Mikroorganismer i avloppsrening Sofia Andersson 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 1 • Hela phyl träd med eukaryoter o allt! 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 2 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 3 Metoder • Klassisk mikrobiologi – Isolering och karaktärisering • Molekylärbiologiska metoder – – – – – – Fluorescent in situ hybridization, (FISH) 16S rRNA profil Confocal Laser Scanning Microscopy, (CLSM) Digestion Gradient Gel Electrophoresis, (DGGE) Microarray FISH-microautoradiography (FISH-MAR) 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 4 EUB-probe, grön (alla bakterier) B. denitrificans -probe (röd) och EUB-probe (grön) överlappar ⇒ orange signal 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 5 Extrahera DNA från slam, amplifiera 16SrRNA-gen mha PCR Spotta 100-100 000 DNAprober på glas slide Märk in genfragmenten med fluorofor = Microarray Hybridisera gener och DNA-prober 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 6 Avloppsrening • Primärrening: mekanisk rening (1) (4) • Sekundärrening: biologisk nedbrytning av organiskt material (3), aerob, anoxisk eller anaerob • Tertiärrening: kemisk och biologisk rening av kväve och fosfor (2) (3) 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 7 Mikroorganismer i avloppsrening • Aktiv slam – modellsystem • Biofilm • Anaeroba processer 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 8 Aktiv Slam Renar bort: – – – – – Typer av mikroorganismer: C N P Patogener Partiklar – – – – – Bakterier Protozoer Svampar Metazoer Microalger Viktiga slamegenskaper: – Flockbildning – Undvika slamsvällning och skumning 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 9 Heterotrofer Org. C + O2 → biomassa (50%) + CO2 + H2O • Aeroba/ Fakultativt anaeroba/ Anoxiska/ Strikt anaeroba • Snabb tillväxt ⇒ hög slamproduktion • Proteobacteria (phylum; Class: α, β, γ, δ, ε) 2009-03-24 TABLE 8.2. Distribution of Aerobic Heterotrophic Bacteria in Standard Activated Sludge Genus or Group Comamonas-Pseudomonas % Total Isolates 50.0 Alcaligenes 5.8 Pseudomonas (fluorescent group) 1.9 Paracoccus 11.5 Unidentified (gram-negative rods) 1.9 Aeromonas 1.9 Flavobacterium-Cytophaga 13.5 Bacillus 1.9 Micrococcus 1.9 Coryneform 5.8 Arthrobacter Mikroorganismer i avloppsrening Aureobacterium-Microbacterium 1.9 10 1.9 Bakterier i kväverening • Kväve inkommer till avloppsreningsverk som – NH4+ – Organiskt bundet kväve • Mekanismer för att rena kväve – Nitrifikation+Denitrifikation – Anammox – Uppbyggnad av nya celler 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 11 Nitrifierare • • • • • • • • Strikta aerober Autotrofer (CO2 som kolkälla) Kemolitotrofer (inorg. e- donator) Långsamväxande (delningstid ca 1-10 dagar) Känsliga för extrema pH, gifter etc. Gynnas av hög slamålder Phylum: Proteobakteria, Nitrospira Identifiering: – amoA gen (α-subenhet av enzymet ammonia monooxygenase) – Isolering i specifikt medium (tidskrävande) – FISH NH4 2009-03-24 Ammonium oxiderare NO2 Nitrit oxiderare Mikroorganismer i avloppsrening NO3 12 Ammonium oxiderande bakterier (AOB) NH3 + O2 + 2e- + 2H+ → NH2OH + H2O NH2OH + H2O + ½O2 → NO2- + 2H2O + H+ NH3 + 1½O2 → NO2- + H2O Nitrosomonas, Nitrosospira, Nitrosococcus 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 13 Nitrit oxiderande bakterier (NOB) NO2- + ½O2 → NO3Nitrobacter, Nitrospira, Nitrococcus, Nitrospina 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 14 Denitrifierare NO3- (NO2-) → N2 (gas) • Många olika heterotrofa bakterier kan denitrifiera vid anoxiska förhållanden • Vanligast: stavformad, GFISH Comamonas denitrificans • Aerobt ⇒ växer snabbt ⇒ denitrifierar inte • Anoxiskt ⇒ Denitrifierar ⇒ Växer långsamt 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 15 5CH3COOH + 8NO3- → 8HCO3- + 2CO2 + 6H2O + 4N2 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 16 Denitrifierare : Identifikation Identifiering: – Enzym-gen som molekylär markör: nitrite reductase, nitrous oxide reductase – Isolering och gallring mha denitrifikationstest • Mjukagar rör • mikrotiterplatta många arter av Pseudomonas Brachyomonas denitrificans Comamonas denitrificans 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 17 Anaerob Ammonium Oxidering - ANAMMOX • • • • • Kemolitoautotrof Delningstid 2 veckor NH4+ elektron donator och NO2- elektron acceptor Upptäcktes 1986, producerar ca 50% av N2 unik komposition av membranet (ladderane lipider) med anammoxosome organell • Phylum: planctomycetes