Leukemi hos barn och ungdomar Diagnostik Stefan Söderhäll Sektionen för onkologi och koagulation Astrid Lindgrens Barnsjukhus Med en del bilder från Cilla Söderhäll Novum Huddinge Hematopoes myeloid stamcell pluripotent stamcell megakaryocyter erytrocyter basofiler eosinofiler Differentiering granulocyt/monocyt B lymfocyt lymfoid stamcell T lymfocyt Diagnostik/ terapisvarbedömning • Benmärgsaspiration – Morfologisk analys aspirat/biopsi – Immunfenotypning – Genetisk analys • • • • • • Kromosomanalys (traditionell) DNA index FISH (interfas) PCR för Translokationsanalys och MRD analys CGH array Sekvensning – Lumbalpunktion När och hur? • Klinisk undersökning – – – – – Allmäntillstånd Blödningar, petechier Körtlar, lever-mjältförstoring Andning, halsvenstas Testikelpalpation Riskgruppering idag • Vad är det för risk vi menar? • Hur bestämmer man den? • Är den alltid lika stor eller kan den förändras? • Vad påverkar risken? Prognostiska faktorer ALL LPK vid insjuknandet • Ålder • Lymfomatösa manifestationer • CNS engagemang • Immunofenotyp • Cytogenetik / DNA ploidi • Initialt terapisvar Konventionell teknik Minimal residual disease (MRD) Immunofenotypning fluorokrom monoklonal antikropp differentierings associera ytantigen malign cell Leukemier indelas efter transformerad ursprungscell och identifieras efter sitt uttryck av olika ytantigener Giemsa banded Karyotype Spectral Karytyping SKY SKY (spectral karyotyping) Interfas fluorescerande in situ hybridisering = interfas FISH Kromosomanalys av ALL celler • Prognos+ • t(12;21)(p12;q22),TEL-AML1, 20%?, pre B (“kryptisk”) • Hyperdiploidi modaltal 47-50, 15%, pre B • Hyperdiploidi modaltal 51-65, 25%, pre B • Prognos- • t(9;22)(q34;q11), BCR-ABL, 3%, B/pre-B • t(4;11)(q21;q23), MLL-AF4 och varianter, 2%, pre-pre B • Hypodiploidi <44 • dic(9;20), preB • t(1;19)(q23;p13), E2A-PBX1, 5%, Kromosomanalys – Genetisk analys vid AML • Prognos + • t(15;17)(q22;q11-21) , PML-RARA, 7% ?, M3 • inv16 , CBFb-MYHll, 7%, M4EO • (t(8,21)(q22;q22) , AML1-ETO, 10%, M2) • Prognos - • monosomi 7 • t(1;22)(p13;q13), ? , 2%, M7 Differentialdiagnoser diagnostik hjälp • Icke maligna sjukdomar – Bakteriell infektion speciellt meningokocksepsis – Virala infektioner i synnerhet • EBV, CMV – Idiopatisk trombocytopen purpura ITP • retikulocyter – Aplastisk anemi • Biopsi!!!! Upprepade BM prover – Hemolytiskt uremiskt syndrom • Kreatinin, blodtryck, retikulocyter, hemolystecken Differentialdiagnoser • Maligna sjukdomar – Myelodysplasi – Maligniteter med benmärgsinfiltration ex • Bilaterala prover, biopsier • Neuroblastom • Lymfom • Ewing sarkom • Mjukdelssarkom • Mfl som metastaserar till benmärgen Bedömning av terapisvar • Klinik • Blodvärden – transfusionsintervall • Morfologi – D15, d29, d78 • Flödescytometri MRD – D15? Fångar upp ev markörskift samt snabbt terapisvar – Känslighet ner till 10-4-(10-5) • PCR MRD – Immunglobulinrearrangemang, T-cellsreceptorrearrangemang – Specifika translokationsrearrangemang – Känslighet ner till 10-5 • FISH – Begränsad känslighet %-nivå GCSF I-D+/P+ Induction with dexa. or pred. VCR/Dexa reinductions DepoCyte/pred.succinate IIDC DI w/ daunorubicin and cyclo i.t. MTX HDMTX with i.t. MTX IIC DI w/ cyclo TIT with conventional AraC PEG-asparaginase II DI w/o daunorubicin and cyclo NOPHO ALL-2008 MRD timepoints d0 d29 SCT* d79 d15 BM: HR (10-15%): preB>100 or T A MLL Hypo<45 C A B C A B C IIC R3 6MP MTX >10-3 I-D+ IR (35%): <10-3 t(1;19) Amp21 CNS3 dic(9;20) I-P+ SR (50-55%): <10-3 HDMx3, PEGasp 6MP 25-75mg/m2 R1 >10-3 preB<100 B R2 IIDC 6MP MTX IIC HDMx3, PEGasp 6MP 25mg/m2 R1 R2 6MP MTX II HDMx3, PEGasp 6MP 25-75mg/m2 0 4 5 12 R1 6MP dose increments (25-50-75 mg/m2 if HDM w/o ANC<0.5 and T<50), 130 N=900-1000 R2 PEG-asparaginase 1.000 IU/m2 at 2 vs 6 weeks intervals weeks 13-33, N=900-1000 R3 Standard TIT vs DepoCyte/pred.succinate at 12w intervals x6, N=100-130 *SCT if d29 M2/3 or d79/post-B >10-3 Svensk version 2008-12-30 MRD begreppet minimal residual disease Nya tekniker för att mäta små kvarvarande mängder leukemiceller Terapisvar d29 och d79 mätt med MRD slår ut nästan alla andra prognosfaktorer EFS 100 D29 MRD < 1‰ 75 50 0 1 2 3 4 Years from Dx 5 6 Flödescytometri % leukemi-lika av alla Framrenade mononukleara celler PCR restmängd jämförd med klonen som karakteriserades vid diagnos Minimal residual disease assessment in childhood acute lymphoblastic leukaemia: a Swedish multi‐centre study comparing real‐time polymerase chain reaction and multicolour flow cytometry British Journal of Haematology Volume 152, Issue 6, pages 743-753, 20 JAN 2011 DOI: 10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x/full#f3 Minimal residual disease assessment in childhood acute lymphoblastic leukaemia: a Swedish multi‐centre study comparing real‐time polymerase chain reaction and multicolour flow cytometry British Journal of Haematology Volume 152, Issue 6, pages 743-753, 20 JAN 2011 DOI: 10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x/full#f4 British Journal of Haematology Volume 152, Issue 6, pages 743-753, 20 JAN 2011 DOI: 10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x/full#f4 British Journal of Haematology Volume 152, Issue 6, pages 743-753, 20 JAN 2011 DOI: 10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2141.2010.08456.x/full#f5 Riskindelning – dag29 Nonhigh från början MRD < 0,001 (=0,1%) Ja < 0,1% HR cytogenetik? Ja Nej IR cytogenetik? Ja Nej CNS3? Ja Nej ≥ 0,1% >5% blaster i BM? Nej HR cytogenetik? Nej Nej Standard Ja Intermediär Ja HR + SCT HR CGH-Array CGH Comparative genome hybridization CGH-Array Comparative genome hybridization CGH-Array CGHC Next generation DNA sequencing/ massively parallel DNA sequencing • Nya metoder för storskalig sekvensering • Ett fåtal märken på marknaden (2004->) som använder olika teknologi • Gemensamt – DNA molekylerna fästs på yta – Parallell sekvensering – Sekvensen läses i realtid – Korta sekvenser – snabbare och billigare Kan automatiseras => snabbare och billigare => projekt som för några år sedan var helt orimliga kan idag genomföras på några månader Metodbeskrivning • • • • • • Fragmentera provet Gör bibliotek Fäst till yta Amplifiera Sekvensera Sekvensanalys – Pussla samman sekvensen december 5, 2014 Cilla Söderhäll 28 Metodbeskrivning RNA • • • • • • Fragmentera provet Gör bibliotek Fäst till yta Amplifiera Sekvensera Sekvensanalys cDNA – Pussla samman sekvensen cDNA = DNA sträng som tillverkats från RNA mall 29 Riktad ResekvenseringDNA Exom • Exom = alla kända exon i ett genom • Anrika för exonsekvenser – Jämför sekvens mellan sjuka och friska – monogena sjukdomar • Fördelar: – Mycket mindre än hela genomet (1,5%) – Störst chans att hitta något här • Nackdelar: – Labintensivt – Endast exon 30 Major changes in AML 2012 MRD flow is used for evaluation of treatment response Intensification and lengthening of induction courses Risk grouping refined HR definition Poor response after course 1 ≥ 15% LC Poor response after course >4.9% after induction 1 Poor response still after induction 2 >0,1% FLT3-ITD without NPM1 mutation Standard risk patients receive three consolidation courses Standard risk patients with Inv(16) receive two consolidation courses Konstitutionell genuppsättning • • • • • Exempel Variation i omsättning av läkemedel Olika subtyper av leukemi Olika DNA reparationsförmåga Mm, mm AML jämförelse Down och övriga 1,0 ,9 ,8 0.82 (n=36) DS Probability ,7 ,6 0.50 (n=242 non-DS ,5 ,4 ,3 ,2 ,1 0,0 0 1 2 3 4 5 6 Years from diagnosis 7 8 9 Transkriptomsekvensering RNA • RNA cDNA • Alla uttryckta gener sekvenseras – Varierar mellan vävnader – Varierar över tid – Skillnad mellan sjuka och friska? • Mängden reads motsvarar uttrycksnivån • Information om transkriptens utseende – Transkriptionsstart – Splice varianter – Nya transkript december 5, 2014 34