KARLSTADS UNIVERSITET
Avd för kemi och biomedicinsk vetenskap
Tentamen i Molekylär Cellbiologi 7,5 hp (5p)
BMGBM0 (BMC210)
Datum: 2011-08-26
Tid:
Sal:
8.15-13.15
Se anslagstavlan i universitetets huvudentré
Lärare: Jonny Wijkander (0709-547197) Maria Rova och Patrik Holm
Skriv namn och personnummer på alla papper!
Mer än en fråga får besvaras på varje svarspapper men börja på nytt
svarspapper för varje tentators frågor.
Studenter som är registrerade på BMC210
besvarar inte fråga märkt med *
Maxpoäng
100p (BMGBM0) 98p (BMC210)
Godkänd
50 %
Väl godkänd 75 %
Lycka till
Sekreterare: Alice Svedung / 700 17 35
Namn:…………………………………….. Personnummer:………………………
Patrik´s frågor
1. Definiera de tre olika proteindomäntyperna, strukturell, funktionell och topologisk.
(3p)
2. Vilka proteinfamiljer står för fosforylering respektive defosforylering av proteiner?
(2p)
3. Variationen i antigenspecificitet hos antikroppar åstadkoms genom V-J och V-D-J
rearrangering. Dessutom kan de korta DNA-segmenten som utgör skarvarna mellan
gensegmenten ge ytterligare variation. På vilka olika sätt varieras dessa korta gensegment?
(2p)
4. Vad innebär begreppen deletional joining och inversional joining i V-D-J
rearrangeringsammanhang?
(2p)
5. Loss-of-heterozygosity (LOH) är en mycket viktig mekanism i uppkomsten av cancer.
Beskriv de båda sätten som LOH kan uppkomma.
(4p)
6*. Nitrosurea är ett tumörläkemedel som tillhör de alkylerande föreningarna.
Läkemedlet används framförallt till en viss typ av cancer, vilken och varför?
(2p)
Maria´s frågor (börja på nytt svarspapper)
7.Vår arvsmassa kan skadas på flera olika sätt. Några exempel är: 1) Deaminering av en kvävebas,
2) Depurinering av en nukleotid och 3) Bildandet av en pyrimidindimer. Beskriv hur dessa skador
uppkommer och tala om vilken typ av reparations-system som används för att reparera dem. 6p
8.Beskriv organisationen av de kodande delarna av en typisk eukaryot gen och förklara vad som
menas med alternativ splicing.
3p
9.Modifiering av histonproteiner medverkar till reglering av genuttrycket i en eukaryot cell. Ett
exempel är metylering av lysinrester. Beskriv vad sådan metylering kan leda till och nämn också
tre andra typer av genreglerande modifieringar av histonproteinerna.
5p
10.Genuttryck regleras ofta på transkriptionsnivå och då spelar transkriptionsfaktorer en stor roll.
a) Gör en kort, definitionsliknande, beskrivning av vad en transkriptionsfaktor är.
2p
b) Ge exempel på en eukaryot transkriptionsfaktor.
1p
c) Namnge och beskriv något DNA-bindande motiv som är vanligt förekommande i
transkriptionsfaktorer.
3p
d) Vad kallar man med ett gemensamt namn de reglerande sekvenser i DNA´t som oftast är
associerade med ökad transkription och som finns på stort avstånd (upp till 50.000 baser) från
promotorn?
1p
11.Tala om vad ett miRNA är och beskriv hur det fungerar.
3p
12.De flesta ämnen transporteras ut ur eller in i cellen mha membranproteiner. Beskriv vad som
karaktäriserar en symporter och en antiporter, jämför också vilka likheter och skillnader som finns
mellan dem. 4p
Jonny´s frågor. (Börja på nytt svarspapper)
13. Proteiner syntetiseras ju som du vet på ribosomer men dessa kan vara antingen fria ribosomer
eller ribosomer som binder in till ER. (totalt 5p)
a) Vad är det som avgör var det syntetiseras?
b) Var syntetiseras ett peroxisomprotein?
c) Var syntetiseras ett lysosomprotein?
d) Var syntetiseras ett extracellulärt protein?
e) Var syntetiseras ett cytosolprotein?
