ACKREDITERING AV
MALDI-TOF FÖR
MASTITPATOGENER
Anna Eriksson, labingenjör
Enheten för bakteriologi, Mastilaboratoriet
Mastit (juverinflammation)
Är den mest förlustbringande sjukdomen bland Sveriges mjölkkor och utgör
utslagsorsak hos ca 1/4 av korna.
Under ett år drabbas drygt 60 procent av korna
av mastit i någon form.
Sjukdomen är av komplex natur med många
faktorer inblandade.
Vid de flesta mastiter föreligger en bakteriell infektion.
Mastiter kan vara av subklinisk eller klinisk karaktär.
Antalet mjölkkor i Sverige har sedan början av 60-talet sjunkit från cirka 1 200 000
till nuvarande nivå på 360 000 kor.
Den enskilda kons produktion har under motsvarande period fördubblats och
hennes värde har därigenom ökat
ORSAKER TILL PROVTAGNING
•Klinisk juverinflammation
•Subklinisk juverinflammation
•Besättningsundersökning
•Efter kalvning, för att kunna
gruppera
•Kontroll efter behandling
•Försäljning
•Inför sinläggning
Mastit- ett kostsamt problem
•
•
•
•
•
•
Veterinärbesök
Mediciner
Kasserad mjölk
Extra skötsel, förändrade rutiner
Produktionsbortfall
Ökad nyrekrytering
2011 odlades ca 26 000 juverdelsprover på
mastitlaboratoriet SVA
Provtyper:
•Mjölk i provrör
•Mastistrip
•Verifiering av platta
•Övrigt (miljöprover etc)
•PCR
MALDI-TOF till SVA
•
Inköpt SVA december 2011
•
Mars 2012 MALDI-TOF grupp (6 pers)
– Kemist expert (Ulf Bondesson)
– Veterinär (Erik Eriksson)
– 4 användare (Anna Eriksson,
Annica Landén, Lena Lundgren,
Eva Säker)
•
Utvärdering av MALDI-TOF för
typning av bakterier
- Zoonotiska agens
- Veterinärmedicinsk intressanta bakterier
UTVÄRDERING
MALDI-TOF GRUPPEN
1. Typa väl definierade
referensstammar
2. Typa bakterier i utvalda
små projekt
3. Typa bakterier med
MALDI-TOF från rutindiagnostik parallellt med
ordinarie typning
Projekt
• Fiskbakterier från
svenska vatten
• Staph hyicus
• Enterokocker
• Dichelobacter nodosus
• Staph intermedius/pseudointermedius
Projekt forts.
•
•
•
•
Baktrutin aerob/anaerob
Campylobacter
Mastitrutin
Koagulasnegativa
stafylokocker
Mastitrutinstammar Stafylokocker
namn rutin
namn MALDI-TOF
Staph. aureus
Staph. aureus
KNS
antal
min score
max score
50
2,179
2,472
Staph. chromogenes
6
2,242
2,399
KNS
Staph. cohnii
3
1,954
2,008
KNS
Staph. epidermidis
4
2,142
2,259
KNS
Staph. haemolyticus
2
2,014
2,069
KNS
Staph. hominis
1
2,254
2,254
KNS
Staph. sciuri
1
2,111
2,111
KNS
Staph. simulans
5
2,181
2,359
KNS
Staph. warneri
1
2,127
2,127
Mastitrutinstammar
namn rutin
namn MALDI-TOF
Str. dysgalactiae
Str. dysgalactiae
17
2,113
2,392
Str. uberis
Str. uberis
14
2,034
2,309
E. coli
E. coli
9
2,247
2,439
Arc. pyogenes
Trueperella pyogenes
3
2,006
2,118
Enterococcus spp
Lactococcus garvieae
1
2,168
2,168
Enterococcus spp
Enterococcus faecalis
Candida
palmioleophila
1
2,468
2,468
2
2,121
2,233
Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae
1
2,487
2,487
Citrobacter freundii
Citrobacter freundii
1
2,433
2,433
Coryne. bovis
Coryne. bovis
1
2,004
2,004
Jäst
antal
min
max
Referensstammar
Namn
MALDI best match
Score value
Bacillus cereus
Bacillus cereus
2,367
Bacillus subtilis
Bordetella
bronchiseptica
Bacillus subtilis
Bordetella
bronchiseptica
1,955
Candida albicans
Candida albicans
2,108
Citrobacter freundii
Citrobacter freundii
2,224
Clostridium difficile
Clostridium difficile
2,326
2,504
Clostridium sporogenes Clostridium sporogenes
2,375
Enterococus feacalis
Erysipelothrix
rhusiopathiae
Enterococcus faecalis
Erysipelothrix
rhusiopathiae
2,425
Eschericha coli
Escherichia coli
2,479
2,015
Fusob.necroph.ssp.nec.
Fusob.necroph.ssp.nec.
2,233
Haemophilus influenzae
Haemophilus influenzae
2,256
Histophilus somni
Histophilus somni
2,113
Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae
Klebsiella oxytoca
Klebsiella oxytoca
2,387
Lactobacillus acidophilus
Lactobacillus acidophilus
2,376
Listeria Monocytogenes
Listeria monocytogenes
2,378
Mannheimia granulomatis
Mannheimia granulomatis
2,226
Pasteurella multocida
Pasteurella multocida
2,504
Proteus mirabilis
Proteus mirabilis
2,507
Pseudomonas aeuroginosa
Pseudomonas aeruginosa
2,517
Salmonella Dublin
Salmonella anatum
2,477
Staphylococcus aureus
Staphylococcus aureus
2,384
2,54
Staphylococcus aureus
Staphylococcus aureus
2,403
Staphylococcus intermedius
Staphylococcus
pseudointermedius
Staphylococcus intermedius
2,269
Staphylococcus intermedius
2,178
Staphylococcus simulans
Staphylococcus simulans
2,272
Streptococcus agalactiae
Streptococcus agalactiae
2,423
Streptococcus canis
Streptococcus canis
2,129
Streptococcus dysgalactiae
Streptococcus dysgalactiae
2,306
Streptococcus uberis
Streptococcus uberis
2,163
Streptococcus zooepidemicus Streptococcus zooepidemicus
2,543
Truperella pyogenes
Trueperella pyogenes
2,042
Yersinia entercolitica
Yersinia entercolitica
2,348
Yersinia pseudotuberkulosis
Yersinia pseudotuberculosis
2,279
Sammanfattning
• Fungerar mkt bra för bakterier inom
mastitdiagnostik
• Bra även för de flesta bakterier
klinisk veterinärmedicin
• Problem
–
–
–
–
Skilja på vissa typer av bakterier
Vissa bakterier
Viktiga fiskbakterier
Dichelobacter nodosus
• Lösning
– Förbättringar i databasen i samarbete
med Bruker Daltonics
– Samarbete medandra veterinärinstitut
Tack för att ni lyssnade