NH4+ + NO2- → N2 + 2H2O Brocadia, Kuenenia, Anammoxoglobus (sötvattenarter), Scalindua (marina arter) 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 18 Anaerob Ammonium Oxidering - ANAMMOX CANON: "completely autotrophic nitrogen removal over nitrite” → Kombination av aeroba nitrifierande bakterier (AOB) och anaeroba ANAMMOX bakterier → O2-halt max 0.5mg/L NH4+ AOB NO2- + NH4+ ANNAMOX N2 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 19 Enhanced Biological Phosphorus Removal, EBPR 1) Anaerob miljö 2) Aerob miljö PAO bakterie PAO bakterie Poly-P Fettsyror (VFA) 2009-03-24 Fettsyror (VFA) Pi Bacillus Mikroorganismer i avloppsrening 20 - Avger fosfor under anaeroba förhållanden + Tar upp fosfor under aeroba förhållanden = Netto: Upptag större än utsläpp 3. poly-beta-hydroxyalkanoat (PHA) granule (ljus) 4.polyfosfat granul (svart) •Candidatus Accumulibacter phosphatis (Uncultivated betaproteobacteria) •Actinobacterium •(Acinetobacter) 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 21 Definition av Polyphosphate Accumulating Organism (PAO) • • • • • Synliga poly-P och PHA granuler Favorit kolkälla: acetat, propion-/smörsyra Orörliga stavar/kocker Lever helst i kluster Gram +/- ? Ingen enskild organism har hittills isolerats som har alla dessa egenskaper Definitionen är baserad på egenskaper hos EBPR slam 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 22 Flockbildande bakterier Varför är flockar viktiga? ⇒Sedimentering, dvs separation av slamfas och vattenfas efter det biologiska reningssteget 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 23 Flockbildande bakterier Bra: Zoogloea – bildar extracellulära polymerer (EPS) som binder ihop slamflockarna (ytladdningar, hydrofoba interaktioner) → lätt sedimenterat Dålig: Beggiatoa – bildar löst sammansatta flockar → Sedimenterar dåligt 2009-03-24 FISH bild av den flockbildande bakterien Zoogloea i aktivt slam med kväverening Mikroorganismer i avloppsrening 24 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 25 2009-03-24 b) small, weak flocs Bar = 10 micrometers a) pin floc c) flocs contining filamentous organisms d) flocs containing filamentous Mikroorganismer i avloppsrening organism “network" or “backbone 26 Filamentösa bakterier FISH bild av Anaerolineae, anaerob filamentös bakterie i aktivt slam med kväverening. 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening Elektronmikroskop bild av Microthrix parvicella 27 Filamentösa bakterier • Mycket filamentösa bakterier i aktivt slam: ⇒Löst sammansatta flockar ⇒Slamsvällning ⇒Dålig sedimentering ⇒Skumbildning →hyrofob cellyta hos filamentösa bakterier →Luftbubblor fastnar • Gynnas av hög slamålder • Microthrix parvicella – Bekämpas med polyaluminium (påverkar cellytan) 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 28 Filamentösa bakteriers effekt på aktivslamflockars morfologi och sedimenterbarhet 100 µm 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 29 Patogener Aktivt slam tar bort 80-99 % av alla patogener – inaktivering, betning av protozoer/metazoer, slam-adsorption Bakterier: Salmonella typhi, Streptococcus fecalis, Klebsiella spp., Vibrio cholerae Virus: Adenovirus, Enterovirus, Rotavirus Protozoer: Giardia, Cryptosporidium 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 30 Patogener • Hur mäta fekala patogena bakterier ? – Indikatororganism • • • • Finnas i tarmar hos varmblodiga djur Inte patogena Motståndkraft/Livscykel/Förekomst som motsvarar patogen Detekterbar →Fekala/Totala koliformer – Aeroba/Fakultativt anaeroba, Gram -, inga sporer, stavformade, fermenterar laktos inom 48 h – Echerichia coli, Enterobacter, Klebsiella, Citrobacter 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 31 Patogener Detektion av koliformer – most-probable-number, MPN – membrane filter, MF • Selektiva/Diffrentierande medium – reagenskit, snabb detektion MPN MF Rekomenderade max-halter av Fekala Koliformer: Dricksvatten: 0 per 100 mL Badvatten: 200 per 100 mL Fiske: 1000 per 100 mL Renat avloppsvatten: 200 per 100 mL 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 32 Protozoer • Encelliga djur – Flagellater (Bode spp.) – Amöbor (Nueglaria spp.) – Ciliater (Cyclidium spp.) Vorticella, stjälk ciliat, 15-50 µm • Funktion i aktivt slam: – ”Betar” bakterier och org. C – Indikator organismer • Flagellater → mkt hög BOD halt • Frisimmande Ciliater → hög BOD halt, bra rening • Stjälk ciliater → låg BOD halt 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening