1(6) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning KG Förteckning Komponent/undersökning Akondroplasi System Genomiskt DNA FGFR3 Metod/mätprincip PCR DNA-sekvensering Akut lymfatisk leukemi (ALL) Perifert blod Cellodling Akut myeloisk leukemi (AML) Benmärg FISH-interfas Kronisk myeloisk leukemi (KML) FISH-metafas BCR/ABL,ETV6/RUNX1,MLL, CDKN2A(9p21), PML/RARA, RUNX1-CBFA2T1, CBFB,TCF3/PBX1 Akut lymfatisk leukemi (ALL) cDNA TCF3-PBX1 RealtidsPCR Tekniska replikat ≤ 1 CT Akut lymfatisk leukemi (ALL) ABL cDNA Akut lymfatisk leukemi (ALL) BCR-ABL cDNA PCR cDNA-sekvensering RealtidsPCR Tekniska replikat ≤ 1 CT Akut lymfatisk leukemi (ALL) ETV6-RUNX1 cDNA RealtidsPCR Tekniska replikat ≤ 1 CT Akut lymfatisk leukemi (ALL) MLL/AF4 cDNA RealtidsPCR Tekniska replikat ≤ 1 CT Akut lymfatisk leukemi (ALL), kronisk myeloisk leukemi (KML) cDNA RealtidsPCR Tekniska replikat ABL p.[T315I] ≤ 1 CT Akut myeloisk leukemi (AML) Genomiskt DNA CEBPA PCR Fragmentanalys DNA-sekvensering Akut myeloisk leukemi (AML) Genomiskt DNA FLT3 PCR Fragmentanalys Akut myeloisk leukemi (AML) Genomiskt DNA NPM1 PCR Fragmentanalys Akut myeloisk leukemi (AML) PML-RARA cDNA RealtidsPCR Tekniska replikat ≤ 1 CT Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2017-06-02 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-13 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2017-06-07 2(6) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning KG Förteckning Komponent/undersökning System Aneuploidi kromosom Amnionvätska #13, 18, 21, X, Y Chorionvillibiopsi (CVS) Metod/mätprincip FISH-interfas Perifert blod Aneuploidi QF-PCR Genomiskt DNA #13, 18, 21, X, Y Aplasia of lacrimal and salvariy glands (ALSG) Semikvantitiativ PCR Fragmentanalys Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering FGF10 Beckwith-Wiedeman /Silver Russel Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA NGS-analys 11p15 ARVC-genpanel Ilumina Bestrofinopati Genomiskt DNA BEST1 PCR DNA-sekvensering Bindvävssjukdomar-genpanel Genomiskt DNA NGS-analys Ilumina CADASIL Genomiskt DNA NOTCH3 PCR DNA-sekvensering Cardiofaciokutant syndrom (CFC) Genomiskt DNA BRAF, KRAS, MAP2K1, MAP2K2 Charcot-Marie-Tooth typ 1A(CMT1A)/HNPP PCR DNA-sekvensering Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR (PMP22, 17p11.2) Charcot-Marie-Tooth X typ 1 (CMTX1) DNA-sekvensering GJB1 Clouston syndrom (HED2) Genomiskt DNA GJB6 PCR DNA-sekvensering Costello syndrom Genomiskt DNA HRAS PCR DNA-sekvensering Cystisk fibros, Genomiskt DNA CFTR PCR Fragmentanalys (OLA) Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2017-06-02 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-13 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2017-06-07 3(6) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning KG Förteckning Komponent/undersökning Diamond Blackfan Anemi (DBA) System Genomiskt DNA RPS19 Metod/mätprincip PCR DNA sekvensering MLPA Duchenne, Becker (DMD/BMD) Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR DMD Dystrofia myotonica typ 2 (DM2) CNBP (ZFN9) Fragmentanalys Erytrokeratodermia variablis (EKV) Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering GJB3, GJB4 Familjeutredning vid NGS analys Genomiskt DNA PCR DNA sekvensering Fragilt-X,FXTAS Genomiskt DNA FMR1, Xq27.3 Genotypning PCR Fragmentanalys Genomiskt DNA PCR Fragmentanalys Gilbert syndrom Genomiskt DNA UGT1A1 PCR Fragmentanalys Hunter syndrom (MPSII) Genomiskt DNA IDS PCR DNA-sekvensering Huntingtons sjukdom Genomiskt DNA HTT PCR Fragmentanalys Hyperkalemisk periodisk paralys Genomiskt DNA SCN4A PCR DNA-sekvensering Hypokalemisk periodisk paralys Genomiskt DNA CACNA1S, SCN4A Hypokondroplasi PCR DNA-sekvensering Genomiskt DNA FGFR3 PCR DNA sekvensering Hörselnedsättning Genomiskt DNA PCR (DFNB1) DNA-sekvensering GJB2, GJB6 MLPA Ichtyos, autosomalt