Lab-Nytt Nr 35 2015-10-19 Från: Klinisk kemi DNA massekvensering av koagulationssystemet I många fall är det svårt eller inte ens möjligt att säkert avgöra om en patient har en ärftlig defekt i koagulationssystemet med traditionell analys av aktivitetet och/eller masskoncentration. Därför erbjuder nu Klinisk kemi i Linköping som första laboratorium i Sverige att utföra DNA massekvensering av faktorer och hämmare i koagulationssystemet fr.o.m. 1 december 2015. Sammanlagt 15 gener ingår i denna koagulationspanel (se tabell nästa sida) som sekvenseras med NGSteknik (NGS = ”next generation sequencing”). Analyspaketet täcker mutationer i proteinkodande regioner i respektive gen och kan identifiera både kända och okända förändringar. Om endast en specifik faktor eller hämmare efterfrågas ange vilken i remisstexten. Analysresultaten kommer att åtföljas av ett utlåtande. Provtagning: Två st 3 mL EDTA-rör med blod (Lila K2E 3 mL) alternativt ett st 6 mL EDTA-rör (Lila 6mL), kan skickas med vanlig post. Beställning/remiss: Fr.o.m. 151201 i ROS där analysen heter: DNA koagulationspanel För beställare utanför region Östergötland används konsultationsremiss. Pris: 8000 kr Majid Osman, docent Universitetskemist tel. 010-103 3260 [email protected] Klinisk kemi Tomas Lindahl, professor Överläkare 010-103 3227 [email protected] Diagnostikcentrum tabell på nästa sida……. www.regionostergotland.se Gener som sekvenseras i analyspaketet Gen Funktion Protein C Antikoagulation. I sin aktiva form (APC), nedreglerar APC koagulation genom att klyva faktor 5 och faktor 8. Protein S Antikoagulation. Kofaktor till protein C Antitrombin Antikoagulation. Inaktiverar flera koagulationsfaktorer. von Willebrand faktor Ett viktigt protein för koagulationen. Binder till olika proteiner och är nödvändig för trombocyternas vidfästning till skadat blodkärl. Trombin Koagulationsfaktor 2 Faktor 5 Koagulationsfaktor 5 Faktor 7 Koagulationsfaktor 7 Faktor 8 Koagulationsfaktor 8 Faktor 9 Koagulationsfaktor 9 Faktor 11 Koagulationsfaktor 11 Fibrinogen, alfa kedja Koagulationsfaktor 1, alfa kedja Fibrinogen, beta kedja Koagulationsfaktor 1, beta kedja Fibrinogen gamma kedja Koagulationsfaktor 1, gamma kedja Vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1 Återbildar vitamin K. Viktigt protein för vitamin K beroende koagulationsfaktorer (F2, F7, F9, F10, protein C, protein S, m.fl.). Gamma-glutamyl karboxylas Nödvändig för gamma-karboxylering av K-vitamin beroende koagulationsfaktorer. Klinisk kemi Diagnostikcentrum www.regionostergotland.se