Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Varför dör bakterier av quinolon-antibiotika? Lena Frankenberg Quinoloner är en klass av antibiotika som är mycket effektiva mot bakterieinfektioner men vars användning tyvärr leder till uppkomst av resistenta bakteriestammar. Detta hänger samman med hur quinoloner verkar inne i bakteriecellen. Quinolonernas molekylära verkningsmekanism är endast delvis känd, men klart är att deras intracellulära mål är enzymet gyras. Gyras är ett protein som är viktigt för alla cellulära reaktioner där DNA ingår. Quinoloner bildar ett komplex med antibiotika, gyras och DNA. Detta komlex stoppar replikationen och det bildas fria, dubbelsträngade DNA ändar i cytoplasman. Det är dessa DNA-ändar som leder till celldöd, men det är också dessa fria ändar som ibland parar ihop sig på helt nya sätt och leder till en mutation i bakterien. Denna mutation kan göra bakterien resistent mot quinoloner. Hur bildas då dessa fria DNA-ändar? Man tror att ett cellulärt reparations-protein gör ett försök att få igång replikationen igen, kanske genom att skära ut quinolon-gyras-DNAkomplexet. I bakteriecellen finns en hel del reparationsproteiner som skulle kunna delta i ett försök att skära ut quinolon-komplexet. RuvAB och RuvC är två sådana proteiner som i vissa fall kan orsaka celldöd när de försöker reparera en skada i bakteriens arvsmassa. RecG är ett protein som verkar på liknande sätt. RecN är ett annat protein med okänd funktion. Vi beslutade oss därför att göra det omöjligt för bakterierna att framställa de här proteinerna för att se vad som skulle hända. Dessutom slog vi ut genen för ett proteas, Lon, som är ett enzym som bryter ned andra enzymer när det är något fel på dem.Till sist gjorde vi ett försök till att med hjälp av slumpvis införda mutationer inaktivera olika gener i cellerna och sedan välja ut den klon (cell-linje) som klarade quinolonbehandling bäst. Vi kom fram till att de proteiner som vi testat inte verkar vara ansvariga för att celler dör när de behandlas med quinoloner. Det var till och med så att bakterier som inte kunde framställa Ruv-proteinerna var ännu känsligare för quinoloner än bakterier som kunde framställa Ruvproteinerna. Den slumpvisa mutagenesen ledde till att vi fick fram en klon som tålde quinoloner bättre än ursprungsstammen (vildtypen). Detta kan vara en intressant utgångspunkt för vidare studier. Swedish official title: Quinoloners verkningsmekanism Swedish credits: 20p E-mail address of first author: [email protected] Supervisor: Blanka Rutberg, Department of Microbiology Submission date/time: 1998-11-19 Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Mechanism of quinolone action: Search for a cellular factor involved in cytotoxicity Lena Frankenberg Biology, Microbiology Spring 1998 Abstract in English It has been suggested that bacterial killing by oxolinic acid occurs by formation of doublestrand DNA breaks, as a result of an attempt to excise the gyrase-quinolone complex that blocks replication forks. A bacterial factor is thought to intervene in this killing. In this project we investigated the impact of mutations in the ruvAB and ruvC genes, as well as in the recG, recN and lon genes on bacterial killing by oxolinic acid. No negative effects on quinolone killing were detected, and defects in recombination clearly enhanced the killing.