1(4) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning Förteckning Komponent/undersökning System Metod/mätprincip Akondroplasi FGFR3 Akut lymfatisk leukemi (ALL) Akut myeloisk leukemi (AML) Kronisk myeloisk leukemi (KML) BCR/ABL,ETV6/RUNX1,MLL, CDKN2A(9p21), PML/RARA, RUNX1-CBFA2T1, CBFB,TCF3/PBX1 Genomiskt DNA Akut lymfatisk leukemi (ALL) TCF3-PBX1 cDNA RealtidsPCR Akut lymfatisk leukemi (ALL) ABL Akut lymfatisk leukemi (ALL) BCR-ABL cDNA Akut lymfatisk leukemi (ALL) ETV6-RUNX1 cDNA Akut lymfatisk leukemi (ALL) MLL/AF4 cDNA Akut lymfatisk leukemi (ALL), kronisk myeloisk leukemi (KML) ABL p.[T315I] Akut myeloisk leukemi (AML) CEBPA cDNA Akut myeloisk leukemi (AML) FLT3 Akut myeloisk leukemi (AML) NPM1 Akut myeloisk leukemi (AML) PML-RARA Genomiskt DNA Aneuploidi kromosom #13, 18, 21, X, Y Amnionvätska Chorionvillibiopsi (CVS) Perifert blod Genomiskt DNA PCR cDNA-sekvensering RealtidsTekniska PCR replikat ≤ 1 CT RealtidsTekniska PCR replikat ≤ 1 CT RealtidsTekniska PCR replikat ≤ 1 CT RealtidsTekniska PCR replikat ≤ 1 CT PCR Fragmentanalys DNA-sekvensering PCR Fragmentanalys PCR Fragmentanalys RealtidsTekniska PCR replikat ≤ 1 CT FISH-interfas Aneuploidi QF-PCR #13, 18, 21, X, Y Aplasia of lacrimal and salvariy glands (ALSG) FGF10 Beckwith-Wiedeman /Silver Russel 11p15 ARVC-genpanel Perifert blod Benmärg cDNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA cDNA PCR DNA-sekvensering Cellodling FISH-interfas FISH-metafas Tekniska replikat ≤ 1 CT Semikvantitiativ PCR Fragmentanalys Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA NGS-analys Ilumina Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2016-02-11 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-11 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2016-03-24 2(4) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning Förteckning Komponent/undersökning System Bestrofinopati BEST1 Bindvävssjukdomar-genpanel Genomiskt DNA CADASIL NOTCH3 Cardiofaciokutant syndrom (CFC) BRAF, KRAS, MAP2K1, MAP2K2 Charcot-Marie-Tooth typ 1A(CMT1A)/HNPP (PMP22, 17p11.2) Charcot-Marie-Tooth X typ 1 (CMTX1) GJB1 Clouston syndrom (HED2) GJB6 Costello syndrom HRAS Cystisk fibros, CFTR Diamond Blackfan Anemi (DBA) RPS19 Genomiskt DNA Duchenne, Becker (DMD/BMD) DMD Dystrofia myotonica typ 2 (DM2) CNBP (ZFN9) Erytrokeratodermia variablis (EKV) GJB3, GJB4 Familjeutredning vid NGS analys Genomiskt DNA Fragilt-X,FXTAS FMR1, Xq27.3 Genotypning Genomiskt DNA Gilbert syndrom UGT1A1 Hunter syndrom (MPSII) IDS Huntingtons sjukdom HTT Hyperkalemisk periodisk paralys SCN4A Hypokalemisk periodisk paralys CACNA1S, SCN4A Hypokondroplasi FGFR3 Hörselnedsättning (DFNB1) GJB2, GJB6 Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Metod/mätprincip PCR DNA-sekvensering NGS-analys Ilumina PCR DNA-sekvensering PCR DNA-sekvensering MLPA Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering PCR DNA-sekvensering PCR Fragmentanalys (OLA) PCR DNA sekvensering MLPA MLPA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA PCR Fragmentanalys PCR DNA-sekvensering PCR DNA sekvensering PCR Fragmentanalys PCR Fragmentanalys PCR Fragmentanalys PCR DNA-sekvensering PCR Fragmentanalys PCR DNA-sekvensering PCR DNA-sekvensering PCR DNA sekvensering PCR DNA-sekvensering MLPA Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2016-02-11 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-11 