Projektkatalog vt12 Examensarbete BML
1. PAX-8. Ny antikropp med potentiell diagnostisk betydelse. Immunhistokemi.
Patologen Halmstad. Handledare Tomas Seidal
Rosanna Skoog
3. CISH eller FISH. Jämförelser mellan två metoder för in-stu-hybridisering.
Patologen Halmstad. Handledare Tomas Seidal
Johan Lundström
5. Mätning av fritt Hemoglobin – Jämförelse mellan två metoder. Studentarbete vid
Claratappen, Klinisk kemiska laboratoriet & Blodcentralen CSK
Sabina Aryan
Bakgrund
På Blodcentralen så mäter vi fritt hemoglobin för att på detta sätt beräkna hemolysgraden
i utdaterade blodpåsar. Det kan ibland också vara intressant vid vissa transfusions
komplikationer att mäta fritt Hemoglobin både i blodpåsen och ”patienten”. I dagsläget så
använder vi en spektrofotometrisk metod på vårt kemiska laboratorium, vilken är
omständlig och kräver manuellt arbete, vilket är speciellt besvärligt på kvällar & helger.
Det på marknaden metoder att utföra denna analys på ett enklare sätt.
Projekt
Att starta upp och genomföra en jämförelse mellan vår rutinmetod vid Klinisk kemiska
laboratoriet och HemoCue ”lågt Hb” för att mäta fritt hemoglogin i både blodpåsar och
patient plasma/serum.
Betydelse
Frågeställningen är av stor praktiskt betydelse både för blodcentralen som lätt kan få ett
värde på delen fritt hemoglobin i påse & patient både dag och obekväm arbetstid.
Metoden frisätter även resurser på vårat kliniskt kemiska laboratorium, vilket gör att
analysen även kan utföras jourtid.
Handledare
Per-Olof Forsberg, Med ansvarig Transfusionsmedicin
Laila Arnqvist, Dirftsledare, Claratappen samt metodansvarig för komponenter.
Driftsansvarig Klinisk kemi
Mer info kan fås av
Per-Olof Forsberg
Tfn 070-6556900
E-post: [email protected]
6. Olikheter och skillnader mellan blodkomponenter på grund av framställningssätt –
Granskning och bearbetning av data från komponentkontroller. Studentarbete vid
Claratappen & Blodcentralen CSK
Andreas Karlsson
Bakgrund
Vi har under många år samlat in data för våra produktkontroller. Efter att vi har samlat in
detta så göra vi sammanställningar varje kavartal (det gäller hela laboratorie-medicin
Värmland). Vi ser tydliga skillnader mellan olika metoder att framställa erytrocytkomponenter
Projekt
Sammanställa och se hur variablerna Hb innehåll, Vikt, EVF, mm varierar mellan olika
metoder samt att belysa för respektive nackdelar med de olika framställningssätten
Betydelse
Frågeställningen är av stor praktiskt betydelse då vi i Värmland ökar produktionen av
aferes komponenter och vi måste motivera varför? Med ”hårda data”
Handledare
Per-Olof Forsberg, Med ansvarig Transfusionsmedicin
Laila Arnqvist, Dirftsledare, Claratappen samt metodansvarig för komponenter.
Mer info kan fås av
Per-Olof Forsberg
Tfn 070-6556900
E-post: [email protected]
7. Utröna sambandet mellan Hemoglobin (Hb) och Erytrocyter volymfraktion (EVF) –
Hur hantera översättningen av dessa värden & föränderlighet. Studentarbete vid
Claratappen, Klinisk kemiska laboratoriet & Blodcentralen CSK
Salwa Muosa Latif
Bakgrund
På Claratappen behöver vi för att ställa in viss utrustning kunna översätta Hb till EVF,
framförallt på historiska data (dvs tidigare tappningar). I dagsläget så använder vi en
”översättningsfunktion” som är utarbetad på 70-talet och som vi vet inte är exakt. Tyvärr så
finns det ingen annan algoritm eller undersökning att följa (det är det bästa vi har) men vi
är inte lyckliga över denna situation
Projekt
Att berabeta data insamlade från givare. Vi kommer att ta dessa prover (eller kanske göra
det under arbetets gång). Vi kommer även att samla in mera data på dessa givare, både 1
gång men även konsekutiva data. Det kan tänkas att projektet kan ”svälla” då denna typ av
data är sällsynta och vi kommer att ta tillfället i akt att när vi nu måste ta prover på många
givare, försöka att få svar på andra frågeställningar. Här kommer Studenten / erna att vara
delaktiga. Således kan projektet delas. Planen är att för engångs provet ha c:a 200 givare
och för en tidsstudie använda 20 givare (10 män 10 kvinnor) med provtagning 4-5 ggr.
Betydelse
Frågorna som kommer att ställas är mycket relevanta för hur vi tar hand om våra givare för
att de inte skall få problem själva och för att blodkomponenterna håller så bra kvalitet som
möjligt.
Handledare
Per-Olof Forsberg, Med ansvarig Transfusionsmedicin
Laila Arnqvist, Dirftsledare, Claratappen samt metodansvarig för komponenter.
