional phylogenetic tree of the gnathostome (jawed) fishes was challenged. That study found the sarcopterygian (lobe-finned) fishes basal in the tree and the shark plus teleosts (higher bony fishes) as the crown taxa. This relationship was also supported by my study, even though, due to the limited size of the alignment, the exact branching order could not be determined. In a previous study, the coelacanth was found to be a close relative of the only catilaginous fish, a shark, that was used in that study. The coelacanth was placed close to the three cartilaginous fishes that were used in my analyses, the shark, the ray and the ratfish. The internal branching order between the coelacanth and the cartilaginous fishes, and thus the monophyletic status of the Chondrichthyes, could not be conclusively resolved.