AFA Försäkring, Slutrapport, december 2014 Projekttitel: Projektledare: Diarienummer: Projekttid: Gener, central toleransutveckling och autoantigen vid autoimmuna sjukdomar Olov Ekwall 100258 2011-01-01 – 2014-06-30 Projektets syfte Det övergripande syftet med projektets tre delprojekt är att öka kunskapen om den genetiska och immunologiska bakgrunden till autoimmuna sjukdomar med det slutliga målet att förbättra möjligheterna till förebyggande åtgärder, diagnostik och behandling av patienter. Uppnådda resultat I det första delprojektet har vi genom att korsa tre kycklinglinjer med autoimmuna sjukdomar motsvarande de mänskliga sjukdomarna systemisk skleros, tyreoidit och vitiligo med kontroller har vi identifierat genregioner som är kopplade till förekomsten av dessa sjukdomar. För sklerodermi ligger regionerna på kromosom 2, 12 och 14, för tyreoidit på kromosom 2, 16, 20 och 21 och för vitiligo på kromosom 3 och 9. Några av dessa genregioner samverkar med varandra och andra visar en oberoende signifikans. I de olika regionerna har enskilda kandidatgener identifierats och studier av dem och deras humana motsvarigheter pågår. I det andra projektet har analys av human thymusvävnad från barn med och utan Downs syndrom har visat att den ökade gendosen av AIRE genen på kromosom 21 leder till ett ökat uttryck av AIRE samt även till ett ökat uttryck av flera vävnadsspecifika antigen som regleras av AIRE proteinet, tex. insulin. Den ökade AIRE gendosen tycks också påverka den cellulära sammansättningen och strukturen av thymus vilket kan vara av avgörande betydelse för toleransutvecklingen i thymus och den ökade förekomsten av autoimmuna sjukdomar hos barn med Downs syndrom. Nanovesiklar, sk. exosomer, har för första gången identifierats i human thymus som möjliga mediatorer av central tolerans. Funktionella studier av exosomer från thymus har visat att dessa kan påverka tymocyternas selektion och utmognad. Detta innebär upptäckten av en tidigare okänd signaleringsprincip i tymus med potentiellt stor betydelse for den negativa selektionen och i förlängningen för uppkomsten av autoimmuna sjukdomar. Slutligen har vi i det tredje delprojektet utnyttjat normal human vävnad och serum från patienter för att identifiera tre nya autoantigen kopplade till inflammatoriska tarmsjukdomar (PDZK1, GSTτ1 and C3b). Detta bidrar till ökad förståelse av sjukdomsprocesserna samt utökar arsenalen av diagnostiska hjälpmedel vid inflammatorisk tarmsjukdom. Projektet har resulterat i tio publikationer i refereegranskade internationella tidskrifter vilka redovisas nedan. Under 2011-2014 har två doktorander disputerat inom ramen för projektet: Anna-Stina Sahlqvist, 2012-11-29, “Comparative genomics in chicken models of autoimmune diseases”. Opponent: Prof Holger Luthman, Lunds universitet. Gabriel Skogberg, 2014-09-25,”Characteristics and functions of thymic exosomes in human and mouse”. Opponent: Prof Georg Holländer, Univ Oxford. Avvikelser i projektet utifrån projektbeskrivningen Projektet har i stort sett förlöpt efter planen. En mindre fördröjning i tid pga föräldraledighet hos en medarbetare gjorde att vi ansökte och beviljades förlängd nyttjandetid av medlen med sex månader tom juni 2014. Praktisk användning i arbetslivet Autoimmuna sjukdomar utgör som grupp den tredje största orsaken till sjuklighet och sjukfrånvaro i västvärlden. Den ökade kunskapen om bakomliggande mekanismer samt nya diagnostiska markörer vid autoimmuna sjukdomar som projektet bidragit till kommer i förlängningen att kunna leda till förbättrade möjligheter till preventiva åtgärder, diagnostik och behandling. Spridandet av resultaten i samhället genom publicerande i vetenskapliga tidskrifter samt presentationer på nationella och internationella konferenser möjliggör en vidare användning av resultaten. Publikationer 1. Gunnarsson U, Kerje S, Bed'hom B, Sahlqvist AS, Ekwall O, Tixier-Boichard M, Kämpe O, Andersson L. The Dark brown plumage color in chickens is caused by an 8.3-kb deletion upstream of SOX10. Pigment Cell Melanoma Res. 2011 Apr;24(2):268-74. 2. Johnsson M, Gustafson I, Rubin CJ, Sahlqvist AS, Jonsson KB, Kerje S, Ekwall O, Kämpe O, Andersson L, Jensen P, Wright D. A sexual ornament in chickens is affected by pleiotropic alleles at HAO1 and BMP2, selected during domestication. PLoS Genet. 