UVIS
Ett nationellt center för
avbildning med tyngdpunkt
inom translationell medicin
Jan Grawé
R db kl b t i t
Rudbecklaboratoriet
Uppsala Universitet
Science For Life Laboratory (SciLifeLab)
En satsning på storskalig livsvetenskap
Två center i ett: Stockholm – Uppsala
Ett nationellt servicecenter för storskalig biologi
Teknologibas för bl a grundläggande och translationell medicinsk biologi
Nära samarbete med sjukvården
Effektiv kontaktyta mot industri och samhälle
Stark nod inom Europeiska forskningsinfrastrukturer
Science For Life Laboratory skall kunna:
•
•
•
Utveckla och tillhandahålla avancerade teknologier
Etablera nya standarder och andra resurser
Genomföra stora projekt , t ex
•
Allt snabbare, riktad
,
DNA sekvensningg
•
Mer specifik diagnostik baserad på DNA tester Ökad förståelse för sjukdomsmekanismer
•
Hitta sjukdomsgener hos husdjur
•
Nya inblickar i genetiska sjukdomsmekanismer
Förbättrad diagnostik och nya behandlingsmöjligheter
•
Mäta proteiner och andra biomarkörer i blod
•
Nya insikter i sjukdomsprocesser; sjukdomsprocesser;
Möjligheter till tidig diagnostik och klinisk uppföljning
•
Avbilda gener, proteiner och komplex i vävnader
Avbilda gener, proteiner och komplex i vävnader
•
Kartläggning av proteiner och deras funktioner; Hjälp vid läkemedelsutveckling och inställning av behandling
Science for Life Center Uppsala
Vision: Internationellt ledande center som utvecklar, tillämpar och tillgängliggör
storskalig teknologi för biovetenskap med fokus på translationell medicin
UVIS
Uppsala/Umeå Comprehensive Cancer Consortium (U‐CAN) 1) Vad kännetecknar patienter som kommer att svara på en viss behandling?
2) Vilka mekanismer förklarar resistens mot olika typer av cancerbehandling?
Cancer‐
behandling
6 000 pt/år
p/
Biopsier
p
Utfall
Biopsier
p
Proteinbiomarkörer
Sekvensering av gener
Sekvensering av gener
Patientnytta
Biobank
Forskning
Vård
UVIS
Ett nationellt center för avbildning
• Fokus på translationell, patientnära medicin
• Kapacitet
K
it t för
fö storskalig
t k li screening
i
• Utrustat för med bästa möjliga teknik för
detaljavbildning av molekylär lokalisation och interaktion
i celler och vävnader
•Utveckling av nya molekylära avbildningstekniker
(PLA PLP) Ulf Landergren
(PLA,
Landergren, Mats Nilsson
• Komplementära tekniker tillåter användaren att
använda den för ett specifikt syfte bäst anpassade
utrustningen
UVIS
Fokus på translationell medicin innebär att en stor del av arbetet kommer
att utföras på patientmaterial
•Nära samarbete med kliniker och biobankresurser
•Tillgång till metodik som är känslig nog att kunna studera t ex
proteininteraktioner vid låga (naturligt förekommende)
expressionsnivåer
•Tekniker för avbildande screening av mycket stora mängder av
patientprover
p
p
inklusive datahantering
g
•Metoder för selektion av relevant materiel
•Tekniker för högupplöst avbildning
•Tekniker för realtidsmikroskopi i celler, vävnader, och vävnadsmodeller
•Tekniker för avancerad bildanalys, infrastruktur för bildhantering
UVIS
Ursprungsmaterial
Direkta
patientprover
Biobanksprover:
Prover från
försöksorganismer
BBMRI.SE
U-CAN biobank
BBMRI.EU
Screening och selektion
N
Nanoskopi
k i
Till proteomikgenomikplattformar
ik l ttf
R ltid ik
Realtidsmikroskopi
k i
Bildanalys – databehandling och lagring
