Datum 2014-03-12 Meddelande Meddelande 2/2014 /2014 Från Unilabs Laboratoriemedicin, Stockholm, gällande fr o m 140402 Justering av referensintervallen för P-TSH, P-Kobalamin och P-Kreatinin Beställnings- och provtagningsrutinerna är oförändrade. Komponenterna kommer att mätas med samma instrument och metod som tidigare. Referensintervallen ändras till: P-TSH 0,4 - 4,0 mIE/L P–Kobalamin 180 – 530 pmol/L P- Kreatinin Kvinnor: Män: 50 - 90 µmol/L 60 - 100 µmol/L P- APC-resistens Den funktionella koagulationsmetoden för P-APC-resistens läggs ned. Istället rekommenderas analys av B-Faktor V genotyp (Leiden). Andreia Bunescu, Överläkare Klinisk Kemi, tel 08-5870 3832 S-AMH – ny analys för bedömning av ovariell reserv Fr o m 140402 erbjuder Unilabs analysen S-AMH (Anti-Mülleriskt Hormon eller Müller inhiberande substans). AMH används för bedömning av ovariell reserv och således kvinnans fertilitet. AMH korrelerar med antalet antralfolliklar i ovarierna; nivåerna är relativ konstant under cykeln och påverkas inte av p-piller. Studier har visat att AMH-nivåerna korrelerar positivt med antalet äggceller vid en stimulationsterapi samt med sannolikheten att blir gravid (spontan eller efter en stimulation). Kvinnor med PCOS brukar ha högre AMH-nivåer än kvinnor med en normal ovulatorisk cykel på grund av ett större antal antralfolliklar. Under menopausen (åldersbetingat eller efter kemoterapi eller strålning) sjunker AMHnivåerna till icke mätbara nivåer postmenopausalt. Analys av AMH kan förbättra bedömningen av kvinnans menopausala situation.Dessutom finner AMH användning vid oklar könstillhörighet hos nyfödda (nyfödda pojkar brukar ha mycket höga värden). Referensintervall för S-AMH saknas för närvarande. 1 I en studie visades följande resultat (2,5 – 97,5% percentilen i µg/L): Män 1,3 – 14,8 Kvinnor < 0,1 – 12,6 Postmenopausala kvinnor < 0,1 Pojkar 3,8 – 160 Flickor < 0,1 – 8,9 Barbara Usener, Överläkare Klinisk Kemi, tel 0500-43 27 51 U- Oxikodon analyseras i Eskilstuna Vi utökar vårt sortiment av droganalyser i urin och har börjat analysera U-Oxikodon i Eskilstuna. Analysen kan beställas genom att skrivas som fri text på respektive remiss för droganalyser. Mats Bergström, Överläkare Klinisk Kemi, tel 016-10 59 47 Analys av dermatofyter med PCR-teknik är känsligare än odling En molekylärbiologisk PCR-baserad metod för detektion av samtliga dermatofyter finns nu tillgänglig på laboratoriet. Analysen ersätter odling av dermatofyter från provmaterial så som naglar och hudskrap. Denna metod ger ökad specificitet för typning till artnivå, högre sensitivitet i kliniska prover och kortare svarstid. Metoden kan även ersätta direktmikroskopi av dermatofyter. Mögel och jäst kan inte detekteras med denna metod, utan vid misstanke om dessa agens ska odling beställas. Metoden består av två delar; en pan-dermatofyt PCR som detekterar en gen i arvsmassan som finns hos alla dermatofyter utan att ge specifik artbestämning, medan den andra delen ger artbestämning av Trichophyton rubrum och Trichophyton interdigitale (tidigare benämnd som Trichophyton mentagrophytes). Dessa två arter är de vanligast förekommande arterna av svamp i naglar. Analysen utförs en gång per vecka, vilket medför att svarstiderna för svamp blir 2-3 veckor kortare än med nuvarande odlingsmetod. För beställning används Mikrobiologisk remiss, under rubriken Ytlig hud/nagel/hår markera ”Dermatofyt DNA”. För provtagning och svarsrutin, se provtagningsanvisningen ”Svamp, dermatofyter, PCR (DNA, hudskrap, nagel)” på www.anvisningar.se Anna Bergman, Molekylärbiolog, tel 0500-43 19 61 Utökad diagnostik av MRSA, Methicillinresistenta Staphylococcus aureus Vår PCR-baserade metod för konfirmation av misstänkta MRSA-isolat har medfört att analysen utökats för att bättre fånga upp stammar som cirkulerar ute i samhället idag. Detta medför ingen förändring avseende provtagning, svarstid eller pris. Svarsrutinen ändras dock så att förekomst av fyra specifika gener skrivs ut på svaren. Dessa är nu: • nucA-genen, gen för nukleasenzym, finns endast hos S. aureus • mecA-genen, gen för methicillinresistens, finns hos de flesta MRSA-typer • mecC-genen (även kallad mecALGA251) gen för methicillinresistens hos MRSA av typ LGA251 2 PVL-genen, gen för Panton-Valentine leukocidin, cytotoxin som ger ökad virulens hos vissa stammar av S. aureus/MRSA, orsakar nekrotiserande sår på hud eller slemhinnor MRSA-stammar med mecA- eller mecC-gen är anmälningspliktiga enligt Smittskyddslagen. • Shah Jalal, Överläkare Klinisk Mikrobiologi, tel: 08-5870 3825 Ny PCR analys för parasiter vid inhemsk smitta I analysen ”Parasit DNA cystor” ingår specifik och känslig detektion av tre patogena parasiter, Giardia intestinalis (synonym med Giardia lamblia och Giardia duodenalis), Entamoeba histolytica och Cryptosporidium parvum. Testet utförs på ett separat faecesprov (pinnprov). Testet är baserat på PCR-teknik och utförs alla vardagar. Detta