Evolution, del 2: Evolutionsprocesser och förändringar i det genetiska materialet Jessica Abbott Forskare Evolutionär Ekologi Naturlig selektion • Alleler som ger bättre överlevnad och/eller reproduktionsförmåga ökar i frekvens Generation 1: 16 individer •8 blå, 8 grön Parning Generation 2: 16 individer •4 blå, 12 grön Fixering • All evolution är allelsubstitutioner Typer av mutationer • Punktmutation Typer av mutationer • Punktmutation: sickle cell anemi Typer av mutationer • Frameshift Typer av mutationer • Frameshift: Huntingtons sjukdom Typer av mutationer • Invertering Typer av mutationer • Invertering: In(3R)Payne mel sub Typer av mutationer • Duplicering Typer av mutationer • Duplicering: globiner Rekombination • Leder till snabbare evolution Rekombination • Utnyttjar den stående genetiska variansen Rekombination • Utnyttjar den stående genetiska variansen • Olika vägar till samma fenotyp Horisontell genöverföring • ~17% horisontellt överförda gener hos E. coli Horisontell genöverföring • ~17% horisontellt överförda gener hos E. coli • Antibiotikaresistens Horisontell genöverföring • ~17% horisontellt överförda gener hos E. coli • Antibiotikaresistens • Biodegradaderingsprocesser Horisontell genöverföring • ~17% horisontellt överförda gener hos E. coli • Antibiotikaresistens • Biodegradaderingsprocesser • Pathogenicitet Horisontell genöverföring • ~17% horisontellt överförda gener hos E. coli • Antibiotikaresistens • Biodegradaderingsprocesser • Pathogenicitet • Överlevnad i extrema miljöer Mutationstakten • Varierar mellan organismer Mutationstakten • Substitutionstakt ≠ mutationstakt Vanliga mutationer • Melanism eller albinism Vanliga mutationer • Melanism eller albinism • Delade blad Naturlig selektion • Överlevnad: undvika predatorer, bättre på att hitta mat, osv. Sexuell selektion • Reproduktionsförmåga: hitta en partner, befruktningsförmåga, osv. Fitness • Fitness = överlevnadsförmåga + reproduktionsförmåga (gen eller individ) • Antal avkommor producerad under hela livstiden Adaptivt landskap • Vilka kombinationer av egenskaper ger högst fitness? Riktad selektion Fitness • Resulterar i ändrat medelvärde Egenskap Riktad selektion Riktad selektion Stabiliserande selektion Fitness • Resulterar i minskning av variansen Egenskap Stabiliserande selektion Stabiliserande selektion Divergent selektion Fitness • Resulterar i ökning av variansen Egenskap Divergent selektion Divergent selektion Frekvensberoende selektion • Fitness är beroende av frekvensen i populationen 1.0 Frequency 0.8 0.6 0.4 0.2 0.0 0 2 4 6 Time 8 10 12 Frekvensberoende selektion Frekvensberoende selektion Korrelerad selektion • Selektion på kombinationer av egenskaper Korrelerad selektion Korrelerad selektion Neutral evolution • Genetisk drift Neutral evolution • Grundareffekten Neutral evolution • Grundareffekten • Flaskhalsar Neutral evolution • Selektivt neutrala mutationer Principer: neutral evolution • Motoo Kimura • Substitutionsfrekvensen är konstant (0.51% / miljon år i däggdjurens mtDNA) Principer: neutral evolution • Neutrala mutationer fixeras oftare än skadliga mutationer Principer: neutral evolution • Genduplicering går före evolution av nya funktioner Principer: neutral evolution • Positiv selektion leder sällan till fixering jämfört med neutral evolution Principer: neutral evolution • ”Viktiga” sekvenser förändras långsammare än ”oviktiga” Fylogenetisk information • Den molekylära klockan Fylogenetisk information • Homologa gener • Paraloger = inom samma art • Ortologer = hos olika arter Metoder • Cytogenetiska analyser Metoder • Immunologiska metoder Metoder • Sekvenser av aminosyror Metoder • DNA-hybridisering Metoder • Restriktionskartor Metoder • DNA-sekvensering Sammanfattning • • • • All evolution = allelsubstitutioner Naturlig selektion = skillnader i överlevnad Sexuell selektion = skillnader i reproduktion Neutral evolution = fixering drivs av slumpen