14. Glykosyleringar av proteiner är mycket vanliga modifieringar av extracellulära proteiner och
plasmamembranproteiner och de sker på två olika sätt. Ge en beskrivning av hur dessa två typer
av glykosyleringar sker samt var i cellen de sker? (4p)
15. På vilka sätt skiljer sig importen av protein till mitokondrien från importen av protein till
kärnan? (3p)
16. Järn cirkulerar i blodet bundet till transferrin. Alla kroppens celler behöver järn men f. f. a.
erytropoetiska celler behöver det för att bilda hemoglobin. Upptaget av järn sker genom en
receptormedierad endocytos. Beskriv hur denna endocytos går till samt vad som händer med
järnet, transferrinet och receptorn. (4p)
17. Milrinon är ett läkemedel som ges vid mycket svår hjärtsvikt och som då resulterar i ökat
hjärtmuskelarbete. Milrinon verkar genom att hämma ett fosfodiesteras. Vad gör ett
fosfodiesteras? (1p)
18. G-protein kopplade receptorer är mycket vanliga och finns på alla typer av eukaryota celler.
Gemensamt för dem är att de inne i cellen kopplar till G-proteiner.
a) Beskriv den generella uppbyggnaden av G-proteiner och hur de aktiveras. (3p)
b) Aktivering av olika G-proteiner resulterar i förändring i koncentrationen av second messengers.
Vilka second messengers är kopplade till Gi, Gs resp. Gq och hur bildas dessa olika second
messengers? (3p)
19. Intracellulär signalering bygger på att A aktiverar B som aktiverar C osv., där A, B och C ofta
är enzymer (B är substrat för A). Ibland (ganska ofta) ingår proteiner som inte har enzymatisk
aktivitet utan fungerar som bindningsproteiner (ex. B är bindningsprotein så att A och C kan
mötas). Src homologi (SH) och pleckstrin homologi (PH) är exempel på domäner i proteiner som
kan bida till specifika motiv/molekyler och på så sätt förmedla kontakt.
a) Till vad binder proteiner som har SH2 domän? (1p)
b) Till vad binder ett protein som har SH3 domän? (1p)
c) Till Vad binder ett protein som har PH domän? (1p)
20. NF-қB (NF kappa B) är en transkriptionsfaktor som aktiveras vid bl. a. inflammatoriska
sjukdomar och ger då transkription av ett flertal olika gener. NF-қB finns normalt sett i cytosolen
men som du förstår så måste den in i kärnan för att fungera som transkriptionsfaktor. Vad måste
hända för att NF-қB skall förflytta sig från cytosolen till kärnan? (3p)
21. Mikrotubuli är en typ av cytoskelett .
a) Hur är mikrotubuli uppbyggt? (2p)
b) Ange 3 olika funktioner som mikrotubuli kan ha i en icke-mitotisk cell. (3p)
c) I mitotiska celler kan man hitta astrala mikrotubuli, överlappande mikrotubuli och kinetokor
mikrotubuli och alla 3 typerna binder med sin minusända till centrosomerna. Till vad binder
respektive typ av mirotubuli i sin plusända? (3p)
22. Ange tre saker/egenskaper som särskiljer intermediärt filament från mikrotubuli och
aktinfilament (3p)
23. Vad har aktinfilament och myosin II filament för funktion vid celldelningen? (1p)
24. För att bygga upp vävnader så måste celler vara i kontakt med varandra eller
extracellulärmatrix. Ange någon typ av transmenbranprotein som förmedlar cell-cell kontakt samt
vad det binder till inne i cellen. (2p)
25. Ange någon vävnad vars celler står i kontakt med varandra via gap junctions och vilken fördel
dessa celler har av en sådan kontakt. (2p)
26. Ange vilka av nedanstående proteiner/glykoproteiner/proteoglykaner/polysackarider som man
hittar i extracellulärmatrix? (max 3p, varje fel svar ger minus 0,5p)
Kollagen, Aktin, Myosin, Tubulin, Lamin, Elastin, Laminin, Fibronektin, Hyaluronan, Aggecan
och Protein kinas C.
27. Leverceller, eosinofiler och tarmepitelceller är alla celltyper med en begränsad livslängd. Hur
sker förnyelse/tillväxt av respektive celltyp? (3p)
28. Cyklin beroende kinaser (Cdk) är proteinkinaser som styr mycket under de olika faserna i
cellcykeln. Cdk behöver binda cykliner för att ha en möjlighet att bli aktiva men oftast räcker inte
detta. På vilka andra sätt regleras aktiviteten av Cdk? (3p)
29. Ge en beskrivning av hur cytokrom c kan inducera apoptos. (3p)
