Bioteknologi, KTH Martinelle Tentamen i Biokemi, 27 Maj 2011 Kurs: BB1080, BB2380 Tid: 09.00-14.00 Salar: FB51-55 Skriv namn och personnummer på alla blad Använd separat papper för varje fråga Maxpoäng 60 p Godkänt (E) 30 p Komplettering (Fx) 28 p Lägsta poäng på tentamen för att erhålla Fx eller E mha KS-poäng är 25 p. Komplettering av betyg Fx sker muntligt efter överenskommelse mellan student och kursansvarig (kontakta kursansvarig innan omtenta i augusti). 1. Beskriv med figur hur enzymaktiviteten beror av substratkoncentrationen för fosfofruktokinas med hög eller låg ATP koncentration. Ge en förklaring till detta. 4p 2. Beskriv de molekylära händelser som adrenalin orsakar för att reglera flödet från glykogen till glukos-1-fosfat. 6p 3. Du har isolerat ett litet protein X (33 aminosyror) med intressanta egenskaper. Proteinet har följande aminosyrasammansättning: Gly 4, Ala 3, Arg 2, Lys 3, Val 4, Leu 2, Ile 2, His 1, Phe 4, Trp 1, Ser 3, Gln 1, Glu 2 och Asp 1. Beskriv de kromatografimetoder och betingelser du skulle välja att använda för att separera proteinet från blandningen innehållande ett protein Y (pI = 7) med liknande molekylvikt som X samt från protein Z (250 aminosyror) med samma pI som X. 4p 4. Beskriv i detalj mekanismen för ATP-syntas. 4p 5. Beskriv elektrontransportkedjan i fotosyntesen med substrat, produkter och ingående elektrontransportkomponenter i ett reduktionspotentialdiagram (Rita figur). (Namnge de ingående komponenterna). 6p 6. Hur bildas följande föreningar från metaboliter som sammanbinder katabolismen med anabolismen? Svara med strukturformler. (Glöm ej kofaktorer). a) Glutamin b) Glycerol c) Asparaginsyra d) Serin 4p 7. Hur regleras flödet genom pentosfosfatvägen och vad heter det enzym som regleras? Beskriv det reglerade steget med strukturformler samt kofaktor. Vilka enzymtyper behövs i den icke oxidativa delen av pentosfosfatvägen för att återföra de bildade pentosfosfaterna till hexosfosfater? 4p Bioteknologi, KTH Martinelle 8. Kofaktorparen NADPH/NADP+ och NADH/NAD+ är strukturellt mycket lika, men i cellen har de olika metaboliska funktioner. Hur reduceras och oxideras dessa kofaktorer och vilka funktioner har de? 4p 9. Glukos-6-fosfat har en strategisk position i metabolismen och kan deltaga (bildas eller utnyttjas) i ett flertal olika reaktioner. Ge med strukturformler exempel på fyra sådana reaktioner. Föklara vilka metaboliska sekvenser de deltager i samt vad cellen har för mål med dessa sekvenser. (Glöm ej kofaktorer). 4p 10. Beskriv med strukturformler biosyntesen av en fettsyra med 16 kolatomer från acetyl-CoA. Jämför denna process med katabolismen av samma syra till acetyl-CoA. Visa på likheter och skillnader i de två processerna. Strukturer på kofaktorerna behöver ej ges. 6p 11. Beskriv i detalj enzymet pyruvatkarboxylas och den reaktion enzymet katalyserar. 4p 12. När kroppen har dålig tillgång på glukos, på grund av längre svält eller kraftig ansträngning, förlitar sig kroppen på glukoneogenes från proteiner. Beskriv översiktligt (kända metaboliska sekvenser behöver ej beskrivas i detalj) hur alanin i ett protein omvandlas till glukos i blodbanan. I vilket organ sker detta? 4p 13. Hur många ATP och GTP åtgår vid syntesen av ett protein med 150 aminosyror. Utgå från fria aminosyror, t-RNA, m-RNA, ribosom samt nödvändiga proteiner/enzymer. Motivera svaret genom att beskriva processerna i detalj. 6p