test rekommenderas främst vid inhemsk smitta. Andra typer av parasiter, cystor, maskar och maskägg som kan förekomma i faecesprov detekteras inte med denna metod. Vid utlandssmitta rekommenderas därför i första hand analysen ”Parasiter, cystor och maskägg” som är baserad på mikroskopi av SAF-fix fixerat material. Denna diagnostik kan även kompletteras med det nya PCR-testet, men då krävs två olika provtagningsmaterial. Fynd av Giardia, Entamoeba histolytica och Crypsosporidium är anmälningspliktigt enligt Smittskyddslagen. Vid beställning av den nya PCR-analysen, ”Parasit DNA cystor” • Använd blå remiss Mikrobiologi - Odling och Direktpåvisning. • Ange Parasit DNA på den tomma raden under rubriken Faeces. • Använd ”Provtagningsset, universellt eSwab (rosa kork)” för faecesprovet. Vid beställning av mikroskopi ”Cystor och maskägg”, använd provtagningsrör (SAF-fix) med sked för faecesprovet. För mer information se www.anvisningar.se Shah Jalal, Överläkare Klinisk Mikrobiologi, tel: 08-5870 3825 SAF-fix rör istället för Formalin rör till parasitdiagnostik, cystor och maskägg. From vecka 12 byter vi medium i provtagningsrören för parasitdiagnostik, cystor och maskägg. Denna förändring görs av miljöskäl. Mediet heter SAF-fix och innehåller 1,5 % formalin istället för nuvarande rör med 4 % Formalin. Shah Jalal, Överläkare Klinisk Mikrobiologi, tel: 08-5870 3825 Påminnelse vid provtagning för MRSA, VRE och ESBL: Som tidigare har meddelats används provtagningsset, universellt eSwab (rosa kork) istället för Copan pinnar. Observera att ett provtagningsrör, (eSwab) erfordras till varje analys. Generellt för provtagning med eSwab, se www.anvisningar.se Shah Jalal, Överläkare Klinisk Mikrobiologi, tel: 08-5870 3825 3 Verifikationstest för positiva gonokocker införs Vi är nu i gång med verifikationstest för gonokocker. Positiva fynd med screeningtestet ”Gonokock DNA” kommer automatiskt att verifieras med annan PCR-metod innan svar lämnas. Detta kommer inte att medföra någon förändring vid provtagning eller beställning och kommer inte heller att innebära någon fördröjning av positiva provsvar. Detta konfirmerande test införs enligt direktiv från Socialstyrelsen, enligt ”Falldefinitioner - vid anmälan enligt smittskyddslagen”, där definitionen för gonorré är uppdaterad. Vid positivt verifikationstest lämnas telefonsvar. Nytt prov för odling ska då tas så att resistensbestämning och serotypning kan utföras på framodlad stam. Shah Jalal, Överläkare Klinisk Mikrobiologi, tel: 08-5870 3825 PUNKTIONER utförda på cytologen För att underlätta för patienter som hänvisas till vår mottagning för punktion så vill vi påminna om några saker: • Ge patienten information om att ringa oss för att själv beställa sin tid. Patienten får då snabbast en tid som passar. Viktigt att patienten uppfattat om den skall ha en remiss med sig eller om ni skickat den elektroniskt. • När ni gör elektroniska beställningar i Cosmic, glöm inte att gå in under rubriken ”Punktionsmottagning” (ej under Histopatologi) • Vid behov av tolk, informera patienten om att den själv måste göra den beställningen. FACS-analys Vi tar emot prover för FACS-analys mån-tors kl 08.00-15.00 Caroline Ferbe, Verksamhetschef klinisk patologi/cytologi 08-5870 3847 4 Meddelande till systemansvarig för journalsystem: Analyskod/Rapportnamn/Benämningar som ska ändras i analyskatalog from 2014-04-02: (om tabellraderna är tomma så ska ingen förändring ske i detta meddelande): Till mottagningar som använder CGM (Profdoc) Journal III Följande analyser ska in i analyskatalogen för Unilabs Stockholm Mikrobiologi (åtgärden görs under Underhåll/Labtabeller/Analyskatalog och kräver inloggning i Journal III Underhåll). För mer information se även Meddelande nr 1 2014. Analys/profil Analyskod (Extern kod) Beställningsbar1 Konfirmation GC-uretra 3178 Nej Konfirmation GC-cervix 3179 Nej Konfirmation GC-vaginalsekret 3180 Nej Konfirmation GC-svalg 3181 Nej Konfirmation GC-Urin 3182 Nej Konfirmation GC-anus/rektum 3186 Nej Konfirmation GC-ögon 3187 Nej Konfirmation GC-övrigt 3188 Nej Parasit DNA cystor - faeces 3206 Ja Dermatofyt DNA – nagel 3096 Ja Dermatofyt DNA - hudskrap 3097 Ja MRSA konfirmation 1148 Nej 1 Vid Nej så ska rutan för Ej beställningsbar för den analysen markeras i Journal III och analysen ska inte läggas med i någon grupp. Vid Ja ska rutan vara tom. Följande analyser ska läggas till i analyskatalogen för Unilabs Stockholm Kemi Serologi Analys/profil Analyskod (Extern kod) Beställningsbar1 S-HCV RNA SHCVRNA Nej Denna information samt aktuella remissversioner för pappersutskrift från Profdoc JIII finns att hämta på http://forum.profdoc.se/ (CGM Användarforum). Planeringskalender för kommande tidpunkter när ändringar sker i analyskatalogen för 2014: Onsdag 11 juni Onsdag 24 september Onsdag 26 november Frågor angående analyskataloger ställs till [email protected] Central systemförvaltningsorganisation Unilabs 5