BIO 800/BIO810 Identifiering av lipidfosfataser i Arabidopsis
Bakgrund: Membranlipider i eukaryoter syntetiseras huvudsakligen i det endoplasmatiska retiklet.
Syntesen börjar med att två fettsyror estereras till glycerol-3-fosfat, vilket ger upphov till den enkla
fosfolipiden fosfatidinsyra. Produkten kan antingen användas direkt till vidare syntes eller så klipps
fosfatet bort. Huruvida fosfatet klipps bort eller inte avgör vilken vidare syntesväg lipiden går in i. Om
fosfatet klipps bort kan produkten till exempel fungera som substrat för bildningen av de lipider som
bygger upp kloroplastens membraner i högre växter. Trots att fosfatidinsyrafosfataset är ett så viktigt
enzym i lipidsyntesen och en viktig förgreningspunkt i lipidsyntesen, har enzymet inte identifierats i
förrän alldeles nyss i däggdjur och i jäst. Om hur det förhåller sig på molekylär nivå i högre växter
finns det fortfarande inget publicerat. Modellväxten Arabidopsis thalianas genom innehåller två gener
med stor likhet till genen som kodar för fosfataset i jäst.
Uppgift: Att undersöka om dessa två gener i Arabidopsis verkligen är fosfatidinsyrafosfataser. I
uppgiften ingår genkloning, expression i heterologt system, proteinrening och in vitro-assays för
fosfatasaktivitet samt karakterisering av Arabidopsismutanter. I uppgiften ingår molekylärbiologiska,
biokemiska metoder samt arbete med transgena växter.
Kontakta:
Mats Andersson
[email protected]
031-786 4802
Henrik Tjellström
[email protected]
031-786 3757
