Undersökning av funktionen hos två unika växtgener
Carl-Johan Simola
Inom växtgenetik är en växt kallad Arabidopsis den dominerande modellorganismen, dvs. man
utför de flesta experiment på denna. Arabidopsis thaliana är det fullständiga latinska namnet och
på svenska heter växten backtrav. Varför är just Arabidopsis så populär då? Jo, Arabidopsis har
flera egenskaper som uppskattas vid laborativt arbete: den är väldigt liten vilket gör den lätt att
hantera inne på laboratoriet, den förökar sig snabbt, och den kan transformeras. Transformera
innebär att man tillför DNA från en bakterie kallad Agrobacterium tumefaciens. I och med
möjligheten att transformera Arabidopsis finns kan man förändra växten på en hel rad olika sätt,
man kan stänga av olika gener, man kan förändra en gen så den är “påslagen” hela tiden för att
nämna några spännade modifikationer.
I detta examensarbete har jag undersökt två speciella gener i Arabidopsis, kallade ATHB5 och
ATHB6. ATHB är en förkortning av det engelska gennamnet : Arabidopsis thaliana homeobox
gene. Dessa ATHB gener är en del av en större familj gener som hittills bara påträffats i växter.
Man vet att produkten av dessa gener är transkriptionsfaktorer, dvs. protein som styr andra gener.
Jag har undersökt ATHB5 och ATHB6 för att konstatera just vilka gener de styr.
Jag har visat att ATHB5 reglerar en gen som heter Plant defensin gene 1.2 (PDF1.2) när växterna
behandlas med hormonet jasmonat. Däremot regleras PDF1.2 av ATHB6 när man behandlar
växterna med ett annat växthormon (Acc). Det är väldigt spännade att samma gen styrs av två
olika transkriptionsfaktorer vid olika behandlingar. Men märk väl att ATHB5 och ATHB6 är nära
besläktade! För att försöka förstå på vilket sätt ATHB5 och ATHB6 reglerar PDF1.2 så
undersökte jag ytterligare en gen ERF1 vars produkt (Ethylen response factor 1) man vet
påverkar PDF1.2. Min förhoppning var att finna ett samband mellan ATHB-generna och ERF1
men tyvärr fann jag inget sådant.
Examensarbete i biologi, 20p, VT 2004
Instutionen för biologisk grundutbildning och
Instutionen för evolution, genomik och systematik.
Handledare: Kerstin Nordin-Henriksson
