2014-10-30 Gener och Genuttryck NBIC47 NBIC47 (Version 141030) Datum Tid Aktivitet Lärare Lokal Johan Edqvist BL33 Vecka 45 Måndag 3/11 09.15-10.00 Kursintroduktion 10.15-12.00 Föreläsning 1: Kromosomers BL33 struktur och funktion 1 (K4) Tisdag 4/11 13.15-15.00 F 2: Kromosomers struktur JE BL34 och funktion 2 (Kap 4) Onsdag 5/11 13.15-15.00 F3: Cellcykeln 1 (Kap 5) JE BL33 15.15-16.00 Seminarium 1: Introduktion JE BL33 till projekt och seminarier Torsdag 6/11 08.15-10.00 F4: DNA replikering (K.6) JE BL33 Fredag 7/11 08.15-10.00 S2: Experimental Approach 1 JE P34 Grupp 1-2, JE P34 (K4-K6) 10.15-12.00 S3: Veckans höjdpunkter 1 Vecka 46 Måndag 10/11 13.15-17.00 Lab 1: DNA isolering JB, AF Mendel Tisdag 11/11 08.15-10.00 Lab 1: PCR JB, AF Mendel 13.15-17.00 Lab 1: Gel elektrofores, JB, AF Mendel rening och TA-kloning Onsdag 12/11 10.15-15.00 Lab 1: Transformation JB, AF Mendel Torsdag 13/11 08.15-10.00 Lab 1: Kontroll av JB, AF Mendel transformation och start av övernatts E. coli kulturer 1 2014-10-30 Fredag 14/11 Gener och Genuttryck 08.15-15.00 Lab 1: Isolering av plasmider, NBIC47 JB, AF Mendel restriktionsanalys och provberedning för sekvensanalys Vecka 47 Måndag 17/11 10.15-12.00 F5: Kromosomsegr. (K7) JE BL33 Tisdag 18/11 13.15-15.00 F6: Transkription (K8) JE BL34 15.15-17.00 S4: Journal Club 1 JE BL34 13.15-15.00 F7: Reglering av transkr. (K9) JE BL34 15.15-17.00 F8: RNA processing (K10) JE BL34 Torsdag 20/11 08.15-10.00 F9: Translation (K11) JE BL33 Fredag 21/11 08.15-10.00 S5: Experim. App 2 (K 7-11) JE BL34 10.15-12.00 F10: Metoder för RNA analys JE BL34 13.15-15.00 S6: Veckans höjdpunkter 2 Grupp 3-4, JE Bikupan Onsdag 19/11 Vecka 48 Måndag 24/11 10.15-17.00 Lab 2: Isolering av RNA JB, AF Mendel Tisdag 25/11 08.15-10.00 Lab 2: Kontroll av RNA JB, AF Mendel 13.15-17.00 kvalitet och cDNA syntes. 10.15-17.00 Lab 2: PCR (för endpoint RT- JB, AF Mendel Onsdag 26/11 PCR) och gelelektrofores Torsdag 27/11 08.15-10.00 Lab 2: Real time PCR (Gr. ?) JB, AF Mendel Fredag 28/11 09.15-12.00 Lab 2: Real time PCR (Gr. ?) JB, AF Mendel 13.15-15.00 S7: Journal Club 2 JE BL33 19.45 Deadline för rapport Lab1 Vecka 49 Måndag 1/12 10.15-12.00 F11: Genetisk kartering JH BL33 Tisdag 2/12 08.15-10.00 F12: Gener i populationer JH BL33 13.15-15.00 Lab 2: Real time PCR JB, AF BL31 (uträkningar) Onsdag 3/12 10.15-12.00 L1: Genetisk kartering JH BL34 13.15-15.00 F13: Reglerande RNA (K13) JE BL34 2 2014-10-30 Gener och Genuttryck NBIC47 15.15-17.00 Eget arbete: Uppgift 1 BL34 Torsdag 4/12 08.15-10.00 Eget arbete: Uppgift 1 BL33 Fredag 5/12 10.15-12.00 S8: Veckans höjdpunkter 3 Grupp 5-6, JE 13.15-15.00 F14: Evolutionära JH förändringar i DNA- BL34 BL34 sekvenser 19.45 Deadline för rapport Lab2 Vecka 50 Måndag 8/12 10.15-12.00 S9: Signaler från selektion JH BL33 13.15-15.00 F15: Proteiner – expression JE BL33 JH BL33 och detektion Tisdag 9/12 13.15-15.00 F16: Genome wide association studies Onsdag 10/12 10.15-17.00 Lab 3: Western blot (dag 1) JB, AF Mendel Torsdag 11/12 08.15-10.00 L2: Genetisk analys JH BL33 Fredag 12/12 08.15-15.00 Lab 3: Western blot (dag 2) JB, AF Mendel JE BL33 Vecka 51 Måndag 15/12 8.15-10.00 F17: Cellulär respons vid DNA-skador (K15) 10.15-12.00 S10: Veckans höjdpunkter 4 Grupp 7-8, JE BL33 Tisdag 16/12 08.15-10.00 F18: Homolog rekomb. (K16) JE BL33 Onsdag 17/12 13.15-17.00 S11: Muntliga presentationer JE BL33 av projekt Torsdag 18/12 08.15-10.00 F19: Mobilt DNA (K17) JE BL33 Fredag 19/12 9.15-12.00 S12: Forskning på IFM JB BL34 JE, JH Odén Biologi. Vecka 3 Tisdag 13/1 13.15-15.00 Frågestund Fredag 16/1 08.00-13.00 Tentamen 3 2014-10-30 Gener och Genuttryck NBIC47 Examination: Skriftlig tentamen (U, 3, 4, 5) 9 hp Laborationer (U, G) 4 hp 2 hp Seminarieuppgifter (U, G) Det är obligatoriskt deltagande på laborationer och seminarier. Kursbok Molecular Biology (andra upplagan) av Craig, Cohen-Fix, Green, Greider, Storz och Wolberger; Oxford University Press (2014). Följande kapitel ingår i kursen: 4-19. Kurslitteraturen består även av vetenskapliga artiklar. Kursansvarig Johan Edqvist, IFM Biologi [email protected] Tel: 281288, 073-6263843 Lärare Johan Belteky IFM Biologi [email protected] Amir Fallahshahroudi [email protected] Jenny Hagenblad, IFM Biologi [email protected] 4