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2016-03-24 3(4) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning Förteckning Komponent/undersökning System Metod/mätprincip Ichtyos, autosomalt recessiv TGM1, TGM5, NIPAL4 ABCA12 Ichtyos, könsbunden STS Infertilitet Yq11 deletion, FMR1, CFTR Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR Fragmentanalys Kennedys sjukdom (SMAX1) AR KID syndrom GJB2 Kraniosynostoser (inkl. icke syndromatisk kraniosynostos, Apert, Crouzon, Pfeiffer och Saetre-Chotzen syndrom) FGFR1, FGFR2, FGFR3 och TWIST Kromosomanalys Genomiskt DNA PCR Fragmentanalys PCR DNA-sekvensering PCR DNA sekvensering Kromosomavvikelse Komplettering av konstitutionella rearrangemang Kronisk lymfatisk leukemi (KLL) P53/ATM, D13S319 13q24,12p11-q11 Kronisk lymfatisk leukemi (KLL) TP53 Kronisk myeloisk leukemi (KML) ABL Kronisk myeloisk leukemi (KML) BCR/ABL Genomiskt DNA Genomiskt DNA Hud, Benmärg, Perifert blod, Amnionvätska, Chorionvillibiopsi (CVS) Perifert blod Kärnförande celler Cellodling, Cytogenetisk analys Perifert blod Benmärg FISH-interfas Genomisk DNA PCR DNA-sekvensering PCR cDNA-sekvensering RealtidsTekniska PCR replikat ≤ 1 CT PCR cDNA cDNA Kronisk myeloisk leukemi (KML), Neutrofil kronisk myeloisk leukemi (NKML) BCR/ABL Long QT - genpanel cDNA MDS del(5q), EGR1 del(7q), D7S486 Mikrodeletion Subtelomera rearrangemang Mikrodeletion/mikroduplikations syndrom Subtelomera rearrangemang Perifert blod Benmärg Genomiskt DNA Perifert blod Kärnförande celler Genomiskt DNA Cellodling FISH-metafas NGS-analys Ilumina PCR DNA sekvensering Cellodling FISH-interfas FISH-metafas Cellodling FISH-metafas MLPA Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2016-02-11 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-11 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2016-03-24 4(4) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning Förteckning Komponent/undersökning System Metod/mätprincip Myeloproliferativa sjukdomar (PCV,ET,IM) CALR Myeloproliferativa sjukdomar (PCV,ET,IM) JAK2 Myeloproliferativa sjukdomar (PCV,ET,IM) JAK2 Myeloproliferativa sjukdomar, (hypereosinofilt syndrom) FIP1L1-PDGFRA Myotonia fluktuans/Paramyotonia congenita SCN4A Noonan syndrom PTPN11, SOS1, RAF1, KRAS, SHOC2 Oculodentodigital dysplasi GJA1 OTC brist OTC Genomiskt DNA PCR Fragmentanalys Genomiskt DNA RealtidsPCR Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering Perifert blod Benmärg FISH-interfas Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering PCR DNA-sekvensering Prader/Willi syndrom /Angelman syndrom 15q11-q13 Primärutredning och uppföljning av SCT/BMT patienter (Chimerismanalys) Rasopati-genpanel Genomiskt DNA Sjögren Larsson ALDH3A2 Sotos syndrom NSD1 Genomiskt DNA Spinal muskelatrofi (SMA) SMN1, SMN2 Welanders distala myopati TIA1 Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Genomiskt DNA Tekniska replikat ≤ 1 CT PCR DNA-sekvensering PCR DNA-sekvensering MLPA MLPA Genomiskt DNA PCR Fragmentanalys Genomiskt DNA NGS-analys Ilumina PCR DNA-sekvensering PCR DNA-sekvensering PCR DNA-sekvensering MLPA MLPA Genomiskt DNA Genomiskt DNA PCR DNA sekvensering Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2016-02-11 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-11 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2016-03-24