PCMB 070619 - Institutionen för biologisk grundutbildning

STOCKHOLMS UNIVERSITET
INSTITUTIONEN FÖR
BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING
TENTAMEN
Kurs: Prokaryot cell- och molekylärbiologi (PCMB)
Datum: 2007-06-19 kl. 10-13
Visat betald terminsräkning och legitimation
_________
signatur (tentamensvakt)
Tillåtna hjälpmedel: inga
Födelsedatum
Ifylles av
examinator
Namn
Adress
Postnummer
Antal besvarade
uppgifter
Poäng
Postadress
Antal
inl. lösa blad
Betyg
Max poäng
Godkändgräns
VG-gräns
1. Vilket av följande antibiotika inhiberar peptidoglykansyntes? (Kryssa för det rätta
alternativet) (2p):
a) kloramfenicol
†
b) tetracyklin
†
c) penicillin
†
d) polymyxin
†
e) nystatin
†
2. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden om det bakteriella RNA
polymeraset/transkriptionsprocessen. För varje felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag
dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. Det lönar sig alltså bättre att lämna alternativ
obesvarade än att gissa fel. (2p)
a) En mRNA molekyl, som är resultatet av transkriptionen, innehåller hos
bakterien ofta information för flera olika proteiner
____
b) Under transkriptionsprocessen exponeras den ena kodande DNA strängen
för RNA polymeraset genom att strängarna tas isär (en ”bubbla” bildas).
”Bubblan” flyttas alleftersom RNA polymeraset avläser längs den kodande
DNA tråden.
____
c) För att kunna känna igen en promotorsekvens krävs en σ-faktor förutom
RNA polymerasets core-enzym.
____
d) Ofta transkriberade gener, för t.ex. ribosomproteiner, ligger ofta nära origin
of replication
____
e) RNA bildas under transkriptionsprocessen med en hastighet av ungefär 50
nukleotider per sekund.
____
3. Många bakterier kan simma. . Ange Rätt eller Fel för varje påståenden. För varje
felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p)
a) rörelseorganen kallas fimbrier
______
b) då rörelseorganen roterar åt ena hållet drivs bakterien framåt
______
c) då rörelseorganen roterar åt andra hållet drivs bakterien bakåt
______
d) rörelseorganens svans består av proteinet flagellin
______
e) det måste finnas en protongradient över plasmamembranet
för att bakterien ska simma
______
4. Ett medium består av följande i vatten: glucose, NaCl, K2HPO4, KH2PO4, MgSO4,
FeSO4, CaCl2 . Ange Rätt eller Fel för varje påståenden. För varje felaktigt alternativ
ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p)
Detta är ett:
a) syntetiskt medium
______
b) komplext medium
______
c) LB medium
______
d) selektivt medium
______
e) definierat medium
______
5. Vid en Hfr x F- korsning mellan två E. coli stammar överförs en markör efter 5 min
och en annan efter 25 min. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden. För varje
felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p)
a) Det ligger 4000 gener mellan de två markörerna
___
b) Då korsningen avbryts efter 50 min har de flesta mottagarna blivit Hfr
___
c) Mottagarstammen har sex-pili
___
d) En enkelsträngad DNA molekyl har förts över i en cytoplasmatisk brygga
___
e) Efter överföringen kan homolog rekombination ske
___
6. Ange Rätt eller Fel för varje påstående om en virulent fag. För varje felaktigt alternativ
ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p . (2p)
a) Den kan gå in i lytisk tillväxt
____
b) Den kan göra en bakterien lysogen
____
c) Den ger klara plack
____
d) Den sprutar in sitt DNA i bakterien
____
e) Den kan föröka sig som en del av bakteriens kromosom
____
7. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden om translationen. För varje felaktigt
alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p. (2p)
a) Initieringen av translationen sker med hjälp av ett visst start-kodon. Detta
kodon är unikt för initiering och finns ej inuti den kodande delen av mRNA.
____
b) Translokering under translationsprocessen innebär att mRNA förflyttas
relativt till ribosomen med ett kodon.
____
c) Som hjälp vid termineringen läser en speciell stopp-tRNA av stoppkodonet varpå terminering sker.
____
d) Laddningen av rätt aminosyra till rätt tRNA görs av ett enzym som
känner igen såväl aminosyran som tRNA molekylen, varpå aminosyran
kopplas ihop med sin rätta tRNA.
____
e) mRNA förankras till ribosomen under initieringsskedet genom
komplementär basparning till ribosomens 16S rRNA.
____
8. Vid en laboration spädde du bakterierna på följande sätt: 0.05 ml av kulturen sattes
till 5 ml SB. Från detta rör togs 0.1 ml och sattes till 0.9 ml SB. Från det sista röret togs
0.1 ml som spreds på en agarplatta. Efter inkubering kunde du räkna 14 kolonier på
plattan. Hur stor var bakteriekoncentrationen (ml-1) i den ursprungliga kulturen? (2p)
a) 1.4 x 103
O
b) 1.4 x 104
O
5
O
d) 1.4 x 106
O
e) 1.4 x 107
O
c) 1.4 x 10
9. Vad innebär transduktion? (Kryssa för det rätta alternativet) (2p)
a) Att DNA endast överförs när en cell kommer i direkt kontakt med en annan.
O
b) Att DNA överförs efter att cellerna fått en elektrisk stöt.
O
c) Plasmid-upptag med hjälp av kalcium fosfat.
O
d) DNA förs från en bakteriecell till en annan med ett virus.
O
e) Upptag av naket DNA.
O
10. Ange Rätt eller Fel för varje påståenden rörande transposoner. För varje
felaktigt alternativ ges 0,4 p avdrag dock kan ej frågan ge mindre än 0 p .
(2p)
a) Transposonen bär på en egen gen, som kodar för det enzym som behövs
för dess överföring till nya positioner
____
b) Transposoner kan flyttas från plasmid till kromosomen hos värdbakterien
____
c) Transposoner kan överföras med hjälp av ett bakterievirus från en
bakterieindivid till en annan av samma art.
____
d) Transpositionen är beroende av RecA och homologa sekvenser
____
e) Targetsekvensen dupliceras vid transpositionen
____
Obs! Läs detta innan du börjar besvara följande två essäfrågor:
Försök skriva koncist och inte alltför ordrikt. Skriv bara sådant som du är någorlunda säker på är rätt felaktiga uppgifter drar ner helhetsintrycket. Var särskilt noga med att använda facktermer på ett
korrekt sätt. För att få högsta poäng måste man visa att man kan sätta in faktakunskaper i ett
sammanhang. Dessutom ska man kunna uttrycka sig klart och strukturera svaret väl.
11. Just nu finns en risk att en influensapandemi skulle kunna uppstå. Beskriv så noga
du kan de virus som skulle kunna vara inblandade och mekanismen för hur ett nytt
farligt virus skulle kunna skapas. Vad kallas förloppet? Beskriv också hur ett
influensavirus kommer ut ur värdcellen. (7p)
12. Beskriv noga hur du skulle undersöka om en bakterie har ett restriktionsmodifikationssystem. Förklara också vad som händer i bakterien. (8p)