C.V.
Rikard Erlandsson
Aug 2012 Kort summering
TIDIGARE ARBETE
2011 – nu
Bioinformatiker
Karolinska Institutet, Institutionen för medicinsk biokemi och biofysik, Solna, Sverige.
Bioinformatik och IT stöd för Strategisk Neuroforskning vid Karolinska Institutet. Genomför
genetiska analyser på superdatorer i Linköping, Uppsala och i molnet. Kontakt med mjuk och
hårdvaruleverantörer.
2009 – 2010 Bioinformatiker
Center of Integrativ Bioinformatik (CIBIV), Wien, Österrike.
Genetiska associationsstudier sökande efter gener ansvariga för ögonsjukdomar hos hundar.
2009 – 2010 Bioinformatiker
Austrian Institute of Technology, Institutionen för Hälsa och Miljö, Seibersdorf, Österrike.
DNA sekvensannotering och nedströms hantering, Konstruktion av automatiserade Pipelines.
2001 – 2008 Bioinformatik Manager [1 publicerad artikel]
Neuronova AB, Target Discovery, Stockholm, Sverige.
Ledde Bioinformatik och IT aktiviteterna. Generell bioinformatik och data hantering, Undervisning
och vägledning, Ansvarig för produktionssystem och utveckling.
1999 – 2001 Senior forskare [4 publicerade artiklar]
KTH, Institutionen för Bioteknologi, Stockholm, Sverige.
DNA sekvenshantering och automatisering, Utveckling av EST annoteringspipeline.
Undervisning in bioinformatik, Lektioner i biokemi, Projektplanering och genomförande.
1997 – 1998 PostDoc [2 publicerade artiklar]
Ludwig Maximilian Universität, Zoologiska Institutet, München, Tyskland.
Shotgun-sekvensering av genomregionen runt ZFY [135 KB] och sammanfogning.
Planering, Val och införskaffning av utrustning [för klon preparering och sekvensering, etc],
Utbildning av gruppmedlemmar, Genomförande och publicering.
1996 – 1997 PostDoc [2 publicerade artiklar]
Uppsala Universitet, Institutionen för Medicinsk Genetik, Uppsala, Sverige.
Kloning och sekvensering av MHC från säl och primater med hjälp av PCR och andra
molekylärgenetiska tekniker. Konstruerade en databas för insamling av kliniska prover.
1987 – 1996 PhD student [13 publicerade artiklar]
Karolinska Institutet, Institutionen för Mikrobiologi, Tumör och Cellbiologi, Stockholm, Sverige.
Generell kloning, kartläggning och sekvensering av humant DNA/RNA med hjälp av
molekylärgenetiska metoder. Handledning, utbildning och undervisning.
ARTIKLAR
22 VETENSKAPLIGA ARTIKLAR i internationella tidskrifter [NCBI - PubMed (1988 - 2005)]
1 PATENT ansökan [USPTO - 20090232775 Compounds and methods for increasing neurogenesis
(2005 - 2009)]
PUBLICERING av DNA sekvens och kartläggningsdata
2010 - 454 sekvensdata publicering: 8 runs [942,768 spots, 245.4M bases] till NCBI Sequence Read
Archive [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX019678?report=full]
2010 - BAC fingerprinting/kartläggningsdata från Råg 1RS (32 332 BAC kloner in 1 562 kontiger) till
PhyMap [http:/probes.pw.usda.gov:8080/rye1RS/]
DNA sequens publicering på NCBI
2001 - Populus tremula x Populus tremuloides (15275) EST, Asp gensekvenser
2001 - Mus musculus (9091) EST, Mus gensekvenser
2001 - Populus trichocarpa (6511) EST, Asp gensekvenser
2000 - Homo sapiens Y-linked zinc finger protein (ZFY) gene, complete cds 135 849 bp, GenBank:
AF114156.1
Jag har deltagit i fler än 35 internationella konferenser och presenterat mitt arbete.
MJUKVARUKÄNNEDOM EXPERTKUNSKAPER
OS: Linux [RedHat, Ubuntu], MacOSX, DOS, Windows 95, NT, 2000, XP, Vista, 7.
Generell mjukvara: Microsoft Office [Word, Excel, Outlook, Powerpoint], Open Office, Adobe
Lightroom 4, Adobe Photoshop.
Vetenskaplig mjukvara: Phred/Phrap/Consed, Blast, BioPerl.
Övriga mjukvaruverktyg: MySQL, Perl, Apache, VPN, Active Directory, CVS, C#, PHP, Joomla, CPAN,
BioConductor.
HÅRDVARUKUNSKAPER
Generell datoruppbyggnad, Brandväggar, Router/Switchar, Nätverk, Skrivare.
1
