Institutionen för biomedicin
Avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Apotekarprogrammet termin 2
Omtentamen på kurs "Cellen och dess arvsmassa" (CEB210)
2017-04-08
kl. 12.30-17.30, skrivsalen Folkets hus
Namn:…………………………………………………..
Personnr: ……………………………………………….
Denna skrivning har kodnummer:
OBS! Skriv ditt kodnummer på samtliga sidor
Namn och personnummer endast på denna sida
Denna sida kommer att avlägsnas före rättning
ALLA frågor kan besvaras på engelska eller svenska, UTOM där det
specifikt anges att svaret skall vara på engelska.
Tillåtna hjälpmedel: Miniräknare ej tillåtet
Svaren måste alltid skrivas på samma papper som frågan.
Om utrymmet ev. inte räcker till, använd papperets baksida.
Några 2-poängsfrågor (men inte alla) har placerats på samma blad för att
förenkla hanteringen vid rättning. Detta har ingenting att göra med hur långt
svaret förväntas vara.
Märk: Samtliga frågor förväntas besvaras med egna ord. Längre direkta citat
från lärobok, Wikipedia eller andra källor visar ej på förståelse av frågan och
kan ge poängavdrag även om svaret är faktamässigt korrekt.
G-gräns: 34 p. LYCKA TILL!
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
2
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 1 (ÅTN)
Nämn två typer av molekyler i cellen som bär på energi och i vilken del av cellen som de
produceras. (2 p)
Fråga 2
a) räknas ribosomen till cellens organeller? förklara varför eller varför inte!
b) var hittar man ribosomer som håller på och gör proteiner som ska transporteras ut ur
cellen? (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
3
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 3 (EJ) (2 p)
a) Förklara begreppet upplösning (resolution)
b) vilken upplösning har ljusmikroskopet?
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
4
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 4 (ML)
What is the difference between a flagellum and pili on the bacterial surface?
Briefly explain some possible functions of bacterial pili. (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
5
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 5 (MN/AR)
Vad är WGS (whole genome sequencing), nämn två typer av mutationer man kan hitta
med WGS. (2 p)
Fråga 6 (MN/AR)
Vad kan gå fel i en PCR amplifiering? Nämn två exempel, beskriv hur resultat kan bli
och varför det blev fel. (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
6
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 7 (MN/AR)
Du vill producera humant insulin i ett bakteriesystem. Utgå från att genen är känd och att
du har den i en vektor men detta är ingen expressionsvektor. Genen du har innehåller bara
exon (inga intron). Beskriv hur du kan gå till väga. Börja med hur du klonar in genen i en
expressionsvektor. Vilken expressionsvektor samt vilket expressionssystem väljer du och
varför? (Essäfråga, 4 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
7
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 8 (AC)
The binding of tryptophan to the tryptophan repressor causes the tryptophan repressor to
bind to the tryptophan operator. If you replaced the Lac operator DNA with DNA from
the operator region of the tryptophan operator, predict what would happen to the
expression of LacZ when the tryptophan concentration is either high or low. (2 p)
Fråga 9
Our DNA can be damaged in a process called deamination. What happens if cytosine is
deaminated in the following sequence TCGA? Describe how the deaminated product
likely may be replicated in a mutagenic way. (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
8
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 10 (AC)
The ends of eukaryotic chromosomes have a specific region with repetitive nucleotide
sequences. What is this region called and give two reasons why this region is required at
the end of a eukaryotic chromosome. Describe how this region is replicated. (Essay
question, 4 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
9
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 11 (EL)
Hur förändras kromosomernas struktur när celler går från interfas till mitos, och hur ser
DNA:t ut precis innan mitosen? (2p)
Fråga 12
Varför behövs bioinformatik inom biomedicinsk forskning? Ge fyra korta exempel.
(2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
10
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 13 (DB)
När man gör northern blot separerar man moget fullängds-mRNA på en agarosgel
(separation efter storlek), för över RNA:t till ett membran och detekterar ett specifikt
mRNA genom hybridisering med en radioaktiv prob (prob = kort bit ssDNA eller RNA
som är komplementär mot en liten del av det sökta mRNA:t).
Du kör northern blot med mRNA från 4 olika vävnader från samma försöksdjur. Du
använder två prober som är komplementära mot varsin del av den proteinkodande
sekvensen i genen för ett mRNA som du är intresserad av. De sekvenserna finns bara i
denna gen. Banden i figuren visar mRNA som proberna hybridiserat med.
