Calicivirus och andra virus
Kjell-Olof Hedlund
Enheten för Speciell Diagnostik
Smittskyddsinstitutet
Tarmen kan liknas vid ett
kärl som lämpar sig mycket
väl för virusodling
Ryhovs sjukhus drabbat av
vinterkräksjukan
Länssjukhuset Ryhov har drabbats av flera fall av
vinterkräksjuka. Nu tvingas sjukhuset införa restriktioner på
två avdelningar
– Ett hundratal patienter och vårdpersonal har drabbats
hittills, säger Per-Erik Åbom, smittskyddsläkare i Jönköpings
län.
Musslor och ostron kan orsaka
vinterkräksjuka
Musslor och ostron kan innehålla bakterier och virus som orsakar
exempelvis vinterkräksjuka hos människor.
Det visar en ny studie som genomförts av docent Bodil Hernroth vid
Kristinebergs marina forskningsstation i Fiskebäckskil, rapporterar Ekot.
Varning för extrem kräksjuke-epidemi
Var tionde svensk riskerar att smittas i höst
Hundratusentals svenskar riskerar drabbas av en extremt smittsam och svår
form av vinterkräksjuka i höst.
- I värsta fall kan tio procent av befolkningen smittas, säger
Smittskyddsinstitutets chefsmikrobiolog.
Virus som orsakar magsjuka
Rotavirus
Adenovirus
Astrovirus
Calicivirus
Norovirus, ”vinterkräksjuka”
Sapovirus
What virus have you got?
Single case, no epidemiology.
Community:
Adult:
Calicivirus
Child:
Calicivirus, rotavirus, astrovirus, adenovirus.
Health care:
Adult:
Calicivirus, rotavirus, astrovirus.
Child:
Calicivirus, rotavirus, astrovirus, adenovirus.
Spridning norovirus och rotavirus
(Moreno-Espinosa et al, 2004)
Frekvens norovirus och rotavirus i olika
åldersgrupper
Virus som orsakar magsjuka
Rotavirus
Adenovirus
Mkt virus; mkt lång utsöndringstid; stabil
Astrovirus
Mkt virus; lång utsöndringstid; stabil
Mkt virus; utsöndringstid dåligt känd; stabil
Calicivirus
Relativt mkt virus; ofta lång utsöndringstid;
relativt stabil; mkt stor variation
Diagnostikutveckling i Sverige;
norovirus
Under 1980 – 1995 diagnostik endast med
elektronmikropskopi.
1995 – 2000 utvecklades PCR.
2004 – känslig realtids-PCR.
Resultatet:
Diagnostiken hittar nu norovirus i patientprov under
mycket lång tid.
Skärpt uppmärksamhet på nya varianter
Immunologisk påvisning; ingen större succé i
Sverige, men i Tyskland…..
Vad är vinterkräksjuka?
• Winter vomiting disease.
• Utbrott av kräkningar/diarré orsakade av
norovirus.
• Vanligaste orsaken till livsmedelsburna
utbrott.
• Vanligaste orsaken till vårdrelaterad smitta.
– Vanligaste skälet till föräldrars oro för
dagissmitta.
– Vanligaste sökordet på Vårdguiden.
• En av de mest stabila patogener som sprids inom
vården.
Vinterkräksjukan i backspegeln.
1929; Zahorsky beskriver ”Winter vomiting
disease”.
1963; Justus Ström beskriver
vinterkräkningarna i sin bok ”Akuta
infektionssjukdomar”.
1972; Kapikian et al beskriver ”Norwalk
agent” efter ett skolutbrott i Norwalk (Ohio).
1990; Norwalkvirusets hela genom publiceras i
Science (Jiang et al.).
2002- ; “Humana blodgruppsantigen fungerar
som receptorer för norovirusinfektion”
(Marionneau et al).
Calicivirus in Sweden 1986-2005
600
Number of patients
500
400
300
200
100
0
1987
1994
2002
2002
Varför är norovirusinfektioner
så vanliga?
Låg infektionsdos.
Motståndskraftiga mot desinfektionmedel
/stabila i miljön.
Stor human reservoar, utdragen virusutsöndring.
Kortvarig stamspecific immunitet (veckor till
månader).
Många smittvägar.
Stamdiversitet, genetisk plasticitet.
Norovirus kan spridas mycket
effektiv i vården.
Utsöndras i mycket stort antal.
Lång utsöndringstid hos normalt friska
personer.
Kroniska bärare; (A)symtomatiska.
Asymtomatiska bärare vid utbrott.
Lång överlevnad i miljön.
Svårsanerad.
Efter vintern 2002-3 började SMI
kartlägga norovirus inom vården:
Labrapporter: Landets samtliga laboratorier
rapporterar sina norovirusfynd varje vecka.
Utbrott inom vården: Vårdhygien
rapporterar veckovis utbrott inom olika
vårdformer.
Typning av virusstammar: Molekylär
karaktärisering av cirkulerande
virusstammar.
