KARLSTADS UNIVERSITET Inst. För hälsovetenskaper Tentamen i Molekylär Cellbiologi 7,5 hp BMGBM0 Datum: 2013-08-19 Tid: 8.15-13.15 Sal: Se anslagstavlan i universitetets huvudentré Lärare: Jonny Wijkander (0709-547197) Maria Rova (0706-220754) Skriv anonymitetskod på alla papper! Mer än en fråga får besvaras på varje svarspapper men börja på nytt svarspapper för varje tentators frågor. Maxpoäng 100 p Godkänd 50 % Väl godkänd 75 % Lycka till Sekreterare: Claes-Göran Almehag 700 2071 Maria´s frågor 1. 2. 3. a)Nämn ett proteinmotiv som kan förekomma i en DNA-bindande del av ett protein. 2p b) Beskriv strukturen av proteinmotivet ovan. 2p Chaperoniner och proteasomer är två strukturer som är viktiga för cellens funktion. Beskriv kortfattat struktur och funktion av: a) Chaperoniner 3p b) Proteasomer 3p UV-ljus kan ge upphov till skador på DNA´t som i sin tur kan leda till hudcancer. a) Förklara hur UV-ljus skadar DNA´t. 3p b) Vad kallas den process som cellen kan använda för att återställa DNA´t efter UV-skador. 2p 4. Vad är ett Alu-element? 3p 5. Beskriv histonproteinernas funktioner. 5p 6. Det finns allmänna och specifika transkriptionsfaktorer. Förklara skillnaden mellan dem. 3p 7. Beskriv hur miRNA kan reglera genuttrycket. 3p 8. Beskriv vilka transportproteiner som medverkar till att tarmepitelceller kan ta upp glukos ur tarmen och utsöndra det i blodet. Rita också en bild som visar epitelcellen, transportproteinerna och transport av de medverkande ämnena. 5p Jonny´s frågor. (Börja på nytt svarspapper) 9. Proteiner syntetiseras antingen på en fri ribosom eller en ribosom som sitter på endoplasmatiskt retikulum. a) Vad är det som avgör var ett protein skall syntetiseras? (1p) b) Var syntetiseras ett protein som skall verka i peroxisomen? (1p) c) Var syntetiseras ett transmembranprotein som skall sitta i plasmamembranet? (1p) 10. Även om mitokondrien gör vissa av sina proteiner själv så är det så att de flesta tillverkas på annat ställe och importers in till mitokondrien. Ge en beskrivning av hur proteiner transporteras in till mitokondrien. (4p) 11. Det finns en grupp enzymer som får mannos-6–fosfat kopplat till sig. I-cell disease är en sjukdom där man saknar enzymet N-acetyl glukosamin fosfotransferas vilket gör att enzymerna inte får mannos-6 fosfat på sig. a) I vilken organell får enzymerna normalt sett mannos-6-fosfat kopplat till sig (dvs var finns normalt N-acetylglukosamin fosfotransferas)? (1p) b) Var hamnar de enzymer som saknar mannos-6-fosfat (dvs hos en individ som har I cell disease)? (1p) c) Var hamnar enzymerna som har mannos-6-fosfat (dvs hos en frisk individ)? (1p) 12. Ge en beskrivning av hur järn som är bundet till transferrin tas upp av celler. (4p) 13. Vissa glatta muskelceller kontraherar sig vid stimulering med acetylkolin. Detta sker genom att acetylkolin binder till en G-protein kopplad receptor som leder till ökad koncentration av Ca2+ inne i cellen och därmed kontraktion. Ge en beskrivning av signaleringen från den G-protein kopplad receptorn till ökning av Ca2+ koncentrationen. (5p) 14. Grb2 är ett adaptorprotein som har både Src homologi (SH) 2 och SH3 domäner. a) Vad innebär det att ett protein har SH2 domän? (1p) b) Vad innebär det att ett protein har SH3 domän? (1p) 15. Sos är en guanine nukleotide exchange factor (GEF), vad innebär detta? (1p) 16. När man stimulerar celler med insulin så kommer protein kinas B (PKB) att translokerar från cytosol fraktionen till membraner i cellen. a) Vad är det som bildas i membranerna och hur bildas det? (2p) b) Varför