Lednings- och verksamhetsstöd
HANDLÄGGARE
DATUM
Anna Lundström
FoU-centrum
2010-09-22
DIARIENR
Ansökningsformulär
FoU-medel för år 2008
Namn:
Hanna Gunnarsson
Projekttitel:
Genuttryck vid akut koloncancer
Sammanfattning av sökt forskningsprojekt: (max 1500 tecken)
Bakgrund:
Kolorektal cancer är ett folkhälsoproblem i hela västvärlden. I Sverige
diagnosticeras årligen ca 5000 individer, vara ca 3500 cancrar är lokaliserade
i kolon. Rektal cancer har så gott som aldrig ett akut förlopp, medan det
däremot är tämligen vanligt för koloncancer. Beroende på hur ”akut”
definierats i olika studier, skiljer sig andelen patienter i den akuta gruppen
mellan 17% och 33% (1-3). Således utgör gruppen en kvalitativt tung börda
för sjukvården.
Patienter som opereras akut har en sämre prognos än de som opereras
elektivt. Detta kan orsakas av en sämre stadiedistribution och i den akuta
gruppen uppnås en mindre andel kurativt syftande operationer (4). Även
bland de kurativt opererade akuta patienterna är dock den stadiespecifika
överlevnaden sämre jämfört med elektiva (5). Patienter med koloncancer
vilken opereras akut har en känt kortare symtomduration jämfört med den
elektiva gruppen (6). Det finns således anledning att misstänka att den akuta
gruppen utgör en mer aggressiv subentitet av koloncancer. Det är dock
fortfarande helt okänt om det är tumörgenetiska faktorer/ proliferativa
skillnader, immunologisk kompetens hos patienten, komorbiditet eller något
annat som orsakar detta. Det är också oklart om psykologiska
försvarsmekanismer med förträngade av symtom, sämre
perceptionssförmåga, svårtillgänglig sjukvård eller liknande kan bidra till att
sjukdomen progredierar till ett akut skede.
Totalt sett är således den bakomliggande orsaken till ett akut förlopp hos
vissa koloncancerpatienter ytterst lite utforskad och överhuvudtaget inte alls
i molekylärbiologiska termer. Det är således oklart om akut koloncancer kan
betraktas som en egen ”genetisk” entitet eller om denna viktiga subgrupp har
sitt ursprung i helt andra variabler.
Microarray (DNA chip) är en nu väletablerad metod (7) som man använder
sig av inom genetisk forskning för att kartlägga uttrycket hos ett stort antal
gener, exempelvis för att jämföra olika vävnadsmaterial genetiskt. Då hela
genomet undersöks vid microarray, är det möjligt att se vilka gener som är
uttryckta för att jämföra grupper / påvisa heterogenitet på genetisk nivå som
kan tänkas samvariera med olika kliniska data. Det skulle således vara
möjligt att med denna metod upptäcka den / de gener som skiljer en akut
FoU-Centrum
Fax: 016-10 54 30
Kungsgatan 41
631 88 Eskilstuna
Tfn: 016-10 54 00
E-mail [email protected]
ORG NR 232100-0032 · Y:\Ledningsstab\Enheter\FoU-Centrum\Enheten för FoU\Sektioner\Sektionen för opererande spec\FoU-projekt\2008\Gunnarsson
Hanna\Ansökningsformulär FoU -08 Hanna genetik.doc · Utskriftsdatum: 2010-09-22 13:16
SID 1(1)
Lednings- och verksamhetsstöd
HANDLÄGGARE
DATUM
Anna Lundström
FoU-Centrum
2010-09-22
DIARIENR
koloncancer från en icke-akut, om det föreligger en sådan genetisk
skillnad.
Syfte och problemställningar:
Syftet är att kartlägga om akut koloncancer skiljer sig i sitt genuttryck från
elektiv koloncancer, dvs identifiera gener som är upp / nedreglerade vid akut
koloncancer.
Skiljer sig genuttrycket vid akut och elektiv koloncancer?