Fynd av norovirus per vecka
500
450
Antal
400
Norovirus
Norovirus
Norovirus
Norovirus
Norovirus
Norovirus
2005-06
2006-07
2007-08
2008-09
2009-10
2010-11
350
300
250
200
150
100
50
0
27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 53
2
Vecka
4
6
8
10 12
14 16
18 20 22 24 26
Antal rapporterade fynd av norovirus per säsong
9000
8000
7000
Antal fynd
6000
5000
4000
3000
2000
1000
0
2003-4
2004-5
2005-6
2006-7
2007-8
2008-9
2009-10
Lokala variationer i norovirusfynden
160
HS+KS 2007-8
Västra Götaland 2007-8
Umeå 2007-8
Malmö 2007-8
120
100
80
60
40
20
25
23
21
19
17
15
13
11
9
7
5
3
1
51
49
47
45
43
41
39
37
35
33
31
29
0
27
Antal fynd per vecka
140
al
m
Laboratorieort
I
Vä
st
er
ås
1400
SM
ö
G
öt
eb
or
g
So
ln
a
Hu
dd
in
ge
Li
nk
öp
in
g
Up
ps
al
a
Bo
rå
s
Sk
öv
de
Jö
nk
öp
in
g
Ha
lm
st
ad
Ka
rls
ta
d
Um
eå
M
Antal virusfynd under säsongen
Jämförelse säsongerna 2008-9 och 2009-10
1600
2008-2009
2009-2010
1200
1000
800
600
400
200
0
G
ot
la
n
Ö
Sk d
Vä ste ån
st rgö e
ra
t
G land
öt
a
G la n
äv d
le
Jö bo
nk rg
ö
Vä pin
rm g
la
Up nd
ps
a
Ha la
St lla
o c nd
kh
ol
m
Vä Ö
st re b
Sö ma ro
de nla
Vä r m nd
st anl
er an
n
Vä orr d
st lan
er
bo d
Jä tte n
m
Kr tlan
on d
ob
e
Da r g
la
r
Ka na
No lm
rrb ar
o
Bl tten
ek
in
ge
Incidens per landsting; vecka 01 - 22 (fynd/100 000 invånare)
120
100
80
60
40
20
0
Åldersfördelning fynd av norovirus 2003-2009
600
65+ år
0-64 år
Antal fynd per vecka
500
400
300
200
100
0
2004
2005
2006
2007
2008
2009
Belastningen på vården under
säsongstopp
400-500 diagnostiserade fall varje vecka –
4000-5000 sjuka.
20-40 rapporterade utbrott varje vecka –
ett par hundra pågående utbrott.
Kostnader???
Rapporterade labfynd av norovirus
England/Wales
Genogroups/genotypes of the human
norovirus based on capside sequences
Genogroup I
Norwalk
Southampton
Desert Shield
Queen’s Arms
Musgrove
BS 5/98
Winchester
Sindlesham
……
Genotype
GI:1
GI:2
GI:3
GI:4
GI:5
GI:6
GI:7
GI:8
GI:9-14
Genogroup II Genotype
Hawaii
Melksham
Mexico
Lordsdale
Hillingdon
Miami
Leeds
Amsterdam
……
GII:1
GII:2
GII:3
GII:4
GII:5
GII:6
GII:7
GII:8
GII:9-17
Årsvarianter norovirus GII.4 samt övriga genotyper
Antal typade stammar per månad
2010
2008
45
2007
40
2006b
35
2006a
30
2004
2002
25
20
15
10
5
0
Icke GII.4
2010
2010
Norovirussäsongen 2010-2011:
•
Relativt tidig start.
–
•
Norovirus GII.4 variant 2010 blir helt
dominerande.
–
•
Ny dominant variant.
Började cirkulera sent förra säsongen,
undantaget Skåne.
Skapa stora bekymmer inom vården.
–
Nya varianter ger höga rapporteringssiffror
vartannat år.
Smittsamhet utan symtom?
Volontärstudie (1994)
Sjukhusstudie (2004) under utbrottsäsong
56% (28/50) med symtom.
26% (13/50) infekterade utan symtom.
26% (23/87) personal utan symtom; positiva med PCR.
33% (4/12) patienter utan symtom; positiva med PCR.
Alla GII.4
Ingen misstanke om att dessa orsakade utbrott.
Klinisk bild vid olika genotyper av
norovirus
Friesema et al (2009) J Clin Virol 46; 341-44.
Men, liten studie, begränsad i tid!
Kraftigare symtom (kräkning/illamående) vid
GII.4 än andra (GI.3, GI.6, GIIb, GII.3, GII.7).
Högre AR hos boende vid GII.4.
Mer illamående/feber vid variant 2004 än 2006a.
Stora skillnader i ct-värde gav ingen skillnad i AR
eller symtom.
Virusinnehåll ~100 större vid GGII infektion än
vid GGI.
Viruskontamination inom en
isoleringsenhet för immundefekta
barn
Inga bevis för gastroenterit hos patienter.
Svabbprov togs från 11 ytor under 10 veckor.
Virus påvisades i 20 svabbprov.
Norovirus 6%.
Rotavirus 10%.
Kontaminerade platser var ofta knutna till
föräldrars passage genom enheten.
”Smittade bakelser”
• 30 sjuka efter att ha ätit rosa
bakelser.
• Rosa bakelser med mosade hallon, gröna
med päronextrakt.
• Calicivirus hos de sjuka, hallonen
skickas till Frankrike.
• Två typer av calicivirus påvisas i
hallonen!
Smittöverföring av rotavirus
Fekal-Oral
Person-till-person smitta
Objektsmitta (t ex leksaker)
Aerosol
Hög smittsamhet
10-100 viruspartiklar är tillräckligt för
smittöverföring…
…upp till 10,000,000,000 viruspartiklar/ml
utsöndras i avföringen
Hög viabilitet, rotavirus kan överleva i
veckor
I tex kontaminerat vatten eller på objekt
Asymtomatiska individer kan sprida
3
smitta
Age and Serotypes; Rotavirus
G9
Number of Patients
30
G4
G1
25
20
15
10
5
0
0-10
11-20
21-30
31-40
41-50
51-60
Age group
61-70
71-80
81-90
91-100
Age of patients with sapovirus infection
Period 1 (Oct 1994-Oct 2002)
40
Period 2 (Nov 2002-July 2004)
Number of patients
35
30
25
20
15
10
5
0
0-10
11-20
21-30
31-40
41-50
51-60
61-70
71-80
81-90 91-100
