Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet SIV släkt med HIV Anna Nordqvist Simian immunodeficiency virus (SIV) är apsläktets variant på det mänskliga viruset Human immunodeficiency virus (HIV) som orsakar AIDS, d.v.s. immunbrist. SIV ger en liknande sjukdom hos apor som HIV ger hos människor. HIV tros ha uppstått från att SIV har förändrats så att det kan smitta människor. Smittan överförs via slemhinnor vid samlag, från infekterade gravida till deras ofödda barn, från ammande mödrar till det ammade barnet, via blod från t.ex. blodtransfusion eller infekterade kanyler. Det pågår mycket forskning om HIV för att hitta effektiva mediciner och ett vaccin. SIV-infektion hos apor används som en modell för att få reda på mer om HIV samt för att testa mediciner och eventuella vaccin innan de testas på människor. Virus består av en bit arvsmassa (DNA eller RNA) som omges av ett proteinhölje. De kräver levande celler och deras förmåga att kopiera arvsmassa för att bli fler. För att infektera en cell använder virus speciella strukturer på cellens utsida, så kallade receptorer. Receptorer används normalt för kommunikation mellan celler och är viktiga för normala kropps-funktioner. HIV angriper immunförsvarets celler som bär på speciella receptorer. För att ta sig in i en cell kräver HIV två receptorer. Man har sedan länge känt till att den primära receptorn är CD4, medan den andra receptorn, co-receptorn, kan variera mellan ett tiotal olika receptorer. Av dessa co-receptorer använder HIV oftast två, CCR5 eller CXCR4. Ett problem med virus, speciellt HIV, är att när de kopieras och blir fler sker ofta små misstag, så kallade mutationer. Dessa mutationer ger upphov till att det finns en mängd olika varianter av HIV som kan infektera människor. När en HIV variant har infekterat en människas cell kommer dess arvsmassa att infogas i cellens DNA och när cellen delas kommer HIV:s DNA att följa med. Detta innebär att när man en gång smittas av HIV kan man aldrig bli fri från infektionen. Mutationer gör att virus kan variera användandet av co-receptorer. Genom mutationerna kan virus också undvika immunförsvaret eftersom de nya varianterna inte känns igen. En del av arbetet med att hitta ett vaccin går ut på att kartlägga vilka co-receptorer viruset använder och när under sjukdomsförloppet de olika co-receptorerna används. I mitt arbete jämförde jag virus från sex apor som hade infekterats experimentellt med SIV. Tre av aporna var infekterade via slemhinnor, och tre via blodet. Virus hade isolerats från dessa apors blod olika dagar efter infektionen och jag testade dessa prover med avseende på co-receptoranvändandet. Jag ville jämföra om infektionsvägen spelade någon roll för vilken co-receptor virusen utnyttjade. En annan sak som jag ville ta reda på var om virus tidigt efter infektionen skilde sig från virus isolerat när sjukdomen var längre framskriden. Jag odlade celler som bar på olika receptorer. När jag infekterade dessa olika varianter av celler med SIV, lyste de celler där viruset tagit sig in med ett fluorescerande ljus. Viruset kunde bara ta sig in i cellen om det hade använt coreceptorn som cellen bar på. Jag kom fram till att det inte fanns någon skillnad på användandet av co-receptor, mellan infektion via slemhinnor eller blod. Viruset kunde även utnyttja ett större antal co-receptorer, och därmed ett större antal celltyper, i början av infektionen än senare under sjukdomsförloppet. Den mest använda receptorn för infektion var CCR5, samma som för HIV. Virus som isolerades från aporna utnyttjade samma co-receptor som det virus som de blev infekterade med. Dessa resultat kan vara viktiga för HIV forskningen, speciellt med avseende på hur viruset beter sig i början av en infektion. Swedish official title: Simian immunodefiency virus varierar sitt användande av coreceptorer Swedish credits: 20p Supervisor: Eva Maria Fenyö och Dalma Vödrös, Instutitionen för Infektionsjukdomar och Medicinsk Mikrobiologi, Lunds universitet Submission date/time: 2001-02-05 Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Studies on coreceptor use of simian immunodeficiency virus in relation to route of transmission and progressive disease Anna Nordqvist Biology, Microbiology Autumn 2000 Abstract in English Six cynomolgus monkeys were inoculated with SIVsm, by intravenous or intrarectal route. Sequential reisolates from the monkeys were tested for coreceptor use in the human osteosarcoma cell line GHOST(3), expressing the CD4 receptor and each of the chemokine receptors CCR3, CCR5, CXCR4, or the orphan receptors Bonzo or BOB. The indicator cells also carry the gene for the green fluorescent protein (GFP) that is driven by the HIV-2 LTR and becomes activated upon HIV or SIV infection. The results of the GHOST(3) cell assay were obtained by quantitative measurements of GFP production by flow cytometry. The main receptor used by the reisolates was CCR5. The reisolates also used Bonzo and to some extent BOB with decreasing efficiency over time. The ability to establish a productive infection was weak for all reisolates in all cell lines except the CCR5-expressing cell line. The use of CCR5 and Bonzo was in line with the coreceptor use of the inoculum virus. No difference of coreceptor usage was seen between reisolates from intravenously or intrarectally inoculated monkeys. Two reisolates obtained on day 13 and day 56, from monkeys inoculated intravenously or intrarectally, could enter all cell lines tested. The ability to induce GFP in cells expressing other coreceptors than CCR5 disappeared over time. A yet unidentified receptor on the GHOST(3) cells was used by one of the multitropic viruses, since the CXCR4 antagonist AMD3100 had little effect. The results show that SIV changes its coreceptor use over time, and this in a complex fashion. The use of SIV infection as a model for HIV infection can give a picture of the replication pattern at the initial phase of infection.