En fylogenetisk studie av endemiska Silene (Caryophyllaceae) på Kanarieöarna.
Magnus Lundberg
På Kanarieöarna finns det 7 olika arter av släktet Silene som är endemiska, dvs de
förekommer endast på Kanarieöarna och ingen annanstans i världen. Dessa växter är mycket
lika varandra morfologiskt sett och det råder tveksamheter om hur de är besläktade med
varandra. Syftet med mitt arbete har varit att söka svar på flera frågor. Hur dessa endemiska
Silene är besläktade med varandra? Är de en monofyletisk grupp? Vad skulle deras
geografiska ursprung kunna vara? Finns det något mönster som de spridit sig mellan de
kanariska öarna? Vilken är deras närmaste släkting eller grupp av släktingar?
Jag har gjort en molekylär studie som baserades på att söka växternas släktskap genom att
jämföra deras DNA. Mitt arbete startade med att extrahera torkade växtdelar från respektive
art så att jag fick totala mängden DNA, både kloroplast och DNA från cellkärnan i en lösning.
Därefter renades lösningen från produkter som jag inte vill ha, t ex cellväggar och andra
organeller som finns i cellerna. Den renade lösningen består då till huvuddelen av DNA och
gjordes i ordning för en Polymerase Chain Reaction (PCR)-reaktion, vilket innebär att en
specifik del av växtens DNA kopieras, så en stor mängd kopior av just denna region
genereras. Detta var nödvändigt för att kunna bestämma växtens DNA-sekvens senare. För att
kunna göra en PCR-reaktion användes oligonukleotider (”primers”), dvs korta strängar av
DNA, vilka fäster på växtens DNA och styr så att rätt område kopieras. Efter PCR gjordes
ytterligare en rening för att ta bort överblivna oligonukleotider och resterna från PCRreaktionen. Därefter följde sekvensering av PCR-produkten vilket innebar att jag fick ut
sekvensen av det kopierade området bas för bas. Sekvenserna kontrollerades och korrigerades.
Därefter jämkades sekvenserna ihop i en matris som analyserades med hjälp av olika
fylogenetiska dataprogram.
Totalt fick jag ut sekvenser för 4 olika områden från växternas DNA. Ett område var
kloroplast DNA och heter rps16. De resterande 3 var av nukleärt ursprung. Två av dessa kärnDNA områden tillhör RNA-polymerasfamiljen och heter RPA2 och RPB2. Den sista heter
ITS som står för Internal Transcribed Spacer region.
Mina resultat visar att de endemiska Silene är mycket lika varandra molekylärt och att de är
mycket närbesläktade. Det visade sig att de bildar en monofyletisk grupp. Inbördes släktskap
av de kanariska endemerna tyder på att S. berthelotiana och S. tamaranae är mycket
närbesläktade med S. lagunensis som systerart. De resterande endemerna bildar en oupplöst
grupp till dessa 3 arter. Den art som är närmast besläktad med de Kanariska endemerna är
backglim, S. nutans, som är mycket vanlig i nästan hela Europa, men som inte återfinns i
Medelhavsområdet eller på Kanarieöarna. Mina data indikerar att de kanariska arterna har ett
ursprung i tempererade områden av Eurasien, vilket är mycket ovanligt för Kanariska
endemer, som ofta har ett ursprung i Afrika eller Medelhavsområdet. Tyvärr har jag inte
kunnat dra några slutsatser om hur endemerna skulle ha spridit sig mellan de Kanariska öarna,
detta pga. att de visade sig vara så genetiskt lika.
Examensarbete i biologi, 20 p, vt 2005
Institutionen för Biologisk grundutbildning, avdelningen för Systematisk botanik, Uppsala universitet
Handledare: Bengt Oxelman
