Synopsis för kapitel 13
1. Fersht pratar om specificitet och om diskriminering mellan olika substrat, vad
menar han med det?
2. Diskutera varför en förminskning av ett substrat men en metylgrupp ger mellan
10-250 ggr svagare bindning medan en addition av en metylgrupp till ett substrat
kan försvaga bindningen ~ 105 ggr
3. Diskutera (utred) med utgångspunkt från figur 13.2 (och texten på sid 385-387)
konsekvenserna av att tRNAVal laddas med Thr och bildar tRNAValThr. Alltså, vad
händer i acyleringssätet och i hydrolyssätet i de olika situationerna av att ha
tRNAValVal och tRNAValThr.
4. I figur 13.4 beskrivs en ”generell” modell för editering i Isoleucin tRNAsynthetas. Förklara denna mekanism med en detaljerad beskrivning av
konsekvenserna för små och stora aminosyror.
5. DNA-polymeras har ofta mekanismer för editering (korrigering av fel vid
syntesreaktion). Beskriv hur fel vid syntes omedelbart kan korrigeras med 3’-5’
exonukleas-aktivitet som finns i samma polymeras. Ge en stegvis beskrivning av
hur ni tänker er att detta går till och hur experiment med det sk ”Klenowfragmentet” givit viktig information.
6. Fel vid DNA-syntesen kan repareras även en tid efter att syntesen av
dubbelsträngat DNA har avslutats. Ge en mekanism för denna editering.
Ovanstående frågor kommer att behandlas och diskuteras vid seminariet
tisdag 9/10 08.15 sal BL31
Med vänlig hälsning Nalle
