Fördelning av projekt vt13 Examensarbete BML (15 hp)
Projekt 1 och 2
Projekt inom ramen för “Konditionerade medier från olika typer av makrofager
som odlats i serumfritt medium jämfört med seruminnehållande medium”
Bakgrund: Tumörvävnader är infiltrerade av stromaceller där en celltyp är
makrofager. Vi har resultat som visar att konditionerade medier från M1 fenotypen
av makrofager, men inte M2 fenotypen, inhiberar tillväxten av cancer cellinjer.
Projekten omfattar isolering av monocyter, odling och differentiering av dessa till
M1 och M2 makrofager samt generering av konditionerade medier från dessa
celler. Odlingen kommer att ske både i seruminnehållande och serumfritt medium.
Projekt 1. Effekter av konditionerade medier (serumfria och seruminnehållande)
från makrofager på proliferationen av colon cancer cellinjen HT29
Suzanne Rawdan
Handledare: Jonny Wijkander, Alexander Engström
Projekt 3
Bakgrund: Det finns indikationer på att nikotin hämmar lipopolysackarid inducerad
frisättning av cytokiner (bl. a TNF alfa och IL12) och prostaglandiner från
monocyter. Vi har resultat som visar att konditionerade medier från M1
makrofager ( utdifferentieras från monocyter genom behandling med
lipopolysackarider) hämmar proliferationen av cancer cellinjer.
Frågeställningen är om, och i så fall hur, nikotin påverkar cytokinfrisättningen från
makrofager samt om de konditionerade medier som genereras från
nikotinförbehandlade makrofager förlorar sin proliferationshämmande effekt på
colon cancer cellinjen HT29.
Projektet omfattar isolering av monocyter, odling och utdifferentiering av dessa till
makrofager (med och utan nikotinförbehandling), analys av dessa medier avseende
cytokinfrisättning samt studier på proliferationen av HT29 celler. (projektet kan
tänkas delas mellan 2 studenter).
Lama Khattab
Handledare: Jonny Wijkander, Ann Erlandsson
Projekt 4
Hållbarhet & analys i efterhand, vilka gränser skall användas?
Studentarbete vid Kliniskt kemiska laboratoriet CSK
Bakgrund
Vi får ofta ”beställningar i efterhand”, dvs ett rör har tagits för att analysera vissa
analyter och ett patologiskt / icke patologiskt resultat föranleder frågan om andra
analyter. Tidigare har undersökningar gjorts på hållbarheten av olika analyter i
formen av C-uppsatser. Dessa undersökningar behöver nu kompletteras av olika
anledningar. Dessa beställningar kan vara av stor betydelse för handläggningen,
speciellt av inneliggande svårt sjuka patienter.
Projekt
Att göra en genomgång av tidigare gjorda arbete, bestämma hur dessa nivåer
stämmer med vårt ackrediterings CV, och hur förhållande är enl Tonks formel.
(Spridning i förhållande till referensvärdes gränser). I projektet ingår också att med
hjälp av tillgängliga data, välja ut vilka analyter som är lämpligast att studera.
Detta kräver motivering dels utifrån medicinska och analytiska grunder.
Betydelse
Detta ämne har stor betydelse för att kunna ge maximal service utan att tumma på
säkerheten i analyssvaren för analyterna. Arbetet kan generera märkbara
konsekvenser för vården och laboratoriet.
Sara Lostin
Handledare
Per-Olof Forsberg,
Monika Vikner, BMA, Metodansvarig Immunkemi
Maria Löfgren, Ingenjör Allmän kemi
Mer info kan fås av
Per-Olof Forsberg
Tfn 070-6556900
E-post: [email protected]
Projekt 5
Validering av metoder för fria lätta kappa- och lambdakedjor i serum
På Specialkemi analyseras sedan många år fria lätta kappa- och lambdakedjor i
serum med reagens från Binding Site på ett instrument som heter BN ProSpec
(nefelometer).
Siemens, som tillverkar instrumentet, har under förra året lanserat ”egna” reagens
för dessa två metoder.
Föreslaget examensarbete syftar till att validera de nya reagensen (mot det
nuvarande) för dessa två metoder; från plan för validering till utförande av
validering, sammanställning av resultat och slutsatser av valideringen.
Det är intressant att utvärdera dessa reagens ur flera perspektiv och vi är bl. a
nyfikna på:
Om de nya reagensen har ett enklare handhavande än de nuvarande; dvs hur kan
analysprocessen optimeras?
Hur är övrig metodprestanda jämfört med befintliga metoder;
precision,
mätområde,
hur hanteras eventuell antigenexcess med det nya reagenset?
Blir det någon skillnad i enskilda resultat vid ett eventuellt byte?
m.m.
Christian Hartmann
Handledare Ann.Sofie Jansson
sjukhuskemist
054-19 15 44
[email protected]
Landstinget i Värmland
Klinisk Kemi
Centralsjukhuset i Karlstad
651 85 Karlstad
www.liv.se • www.1177.se/varmland
Projekt 7
Bakgrund: Vid tappning av röda blodkroppar så tar vi en första skvätt i en
provtagningspåse. Detta för att vi lätt skall kunna ta prov men även för att det finns
en tro att bakterier och annat löst hamnar i denna påse. De arbeten som har gjorts
om detta har inriktat sig på att se hur ”rena” påsarna är men jag vet ingen som
regelmässigt tittat på innehållet i själva provtagningspåsen.
Arbete: I arbetet skulle därför prov på odling från innehållet också tas.
