Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Vad har Y-kromosom, mellansork och invandring gemensamt? Helena Mattisson För 2,5 miljoner år sedan började klimatet på norra halvklotet långsamt att bli kallare. Is bildades och ackumuleradesoch en istid fick sin början. Under istiden fluktuerade klimatet och nedisningar och avisningar avlöste varandra. När isen bredde ut sig dog djur- och växtarter i isens utbredningsområde. Arter i isens närhet tvingades längre söderut på grund av det allt kallare klimatet. Vissa arter tvingades så långt söderut att de blev isolerade i så kallade refugier. Exempel på sådana refugier är Spanien, Italien och Grekland. Individer som idag lever inom samma område kan ha levt i olika refugier och ha haft olika invandringsvägar efter istiden. Om individerna i de olika refugierna har varit skilda åt tillräckligt länge, har det uppkommit genetiska skillnader inom arten. Detta gör det möjligt att idag skilja individer som härstammar från de lika refugierna åt. Under avisningen fanns landbryggor över Berings sund (mellan Nordamerika och Ryssland) och mellan Danmark och södra Skandinavien. Innan dessa landbryggor översvämmades av vatten utgjorde de möjliga invandringsvägar för många arter. Med hjälp av DNA-analys har man sett att bland annat mellansork har använt dessa landbryggor för att kolonisera Nordamerika och Skandinavien. Studier av mitokondrie-DNA (mtDNA) har visat att mellansorken kan delas upp i fyra geografiskt skilda grupper baserade på skillnader i DNA:ts bassekvens. Dessa grupper kan benämnas efter sin geografiska utbredning. Det finns en västeuropeisk, en nordeuropeisk, en centralasiatisk och en nordamerikansk grupp. Mitokondrierna ärvs huvudsakligen från honan, mtDNA visar därmed släktskapet mellan honorna i en population eller en art. För att se om man hittar samma tydliga genetiska grupper hos mellansorks hanarna valde jag att titta på Ykromosomens DNA, eftersom Y-kromosomen endast finns hos hanar. Om hanarna har ett annat sprindningsmönster än honorna kommer analysen av Y-kromosomens DNA inte att ge de genetiska grupper som visats i mtDNA. Då ingen tidigare har undersökt variationen i Y-kromosom hos mellansork, testade jag ett antal markörer som är utprovade för att fungera på däggdjur. Jag har undersökt nio mellansorkar och 12 olika genetiska markörer för Y-kromosomen. Individerna valde jag så att de skulle täcka hela utbredningsområdet samtidigt som de skulle representera var och en av de fyra olika mtDNA-grupperna. Detta för att se om man kan hitta samma mönster när man analyserar Y-kromosomen. Jag fann att variationen i Y-kromosomen var nästan sju gånger lägre än i mtDNA. Denna skillnad beror på att DNA som finns i cellkärnan evolverar långsammare än det DNA som finns i mitokondrierna. Jag hittade fem variabla fragment på Y-kromosomen, och i stort gav de samma geografiska grupper som för mitokondrie-DNA. Ett undantag var en individ i norra Europa som var mer lik de individer som finns i den västeuropeiska mtDNA-gruppen. En förklaring till detta kan vara att hanarna under återkoloniseringen av Skandinavien vandrade längre sträckor än honorna. Förfäderna till den avvikande individen kan ha vandrat upp från söder till norr via Norges kust. Swedish official title: Y-kromosomvariation i mellansork, Microtus oeconomus - en pilotstudie Swedish credits: 20p E-mail address of first author: [email protected] Supervisor: Cecilia Brunhoff & Maarit Jaarola, Department of Genetics Submission date/time: 2002-03-08 Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Y chromosome variation in the root vole, Microtus oeconomus - a pilot study. Helena Mattisson Biology, Genetics Autumn 2001 Abstract in English The root vole (Microtus oeconomus) is a widespread species with many interesting characteristics. It is Holarctic and thus the only Microtus species that can be found in both Eurasia and North America. A phylogeographic study of the root vole has previously been conducted using mitochondrial (mt) DNA. However, in order to elucidate the species evolutionary history an additional genetic marker is necessary. For this purpose I chose the patrilinear Y chromosome to complement the materilinear mtDNA. In this pilot study, I sequenced root vole Y chromosome introns. The study includes nine root vole individulas from nine different localities across the species' range. I sequenced a total of 18 088 base pairs (bp). The results from this pilot study more or less confirm the mtDNA data. At least three of the four lineages observed in mtDNA were appearent in the Y chromosome network. The Y chromosome sequences contained a significantly lower level of variation than mtDNA, the difference beeing almost sevenfold.