recessiv Genomiskt DNA TGM1, TGM5, NIPAL4 PCR DNA-sekvensering ABCA12 Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2017-06-02 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-13 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2017-06-07 4(6) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning KG Förteckning Komponent/undersökning Ichtyos, könsbunden System Metod/mätprincip Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR STS Infertilitet FMR1, CFTR Fragmentanalys Infertilitet Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR Mikrodeletion Y Kennedys sjukdom (SMAX1) AR Fragmentanalys KID syndrom Genomiskt DNA PCR GJB2 DNA-sekvensering Kraniosynostoser (inkl. icke syndromatisk kraniosynostos, Apert, Crouzon, Pfeiffer och Saetre-Chotzen syndrom) Genomiskt DNA PCR DNA sekvensering FGFR1, FGFR2, FGFR3 och TWIST Kromosomanalys Hud, Benmärg, Perifert blod, Amnionvätska, Chorionvillibiopsi (CVS) Cellodling, Kromosomavvikelse Perifert blod Cellodling Komplettering av konstitutionella rearrangemang Kärnförande celler FISH-metafas Kronisk lymfatisk leukemi (KLL) Perifert blod FISH-interfas P53/ATM, D13S319 Benmärg Cytogenetisk analys 13q24,12p11-q11 Kronisk lymfatisk leukemi (KLL) Genomisk DNA TP53 PCR DNA-sekvensering Kronisk myeloisk leukemi (KML) ABL cDNA Kronisk myeloisk leukemi (KML) BCR/ABL cDNA PCR cDNA-sekvensering RealtidsPCR Tekniska replikat ≤ 1 CT Kronisk myeloisk leukemi (KML), Neutrofil kronisk myeloisk leukemi (NKML) cDNA PCR BCR/ABL Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2017-06-02 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-13 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2017-06-07 5(6) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning KG Förteckning Komponent/undersökning Long QT - genpanel System Genomiskt DNA Metod/mätprincip NGS-analys Ilumina PCR DNA sekvensering MDS Perifert blod Cellodling del(5q), EGR1 Benmärg FISH-interfas del(7q), D7S486 FISH-metafas Mikrodeletion Perifert blod Cellodling Subtelomera rearrangemang Kärnförande celler FISH-metafas Mikrodeletion/mikroduplikations syndrom Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR Subtelomera rearrangemang Myeloproliferativa sjukdomar (PCV,ET,IM) Fragmentanalys CALR Myeloproliferativa sjukdomar (PCV,ET,IM) Genomiskt DNA RealtidsPCR Tekniska replikat JAK2 ≤ 1 CT Myeloproliferativa sjukdomar (PCV,ET,IM) Genomiskt DNA PCR DNA-sekvensering JAK2 Myeloproliferativa sjukdomar, (hypereosinofilt syndrom) Perifert blod FISH-interfas Benmärg FIP1L1-PDGFRA Myotonia fluktuans/Paramyotonia congenita SCN4A Genomiskt DNA Noonan syndrom Genomiskt DNA DNA-sekvensering PTPN11, SOS1, RAF1, KRAS, SHOC2 Oculodentodigital dysplasi PCR PCR DNA-sekvensering Genomiskt DNA GJA1 PCR DNA-sekvensering OTC brist Genomiskt DNA OTC PCR DNA-sekvensering MLPA Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2017-06-02 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-13 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2017-06-07 6(6) Klinisk genetik Ackrediteringens omfattning KG Förteckning Komponent/undersökning Prader/Willi syndrom System Metod/mätprincip Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR /Angelman syndrom 15q11-q13 Primärutredning och uppföljning av SCT/BMT patienter Fragmentanalys (Chimerismanalys) Rasopati-genpanel Genomiskt DNA NGS-analys Ilumina PCR DNA-sekvensering Sjögren Larsson Genomiskt DNA ALDH3A2 PCR DNA-sekvensering Sotos syndrom Genomiskt DNA NSD1 PCR DNA-sekvensering MLPA Spinal muskelatrofi (SMA) Genomiskt DNA MLPA Genomiskt DNA PCR SMN1, SMN2 Welanders distala myopati TIA1 DNA sekvensering Utfärdad av: Kim Nordström (nok018) Gäller från: 2017-06-02 Godkänd av: Maria Sitell Dokumentnr: 1276-13 Originalet lagras elektroniskt. Endast dokumentstyrd kopia gäller. Utskriftsdatum: 2017-06-07