Paramecium, stor (100-300 µm) simmande ciliat 33 Svampar • Förekommer sällan i aktivt slam (utom jäst), däremot relativt vanlig i biofilmsprocesser Penicillium • Gynnas av – Lågt pH – Toxicitet – Kvävebrist • Kan eventuellt orsaka slamsvällning • Rhodotorula spp. (jäst), Geotrichum, Penicillium, Cephalosporium 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 34 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 35 Metazoer • Flercelliga djur – Rotiferer, Maskar (Tubificidae), Nematoder, Insekter, Insektslarver, Kräftdjur, Hjuldjur • • • • Äter protozoer och bakterier – både bra och dåligt Bildar flockar genom att avge slem Mineralisering av slam? Vanliga vid hög slamålder, bra luftning och låg BODbelastning Collotheca (Rotifer) 2009-03-24 Nematod Mikroorganismer i avloppsrening 36 Lecane sp. (Rotifer) Mikroalger • Förekommer i aktivt slam • Vanliga i biofilms processer samt dammar • Finns speciella algreaktorer Scenedesmus – Algproduktion + Avloppsrening – Algerna syresätter reaktorerna • Scenedesmus, Monoraphidium Monoraphidium 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 37 Biofilms processer Biofilmer i avloppsreningsprocesser består av: – Extracellulära polymeriska substanser (polysackarider, proteiner, aminosyror, fetter) – Bakterier – Protozoer, Alger, Svampar, Flercelliga djur 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 38 Biofilms processer Varför biofilm? • • • • • Robust: Tåliga mot toxiner, pH variationer, ”protozo-betning” Mindre slamproduktion Kompakta reaktorer, stor kontaktyta Ingen recirkulation behövs Flexibla 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 39 Mikroorganismer i biofilmer • • • • • EPS-bildande bakterier: Zoogloea Organotrofer: de flesta bakterier (bryter ned org. C) Nitrifierande bakterier: NOB, AOB Denitrifierande bakterier: B. denitrificans Protozoer (äter bakterier och EPS och ser till att biofilmen inte blir för tjock och kompakt) • Alger (fotosyntetiserar, kvävefixerar) • Svampar (bryter ner toxiska ämnen) • Flercelliga djur (äter bakterier och EPS och ser till att biofilmen inte blir för tjock och kompakt) 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 40 Biofilm formation 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 41 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 42 Biofilm struktur • • • • • Komplex, heterogen struktur Bakterie/EPS aggregat Filamentöst EPS Tomrum Kanaler m. diameter 20-200 µm(transporterar O2, näringsämnen) • Mikroporer • Påverkas av flödeshastighet – Högt flöde, kompakt biofilm – Lågt flöde, fluffig biofilm • Kommunicerar via s.k. Quorum sensing • FISH-CSLM, SEM, Particle tracking, Cryosectioning, micro-biosensors 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 43 Quorum sensing 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 44 Anaeroba processer Org. C → nya celler (5%) + CH4 + CO2 + H2 + NH3 +H2S + + + + + - CH4 = Biogas = Energi Ingen luftning Hög kolbelastning Kan bryta ner svårnedbrytbara substanser Låg slamproduktion Långsam och känslig process Mikroorganismer: Bakterier dominerar, Arkebakterier (svampar, protozoer) 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 45 Komplext org. C (polysackarider, fetter) Hydrolys Hydrolytiska bakterier Monomerer (glukos, aminosyror, fettsyror) Fermentation Syrabildande bakterier t.ex. Clostridium Organiska syror, alkoholer, ketoner Syrabildning Ättikssyrabildande bakterier t.ex. Syntrobacter, Syntrophomonas Acetat, CO2, H2 Metanbildning Metanproducerande bakterier Metan (CH4), CO2 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 46 Metanproducerande bakterier • Tillhör Arkebakterierna • Obligat anaeroba • Långsamväxande (delningstid 3-50 dagar) • Hydrogenotrophic methanogenes – CO2 + 4 H2 → CH4 + 2H2O • Methanobacterium, Methanocaldococcus, Methanospirillum • Acetotrophic metanogenes – CH3COOH → CH4 + CO2 • Methanosarcina, Methanosaeta 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 47 Upflow Anaerobic Sludge Blanket (UASB) Reaktor på bryggeri i Nicaragua 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 48 Sammanfattning • De flesta mikroorganismer finns i många olika avloppsrenings processer. • Genom att styra processen kan vissa mikroorganismer gynnas – – – – – Anaerobt, hög BOD: Metan producerande bakterier Aerobt, låg BOD, NH4: Nitrifierare Anoxiskt, NO3/NO2: Denitrifierare Anaerobt, VFS/Aerobt: PAO Hög slamålder: Nitrifierare, Microtrix • Forskning pågår ständigt ⇒ Kunskap förnyas 2009-03-24 Mikroorganismer i avloppsrening 49