Material och metod:
Under 2006-7 har en omfattande journalstudie genomförts vid
Kirurgkliniken, Mälarsjukhuset. Sex hundra journaler på patienter opererade
på grund av koloncancer under ????åren 1996-2006 ???har granskats.
”Akut” koloncancer definierades genom tre tydliga kriterier
1)
patienten sökt och lagts in via akutmottagningen, Eskilstuna
2)
opererad inom tre dygn
3)
ett akut tillstånd verifierat vid operation
Cirka 100 patienter med akut koloncancer kunde identifieras på detta sätt. Ur
den kvarvarande
Gruppen av elektiv koloncancer drogs slumpmässigt 100 kontroller. Ur
dessa två grupper har man sedan slumpmässigt valt tre stycken ur varje
grupp.
För var och en av dessa sex patienter har lagrat paraffinbäddat tumormaterial
inhämtats ifrån Patologkliniken, Eskilstuna. Detta har sänts till Institutionen
för onkologi och patologi, Karolinska Institutet (dr Moshfegh) för analys.
Erforderlig RNA är där nu extraherat och analysarbete pågår.
Tidsplan:
Materialet förväntas vara färdiganalyserat på laboratoriet i slutet av
november. Efter detta ska resultatet sammanställas i samråd med dr
Moshfegh och en artikel skrivas. För att detta ska kunna göras på
tillfredsställande sätt behövs viss tid avsatt endast för detta ändamål.
Kostnadskalkyl:
Arbetstid motsvarande 2 v samt kostnad för språkgranskning av färdig
artikel.
Etisk bedömning:
Projektet bedömt och godkänt vid etikkommittéen i Stockholm D-nr 2007xx-xx
Betydelse:
Någon liknande studie finns inte enligt vår kännedom. Vi bedömer därför att
studien är av betydelse i syfte att klarlägga om den kliniskt så viktiga
gruppen akut koloncancer har genetisk bakgrund eller är betingat av andra
faktorer. Skulle det visa sig att akut koloncancer skiljer sig genetiskt från
elektiv koloncancer kan detta möjligen bidra till en fördjupad kunskap kring
genetiken vid kolorektal cancer som helhet.
SID 2(2)
Lednings- och verksamhetsstöd
HANDLÄGGARE
DATUM
Anna Lundström
FoU-Centrum
2010-09-22
DIARIENR
Referenser:
1. Scott NA, Jeacock J, Kingston RD. Risk factors in patients presenting as
an emergency with colorectal cancer. Br J Surg 1995;82(3):321-3.
2. Mella J, Biffin A, Radcliffe AG, Stamatakis JD, Steele RJ. Populationbased audit of colorectal cancer management in two UK health regions.
Colorectal Cancer Working Group, Royal College of Surgeons of England
Clinical Epidemiology and Audit Unit.
Br J Surg 1997;84(12):1731-6.
3. Jestin P PL, Gunnarsson U. Akutoperation vid koloncancer - är det farligt?
In: Kirurgveckan; 2002; Eskilstuna; 2002
4. McArdle CS, Hole DJ. Outcome following surgery for colorectal cancer.
Br Med Bull 2002;64:119-25.
5. McArdle CS, Hole DJ. Emergency presentation of colorectal cancer is
associated with poor 5-year survival. Br J Surg 2004;91(5):605-9.
6. Olsson L, Bergkvist L, Ekbom A. Symptom duration versus survival in
non-emergency colorectal cancer. Scand J Gastroenterol 2004;39(3):252-8
7. Roberts ML, Kottaridis SD, Interpreting microarray data: towards the
complete bioinformatics toolkit for cancer. Cancer Genomics Proteomics.
2007 Jul-Aug;4(4):301-8.
Uppgifter om sökanden – kortfattad meritförteckning:
Leg läkare.
Vikariat 6 mån onkologkliniken, MSE.
Vikarierar nu på kirurgkliniken, NLN.
En doktorandansökan planeras under våren -08.
Bifogade bilagor:
De ifyllda anmälnings- och ansökningsblanketterna, tillsammans med övriga
handlingar skickade som bifogade bilagor, måste vara FoU-centrum
tillhanda som senast den 19 oktober 2007, under adress:
[email protected]
SID 3(3)