Driftsansvarig Klinisk kemi
Mer info kan fås av
Per-Olof Forsberg
Tfn 070-6556900
E-post: [email protected]
9. Studier av cyklooxygenas uttryck och prostaglandin frisättning I olika typer av
makrofager
Naz Huhideen
Prostaglandiner spelar en viktig roll i olika inflammatoriska processer men det finns också
klara indikationer på att de är involverade i tumörprogression. Prostaglandin frisättning
kommer att analyseras i medier från M1 och M2 fenotyper av makrofager med ELISA.
Cyklooxygenas 1 och 2 kommer att undersökas med westernblotting
Handledare Jonny Wijkander
10. Studier av effekter av kemokinen CXCL9 på proliferationen av olika typer av
cancer cell linjer
Frida Niklasson
Tumörvävnader är mycket ofta infilterade av marofager som påverkar proliferationen,
metastaseringen av cancer cellerna samt kärlnybildning i tumören. Vi har resultat som
visar på att konditionerade medier från vissa typer av makrofager påverkar proliferatioen
av cancer cell linjer. Vad för molekyl/molekyler som påverkar cancer cellerna
proliferation har vi ännu inte indetiferat.
Cancer cell linjerna HT29 (colon cancer), H69 (lung cancer), BEAS (lung cancer) och
A549 (virustransformerad lungepitel) kommer att behandlas med CXCL9 med eller utan
konditionerade medier från makrofager och effekter på proliferationen att bestämmas
med MTT assay och räkning av celler i Burkerkammare.
Handledare Jonny Wijkander
11. Konstruktion av ett immunoenzym för behandling av carcinom.
Anas Gabro
Den rekombinanata antikroppen scFv TS1-218 binder till carcinom.
Den ska fuseras med enzymet glukuronidas (GUS) med bibehållen specificitet och
enzymaktivitet.
Detta nya protein skulle kunna leverera GUS specifikt till ett carcinom där GUS kan
omvandla en relativt ofarlig prodrog till aktiv drog lokalt inne i tumören.
Projektet innefattar PCR, restriktionsklyvningar, ligering med T4-ligas samt uttryck av
det nya rekombinanta proteiner i E Coli
Handledare Patrik Holm
12. Kan inflammatoriska celler som makrofager stimulera de normala epitelcellerna
BEAS-2B att producera mRNA som kodar för proteiner involverade i
transformation och tumörcellsbildning?
Rebecka Reza
BEAS-2B cellerna är normala virustransformerade epitelceller som är väldigt användbara då
man vill studera tex hur ett ämne påverkar carcinogenes. BEAS-2B kommer att behandlas med
konditionerat medium från olika typer av makrofager och vi kommer att screena effekten av
denna behandling med arrayen Human Cancer PathwayFinder™ RT² Profiler™ som gör det
möjligt att mäta uttrycket av 84 olika mRNA som är inblandade i celltrasformation och
tumörbildning. Efter screeningen i arrayen kommer vi att fokusera på några av generna och
analysera dessa i mer detalj. Vi kan även komma att använda immunocytokemi och westernblott
för att analysera proteinuttrycket.
Handledare Ann Erlandsson
13 Kan inflammatoriska celler som makrofager stimulera den småcelliga lungcancer cell
linjen NCI-H69 att producera mRNA som kodar för proteiner involverade i
metastasering?
Frida Granroth
Småcellig lung cancer (SCLC) är en aggressiv tumör sjukdom som ofta metastaserar. Cell linjen
NCI-H69 är isolerad från en patients lunga, cellerna växer i suspension i flytande aggregat men
behåller sin småcelliga carcinom morfologi. NCI-H69 cell linjen kommer att behandlas med
konditioneradt medium från olika typer av makrofager och vi kommer att screena effekten av
denna behandling med The Human Tumor Metastasis RT² Profiler™ array som gör det möjligt
att mäta uttrycket av 84 olika mRNA som är inblandade i celladhesion, modullering av
extracellulärt matrix, cellcykel reglering, celltillväxt, apoptos och metastasering. Efter
screeningen i arrayen kommer vi att fokusera på några av generna och analysera dessa i mer
detalj. Vi kan även komma att använda immunocytokemi och westernblott för att analysera
proteinuttrycket.
Handledare Ann Erlandsson
14.Påverkas olika typer av makrofager olika av lågdosstrålning (0,5-7,5Gy) och vad blir
effekten då man lågdosstrålar olika makrofager odlade i co-kultur med olika typer av
tumörceller?
Ann-Karin Olsson
Strålning kan aktivera makrofager att inducera en kraftig inflammatorisk respons i vävnaden som
kan leda till negativa sidoeffekter som exempelvis pneumoni och fibros. Fler studier måste göras
för att ta reda på om olika typer av makrofager påverkas olika av strålning. Fler studier måste
också göras för att se hur co-kulturer av olika typer av makrofager och tumorceller påverkas av
strålning.
Effekten av strålningen kommer att studeras genom att beräkna antalet levande och döda celler,
genom immunocytokemi, LDH assay och eventuellt kvantifiering av valda mRNA yttryck.
Handledare Ann Erlandsson
15. Immuncytokemisk analys av markörer för olika typer av human makrofager.
Leif Larsson
Projektet omfattar att sätta upp metod för immuncytokemisk analys av CD80 och CD163 som
markörer för M1 respektive M2 fenotypen av makrofager. En jämförelse med immuncytokemisk
analys i Dakos Autostainer Link 48 instrument kommer att göras.
Handledare. Jonny Wijkander (Ann Erlandsson)
Projekt Örebro
Kim Persson
Projekt Falun
Marie Nilsson