translokerar inte alla cytosolprotein till membraner vid insulinstimulering, dvs vad har PKB (och några andra protein) som inte alla andra protein har? (1p) 17 cAMP är en second messeger (andra budbäraren) som ökar i koncentration vid stimulering av en rad olika typer av celler. a) Ge en beskrivning av vad cAMP gör (vad ligger direkt nedströms om cAMP )? (2p) b) Vad gör cellen för att minska på koncentrationen av cAMP efter en stimulering? (1p) 18. Aktin är det vanligaste proteinet i de flesta celler i kroppen och detta bygger upp mikrofilament. I en cell så finns ca 50% av aktinet som monomert aktin och 50% i form av filament. Om man skulle ha samma mängd aktin i ett provrör så skulle mer än 95% av aktinet finnas i filamentform. a) Varför är bara 50% i form av filament i en cell? (2p) b) Vad har cellen för nytta av att ha så stor del av aktinet i monomer form? (1p) 19. I muskelceller så vet du säkert att aktinfilamenten interagerar med myosinfilament och ger muskelkontraktion. Ange tre olika funktioner som mikrofilament kan ha i en icke muskelcell.(3p) 20. Mikrofilament, mikrotubuli och intermediärt filament är tre typer av cytoskelett som finns i nästan alla celler. Ange 3 saker som skiljer intermediärt filament från mikrotubuli och mikrofilament (3p) 21. Fibronektin är ett extracellulärt protein som fungerar som kopplingsprotein mellan celler och extracellulärmatrix (ECM). a) Ge ett exempel på vad fibronektin kan binda till på cellers yta (1p) b) Ge ett exempel på vad fibronektin kan binda till i ECM (1p) 22. Vad är cadheriner för typ av protein och vad har det för funktion? (2p) 23. Vilka av nedanstående protein/glykoprotein är extracellulärmatrixproteiner? Lamin, elastin, dynein, selektin, aggrecan, tubulin, perlecan, aktin profilin (max 2 p) 24. Cyklinberoende kinaser (Cdk) är protein kinaser som styr mycket under de olika faserna i cell cykeln. Cdk behöver binda cykliner för att ha möjlighet att bli aktiva men oftast räcker inte detta. På vilka andra sätt regleras aktiviteten av Cdk? (3p) 25. Tight junctions har två huvudfunktioner. Vilka är detta? (2p) 26. Vi har några permanenta celler i vår kropp men de flesta har begränsad livslängd och måste därför ersättas. Hur sker förnyelse/tillväxt av a) neutrofiler (1p) b) monocyter (1p) c) tarmepitelceller (1p) 27. Ge en beskrivning av en apoptosom samt ange vad den har för funktion (3p) 28. En B-lymfocyt använder sig av genetisk rekombination av sitt DNA för att tillverka lätta och tunga kedjor hos Ig med olika variabla regioner. Detta gör att vår uppsättning av B-lymfocyter tillverkar Ig som kan känna igen flera miljoner olika antigen. Under rekombinationen sker också något som kallas ”junctional imprecision” (junctional olikheter) som kraftigt ökar antalet unika Ig. a) Beskriv den genetiska rekombinationen. b) Förklara hur ”junctional imprecision” uppkommer. ( totalt 5p) 29. Tumör supressorgener och proto-onkogener är två klasser av gener som vid mutation eller annan förändring kan ge upphov till cancer. Beskriv skillnader mellan dessa två typer av cancergener? (2p) 30. Loss-of.heterozygosity (LOH) är en mycket viktig mekanism i uppkomsten av cancer. Beskriv de båda sätt som LOH kan uppkomma.(2p) 31. En punktmutation av en proto-onkogen kan ge upphov till att den omvandlas till en onkogen och utveckling av cancer. Ge exempel på två andra sätt än punktmutation som kan omvandla en proto-onkogen till en onkogen. (2p) 32. Imatinib är ett läkemedel som används i behandlingen av cancer och då främst kronisk myeloisk leukemi. Hur verkar imatinib? (1p)