2012;8(8):e1002914 3. Mapping QTL affecting a systemic sclerosis-like disorder in a cross between UCD-200 and red jungle fowl chickens. Ek W, Sahlqvist AS, Crooks L, Sgonc R, Dietrich H, Wick G, Ekwall O, Andersson L, Carlborg Ö, Kämpe O, Kerje S. Dev Comp Immunol. 2012 Oct;38(2):352-9. 4. Characterization of human thymic exosomes. Skogberg G, Gudmundsdottir J, van der Post S, Sandström K, Bruun S, Benson M, Mincheva-Nilsson L, Telemo E and Ekwall O (2013) PLoS One, Jul 2;8(7):e67554. 5. Association of Autoimmune Addison's Disease with Alleles of STAT4 and GATA3 in European Cohorts. Mitchell AL, Macarthur KD, Gan EH, Baggott LE, Wolff AS, Skinningsrud B, Platt H, Short A, Lobell A, Kämpe O, Bensing S, Betterle C, Kasperlik-Zaluska A, Zurawek M, Fichna M, Kockum I, Nordling Eriksson G, Ekwall O et al. PLoS One. 2014 Mar 10;9(3):e88991. 6. The role of pleiotropy and linkage in genes affecting a sexual ornament and bone allocation in the chicken. Johnsson M, Rubin C-J, Höglund A, Sahlqvist A-S, Jonsson K, Kerje S, Ekwall O et al. Molecular Ecology, Accepted manuscript online: 21 MAR 2014, DOI: 10.1111/mec.12723 7. Rodriguez-Calvo T, Ekwall O, Amirian N, Zapardiel-Gonzalo J, von Herrath MG. Increased Immune Cell Infiltration of the Exocrine Pancreas: A Possible Contribution to the Pathogenesis of Type 1 Diabetes. Diabetes. 2014 Jun 19. pii: DB_140549. 8. Skogberg G, Lundberg V, Lindgren S, Gudmundsdottir J, Sandström K, Kämpe O, Annerén G, Gustafsson J, Sunnegårdh J, van der Post S, Telemo E, Berglund M, Ekwall O. Altered Expression of Autoimmune Regulator in Infant Down Syndrome Thymus, a Possible Contributor to an Autoimmune Phenotype. J Immunol. 2014 Jul 18. pii: 1400742. 9. Premature thymic involution is driven by hematopoietic stem cell defects independent of associated developmental changes (2014) Dean Franckaert, Susan M. Schlenner, Nathalie Heirman, Jason Gill, Gabriel Skogberg, Olov Ekwall, Karen Put, Michelle A. Linterman, James Dooley and Adrian Liston. Manuscript, accepted, European Journal of Immunology 10. Human thymic epithelial primary cells produce exosomes that carry tissue restricted antigens (2014) Gabriel Skogberg, Vanja Lundberg, Martin Berglund, Judith Gudmundsdottir, Esbjörn Telemo, Susanne Lindgren and Olov Ekwall. Manuscript, accepted, Immunology and Cell Biology Sammanfattning Projektet består av tre delstudier som tar fram nya metoder för att förebygga, upptäcka och behandla så kallade autoimmuna sjukdomar. Autoimmuna sjukdomar – sklerodermi, MS, struma, vitiligo med flera – kan vara allt från lindriga till mycket allvarliga. Den typen av sjukdomar är den tredje största dödsorsaken i västvärlden. Stora vinster kan göras genom att hitta dem som riskerar att få sådana sjukdomar samt förebygga och behandla dem. Syfte Den första delstudien ska söka de gener som ligger bakom sklerodermi, autoimmun tyreoidit och vitiligo. Den andra ska undersöka betydelsen av så kallad toleransutveckling hos personer med och utan Downs syndrom. Målet med den tredje delstudien är leta efter så kallade autoantikroppar som kan förbättra möjligheterna att behandla inflammatoriska tarmsjukdomar. Genomförande Studier av gener bakom autoimmuna sjukdomar har tidigare gjorts på djur och nu undersöker forskarna de generna hos patienter. En orsak till autoimmuna sjukdomar är så kallad bristfällig toleransutveckling i immunförsvaret för den egna kroppen, vilket är vanligt hos personer med Downs syndrom, som därmed ofta får autoimmuna sjukdomar. Toleransutvecklingen undersöks i den andra studien genom att studera ett proteins roll i sammanhanget. Den tredje delstudien undersöker om fler autoantikroppar än antikroppar mot epitelceller i tarmen är vanliga vid inflammatorisk tarmsjukdom. Resultat Projektet har funnit flera så kallade genregioner (på kromosom 2, 12 och 14) som spelar in vid autoimmuna sjukdomar. Den andra studien har visat att förekomsten av ett visst protein är högre hos barn med Downs syndrom. Projektet hoppas finna fler autoantikroppar som är inblandade vid inflammatorisk tarmsjukdom. Resultaten har bland annat presenterats vid vetenskapliga konferenser.