Detta arbete är ett sammarbete med mikrobiologen
Johan Löfendahl
Handledare Per-Olof Forsberg
Projekt 8
Bakgrund: I vårt blodlager så finns 0 & A trombocyter. Hur skall man välja
trombocyter om man inte har givarens blodgrupp? Den förhärskande regeln i
Sverige är att man bör följa samma regler som vid transfusion av erytrocyter. Detta
kommer sig av att det finns lite A & B substans på trombocyterna. Nyare rön från
ffa USA har ifrågasatt detta och de har istället givit trombocyter enligt
plasmaförlikning och inte sett sämre ökning av trombocyter vid transfusion.
Arbete: Här skall vi ta CCI, värde en timma efter transfusion. Förhoppningsvis så
kan vi böra samla värden innan studenten dyker upp. Vid denna analys skall vi
även titta på MPV & PDW. Detta projekt är ett samarbete med hematologen.
Sara Berglund
Handledare Per-Olof Forsberg
Projekt 12-15
Den tumörspecifika antikroppen TS1.
Handledare: Birgitta Sundström & Patrik Holm
Bakgrund
TS1 är en IgG-antikropp riktad mot keratin 8 vilket finns extracellulärt i de
centrala delarna av carcinom. Keratiner finns normalt inte extracellulärt i normal
vävnad vilket gör att TS1 skulle kunna användas som en specifik bärare av något
cytotoxiskt för en specifik behandling av tumören.
Från genomet hos hybridomcellerna som producerar TS1 har det konstruerats en
scFv kallad TS1-218. Enstaka aminosyror har sedan bytts ut i TS1-218 för att
studera effekterna av aminosyrabytet. Bland annat har bytet från Glutamin till
Glutaminsyra i tunga kedjans första aminosyra resulterat i att affiniteten ökat
avsevärt. Denna muterade TS1-218 kallas HE1Q.
Dubbelmutation
Projekt 12 och 13 Två st exjobb.
Det finns ett antal varianter av TS1-218 som endast skiljer sig åt i en aminosyra.
Dessutom finns det varianter av antigenet Keratin 8 och anti-idiotypen anti-TS1.
De olika varianterna av TS1 ska kopplas till kulor som sedan får inkuberas
tillsammans med fluorokrommärkta varianter av antingen Keratin 8 eller anti-TS1.
Dessa kommer då i olika utsträckning att binda till de olika TS1-varianterna vilket
kan analyseras m.h.a flödescytometri.
Lorraine Eriksson och Sofia Unger
Handledare Birgitta Sundström och Patrik Holm
Cellpenetrerande peptider
Projekt 14 och 15 Två st exjobb.
Till den muterade varianten av TS1-218, HE1Q, ska det tillfogas någon
cellpenetrerande peptid. Dessa peptider fungerar som adresslapp som tar in
antikroppen intracellulärt i olika celler. HE1Q med en sådan peptid ska märkas
med en fluorokrom och inkuberas med någon uppodlad cell. Processen och
effekten ska följas med flödescytometri.
Martin Karlsson och Fredrik Forslund
Handledare Patrik Holm och Birgitta Sundström
Projekt 17
Behandla småcellig lungcancer (SCLC) med medium från humana makrofager och
analysera deras somatostatin receptor typ 2 (SSTR2) mRNA uttryck med real-tids
PCR samt protein uttryck av SSTR2 med immunocytokemi
Frågeställning SSTR2 receptorn används vid målsökande terapi av neuroendokrina
tumörer, ändras uttrycket av denna receptors mRNA vid närvaro av
makrofagmedium av olika typ?
Francine Mukashema
Handledare Ann Erlandsson
Projekt18.
Behandla cancer celllinjer med ursprung i lunga med medium från humana
makrofager och analysera deras uttryck av metalloproteinas 9 (MMP-9) mRNA
med real-tids PCR.
Frågeställning, MMP-9 tros kunna påverka tumörers möjlighet att bland annat
metastasera, ändras uttrycket av MMP-9 vid närvaro av makrofagmedium av olika
typ?
Alexandra Rulcker
Handledare Ann Erlandsson
Projekt 21.
Analys av CD68 och CD163 i bronchial carcinom Analyseras med IHC
Annie Carlsson
Handledare Tomas Seidal Patologen i Halmstad
Projekt 22.
Analys av matrix metalloproteinas 9 (MMP-9 ) och receptorn för Urokinas
plasminogen aktivator (UPAR) i bronchial carcinom. Analys med IHC
Therese Lindsten
Handledare Tomas Seidal Patologen Halmstad
Projekt 23.
Aspirinutlöst astma. Betydelse av cell-cellinteraktion
Arbetet är laborativt och innebär framrening av humana blodkroppar och
inkubering med receptormedierade stimuli och acetylsalicylsyra.
Johanna Bergström
Handledare Susanne Thornhamre
Projekt 24.
Effekt av kråkbär (empertrum nigrum) Djävulsklo (Harpagophytum procumbens)
samt extrakt från te och kakao på tillväxten av colon cancer cell linjen HT29
Ulrika Lindblom
Handledare Ingrid Persson, Jonny Wijkander
Projekt 25
Effekt av kråkbär (empertrum nigrum) Djävulsklo (Harpagophytum procumbens)
samt extrakt från te och kakao på prostaglandin E2 bildning i humana moncyter
och makrofager.
Valentina Bergström
Handledare Ingrid Persson, Jonny Wijkander
26-27 Två projekt
Metodjämförelse mellan Calmarks LD-test (hilda) och referensmetod på Klin.
Kemi på CSK. Det är en bra och begränsad studie som laborativt kommer att pågå
under 3veckor. Det finns bra handledning och ett färdigt studieprotokoll som
bygger på CLSI riktlinjer. Studenterna får köra testerna och därefter (under
handledning) räkna ut resultaten (regression, bland-altman plot etc) på materialet.
Josefin Carlsson och Amya Campillay
Handledning: Calmark och Klin kemi (CSK) personal. Birgitta Sundström