Föreslå en förklaring till varför det mRNA som proberna känner igen skiljer sig i storlek
mellan olika vävnader, och varför prob 2 inte binder till mRNA:t från tunntarm (du är
fena på RNA-extraktion så inget av dina prover innehåller nedbrutet RNA). (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
11
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 14 (DB)
Rita en enkel skiss över hur en eukaryot enhancer-sekvens som ligger, säg, c:a 3 kb från
transkriptionsstarten kan interagera med proteinkomplexet som binder RNA-polymeras
vid promotorn. Rita ut DNA:t och de viktigaste proteinerna som förmedlar effekten.
Förklara helt kort (bara ett par ord) vad proteinerna gör. (2 p)
Fråga 15 (DB)
Du undersöker en ärftlig neurologisk sjukdom som beror på att ett protein P bildar
olösliga aggregat i cytoplasman som skadar nervcellerna. Till din förvåning ser du att
proteinet P inte verkar vara muterat eller ändrat på något annat sätt – trots att det bildar
aggregat lättare. Du ser också tecken på att även en del andra proteiner bildar aggregat.
Ändå vet du att det bara är en enda gen som är skadad i den här sjukdomen. Föreslå ett
protein som den muterade genen kodar för. Motivera ditt svar. (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
12
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 16 (DB)
Beskriv de olika steg som en aminosyra genomgår från att befinna sig i fritt tillstånd till
att ha blivit en del av en polypeptidkedja. Lägg särskild vikt vid att ange villka andra
molekyler aminosyran interagerar med (och med vilken del av aminosyran interaktionen
sker). Hur tillförs energin som reaktionerna kräver? (Essäfråga, 4 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
13
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 17 (MP)
Draw a Punnett square to summarize the outcome of a cross between Tt heterozygous and
TT homozygous plants. (2p)
Fråga 18 (MP)
Describe the genetic defect and symptoms of Klinefelter syndrome. (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
14
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 19 (MP)
Define one genetic map unit (1p), and carefully explain how you could measure the
genetic distance between the fruit fly X-linked loci y (yellow body) and w (white eye).
Assume that you are provided with Yellow White double homozygous mutant female
flies and wild-type (i.e. normal) males. Your answer should describe the crosses that you
would perform and specify what you would score to measure the genetic distance
between the two loci (3p). (Essay question, 4 p total)
.
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
15
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 20 (PC)
Allelfrekvensen för en autosomalt dominant sjukdomsallel är 1/10 000 (= 0,0001). Hur
stor andel av befolkningen har sjukdomen? Visa hur du räknar och definiera alla införda
variabler. (2 p)
Fråga 21
Kroppslängden, vilket är en egenskap med hög heritabilitet, mäts i två populationer: en
stor heterogen population med stor genetisk variation, och en liten, inavlad population
med hög grad av homozygoti. Det visar sig att längden är normalfördelad i båda
populationerna och att medelvärdet är detsamma i båda. Ett annat mått som beskriver en
normalfördelnings utseende skiljer sig dock markant mellan populationerna. Vad kallas
detta mått, vad beskriver det och i vilken population kan man anta att det är störst?
Motivera. (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
16
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 22 (PS)
För ett antal sjukdomstillstånd med ärftliga komponenter, kan de alleler som identifierats
i GWAS (genome-wide association studies) som inblandade i benägenheten att få
sjukdomen, sammantaget endast förklara en liten del av den totala ärftligheten. Detta har
kallats ”the paradox of missing heritability”. Ge en möjlig förklaring till detta fenomen.
(2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
17
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 23 (MePa)
What are the 3 different conformation types of plasmids and, relative to each other, how
fast do they migrate through the gel? Briefly explain the differences. Please answer in
English! (2 p)
Tentamen CEB210
Apotekarprogrammet, termin 2
Institutionen för biomedicin
2017-04-08 kl. 12.30-17.30
18
Kod…………
………………………………………………………………………………………………
Fråga 24 (HS)
You have tried to delete a gene in a group of mice by knock-out technology. You will
now perform a PCR reaction in order to find out which mice actually lack the gene. Your
aim is to identify which mice are wildtypes, heterozygotes (lacking one gene copy) or
knock-outs (lacking both). Which primers should you use and how will this allow you to
differentiate between the genotypes? (2 p) Please answer in English!
