Sahlgrenska akademin KURSINFORMATION VT 2017 Kursbeteckning: Kurskod: Poängtal: Molekylärbiologi BMA 042 7,5 högskolepoäng KURSENS UPPLÄGGNING Kursen ingår både i inriktning Laboratoriemedicin och i inriktning Fysiologi. Den går parallellt med två andra kurser: Molekylärbiologisk metodik, BMA043, för inriktning Laboratoriemedicin, och Molekylärbiologisk och immunologisk metodik, BMA046, för inriktning Fysiologi. Båda dessa kombinationer kräver helfartsstudier och går under dagtid. KURSANSVARIG OCH EXAMINATOR Professor Maria Falkenberg, tel 031-786 3444; [email protected] KURSSEKRETARIAT Kursadministratör för Biomedicinska analytikerprogrammet är Jennie Pettersson, Medicinaregatan 7B, tel 031-7863798. E-postadress: [email protected] Maria eller någon annan av kursadministratörerna på Biomedicin träffas på kursexpeditionen, Medicinaregatan 9. Öppettider: måndag – onsdag kl 10.00 – 12.00, torsdag 12.00 – 14.00. ARBETSFORMER Undervisningen bygger på gruppövningar, litteraturuppgift, föreläsningar och självstudier. EXAMINATION För godkänd kurs krävs godkänt på gruppövningarna, litteraturuppgift samt godkänd skriftlig sluttentamen. För kursen ges betygen väl godkänd, godkänd eller underkänd. För att bli godkänd på kursen krävs att man klarar minst 60 % på tentamen. För att bli väl godkänd på kursen krävs att man klarar minst 80 % på tentamen KURSENS INNEHÅLL Studenten ska kunna förstå och förklara Skillnader mellan prokaryota och eukaryota celler, mitos, meios, cellcykel Eukaryota kromosomer (nukleosomer, histoner, centromer, telomer) DNA:s uppbyggnad (baser, deoxyribos, fosfatbryggor, 5’- och 3’-ändar, nukleotider, nukleosider, antiparallella strängar) och struktur (B-formen), major och minor groove, denaturering av DNA, hybridisering (allmänt) RNA:s uppbyggnad ( ribosomers uppbyggnad, tRNA:s struktur och funktion, antikodon, aminoacyl-tRNA-syntetasers funktion) Definition av en gen, den genetiska informationens flöde från DNA till protein (genexpression, den centrala dogmen) DNA-replikation i prokaryota celler (Origin, DNA-polymeras I och III, primas, helikas, ligas, topoisomeraser, SSB, leading strand, lagging strand, processivitet, korrekturläsningsfunktion, 3’→5’- och 5’→3’-exonukleasaktivitet) Transkription i prokaryota celler (promotor, terminator, uppströms, nedströms, consensus-sekvens, RNA-polymeras, sigma-subenheten, terminering med och utan rho, kodande sträng, antisense-sträng) Translation i prokaryota celler (initieringsfaktorer, elongeringsfaktorer, release-faktorer, peptidyltransferas, A-, P- och E-site). den genetiska koden (degenererad, universell) öppen läsram (ORF), Shine-Dalgarnosekvens (SD, RBS) mutationer (punktmutation, substitution, deletion, insertion; tyst, missens-, nonsens- och suppressormutation, läsramsförskjutning) Reglering av transkription i prokaryota celler (operator, repressor, corepressor, aktivator, induktor) lac- och trp-operonernas reglering Orsaker till skador på DNA i levande celler olika DNA-reparationssystem (direkt reparation, base excision, nucleotide excision, mismatch excision samt reparation av dubbelsträngsbrott dvs mha homolog rekombinering samt icke homolog end-joining). Transposoner (hoppande gener) DNA-replikation i eukaryota celler, olika DNA-polymeras som är involverade i replikationen, PCNA, Helikas telomeras, enkelsträngsbindande protein (RPA) Transkription i eukaryota celler, RNA-polymeras I, II och III, TATA-box, , enhancer, aktivator, silencer, det basala transkriptions komplexet för eukaryota proteinkodande gener, TBP, TBP-associerade faktorer. posttranskriptionell modifiering av mRNA: capping, polyadenylering, splicing Translation i eukaryota celler: initieringsfaktorer, syntes av proteiner för ER, Golgi och export ut ur cellen. Reglering av translation mha RNAi Mitokondriellt DNA: maternell nedärvning, heteroplasmi, kodar för mitokondriens alla tRNA och rRNA samt några proteinsubenheter, mitokondriens ursprung onkgener, proto-onkgener, tumörsuppressorgener human genetik: genotyp, fenotyp, haplotyp, allel, locus, homozygot, heterozygot, pedigree, autosomal, dominant och recessiv nedärvning rekombination, överkorsning repetitivt DNA: satellit-, minisatellit- och mikrosatellit-DNA Ha kunskap om: Andra former av dubbelhelixar (A och Z DNA) hur DNA-replikation initieras i prokaryota celler skillnader mellan prokaryoters och eukaryoters ribosomer annorlunda baser i tRNA hur förstadier till tRNA och rRNA processas i prokaryota celler andra sigma-faktorer att den genetiska koden skiljer sig delvis i mitokondrierna hur antibiotika påverkar prokaryota cellers proteinsyntes, Ames test transition, transversion SOS-reparation, felbenägen (error-prone) reparation ara-operonens reglering reglering av lambda-fagens livscykel strukturer hos DNA-bindande proteiner (helix-loop-helix, helix-turn-helix, zinkfinger, leucin-blixtlås) RNAi, mikroRNA, CRISPR-CAS9 karyotypering, kromosombandning genomisk prägling, penetrans initieringsfaktorer för replikation i eukaryota celler oktamer, CTD alternativ splicing av immunglobulingener metylering av CpG-öar, deacetylering av histoner inhibering och kontroll av translation i eukaryota celler reglering av eukaryota cellers cellcykel, embryonal utveckling, gastrulering, morphogen, stamceller. Mendels lagar, allelisk heterogenitet, locus-heterogenitet, penetrans, anticipation, imprinting (= genomisk prägling), kopplingsanalys MF 2017-02-15