UVIS
Screening
g och
preparativa tekniker
Molekylär
nivå
Tekniker för
funktionella studier;
Överbryggande
tekniker
Tekniker för hög
g
upplösning och
kvantifiering
Elektron‐
mikroskopi
Subcellulära
strukturer
Cellen
HCS‐HTS Preparativ
scanners
mikroskopi ‐
p
LEAP Preparativ
flödes‐
cytometri
Cellens
närområde Mikro‐
Avbildande flödes‐
cytometri
Snabb konfokal/
multifoton‐
mikroskopi
Superresolution‐
mikroskopi
Konfokal ‐
Analytisk y
mikroskopi
flödes‐
cytometri
dissektions‐
mikroskopi
Vä
Vävnad
d
Organ
Teknisk beredskap för icke kommersiellt tillgängliga lösningar
Bildbehandling
Multifoton‐
M
ltif t
mikroskopi
Integrated PET-MR scanner for
oncological neurological and
oncological,
cardiovascular research
Applicant
Håkan Ahlström, Professor UU
Co-applicant
Bengt Långström, Professor UU
Bengt Glimelius, Professor UU
Elna-Marie Larsson, Professor UU
Katrine Åhlström-Ricklund
Åhlström Ricklund UmU
Malignant melanoma
Whole-body
diffusion MR
Whole-body
FDG-PET
UVIS: Till gagn för fler än SciLifeLab
Förutom SciLifeLab kommer ett antal strategiska
forskningssamarbeten att ha stor användning av UVIS:
U-CAN
Utveckling
g av biomarkörer för cancer. Uppsala-Umeå
pp
Exodiab
Förutsäga risk för
för, samt utveckla nya sätt att
behandla och förebygga diabetes. Lund-Uppsala
StemTherapy
Driva stamcellsforskningen mot tillämpning på
patienter för att lindra och bota kroniska sjukdomar
och skador
skador. Lund-Uppsala
Lund Uppsala
Stem
St
Therapy
BBMRI.SE
SciLifeLab
UVIS
BBMRI.SE
Svenskk nod
S
d av europeiska
i k BBMRI
BBMRI, Biobanking
Bi b ki and
d Exodiab
Biomolecular Resources Infrastructure.
U-CAN
Öppen
tillgång
Cellanalysfaciliteten vid Rudbecklaboratoriet:
basen för UVIS
Etablerad 2002, en existerande väl fungerande enhet
Expanderande verksamhet
verksamhet.
Instrumentering inom avbildande och kvantitativ cellanalys
Öppen för grupper inom och utom universitetet
Lång erfarenhet av att styra verksamheten efter
användarnas
ä d
b
behov
h
Kontinuerlig nyanskaffning och uppgradering av utrustning
Ca 35 aktiva användare/projekt,
varav 80-90% från medicinska fakulteten, UU
Upparbetade kontakter med såväl Centrum för Bildanalys,
kliniska användare och andra grupperingar med bildanalysintresse.
http://www.rudbeck.uu.se/cellanalys
UVIS: tekniker tillgängliga idag vid Cellanalysfaciliteten
Screening och
preparativa tekniker
Molekylär
nivå
Tekniker för
funktionella studier;
Överbryggande
tekniker
Tekniker för hög
upplösning och
kvantifiering
Elektron‐
mikroskopi
Subcellulära
strukturer
C ll
Cellen
HCS‐HTS Preparativ
scanners
mikroskopi ‐
mikroskopi LEAP Preparativ flödes‐
cytometri
Cellens
närområde Mikro‐
dissektions‐
mikroskopi
Superresolution‐
mikroskopi Konfokal ‐
mikroskopi
Analytisk Snabb flödes‐
konfokal/ cytometri
multifoton‐
multifoton
mikroskopi
Multifoton‐
mikroskopi
Avbildande flödes‐
cytometri
Vävnad
Organ
Teknisk beredskap för icke kommersiellt tillgängliga lösningar
Bildbehandling
UVIS
• Multimodal visualisering
• Väl integrerat med komplementära tekniker Väl integrerat med komplementära tekniker
och resurser. (flödescytometri, biobank, bildanalys)
• SciLifeLab samt ett flertal andra strategiska forskningssatsningar som starka användare
• Med basen i en etablerad multi‐användar
Med basen i en etablerad multi‐användar
facilitet
