Bioteknologi, KTH Martinelle Tentamen i Biokemi, 21 augusti, 2006 Kurs: 3A1109, 3A1115 Tid: 9.00-14.00 Salar: FB51-52 Använd ett papper per fråga Skriv namn och personnummer på alla blad Maxpoäng är 60 och för godkänt krävs 30 p Kompletering vid resultat 28 p och 29 p. Kontakta Mats Martinelle ([email protected]). 1. a) Ange Michaelis-Menten ekvationen för en enzymkatalyserad reaktion med substrat S. b) Beskriv vad en kompetitiv inhibitor är. c) Rita ett energi-reaktionskoordinat-diagram för följande enzymatiska process där jämvikten är förskjuten åt produktbildning. Rita även in transition-state, TS. E+S ES EP E+P E: enzym, S: substrat, P: produkt Ange i figuren ΔG för substratbindning och för hela processen samt aktiveringsenergin. 6p 2. Hur kan nedanstående proteiner separeras med elektrofores i analytisk skala? Beskriv översiktligt de metoder du väljer. Separationsprincipen för metoderna ska klart framgå. 4p Protein A Protein B Protein C pI 4.3 7.0 7.0 Mw 44 kD 85 kD 44 kD 3. a) Rita en fosfolipid med strukturformler. b) Beskriv översiktligt aktiv och passiv transport av molekyler över ett membran i en cell. c) Beskriv på molekylär nivå hur joner kan transporteras över ett membran i en cell mot en högre koncentration. 5p 4. Hur fungerar synen. Beskriv i detalj hur en foton orsakar en nervimpuls. 4p 5. Beskriv elektrontransportkedjan i kloroplaster (ljusreaktionen) med substrat, produkter och ingående elektrontransportkomponenter (Rita figur och namnge deltagande komponenter). Ange tydligt processens elektrondonator och elektronacceptor samt summaformel för processen. 6p 6. Beskriv ett enzym som har ”proof-reading” mekanism. Ange enzym och processen enzymet deltar i. Beskriv ”proof-reading” mekanismen. Ange reaktionsformel samt rita med strukturformler bindningen som skapas. 5p vänd Bioteknologi, KTH Martinelle 7. Beskriv den oxidativa delen av pentosfosfatvägen med strukturformler. Namnge de ingående metaboliterna och enzymerna. Formler på koenzymer behöver ej visas. Hur regleras flödet genom denna väg? 4p 8. Beskriv vilka energikällor vi utnyttjar för att producera ATP från ADP vid olika intensitet på muskelarbete. Antag att vi inte utsatts för en långvarig fasta innan arbetet. 4p 9. Beskriv med strukturformler citronsyracykeln med start från acetyl-CoA. Ge namn på ingående intermediärer och enzymer. Strukturformler på koenzymer behövs ej. 5p 10. Hur bildas följande aminosyror från metaboliter som sammanbinder katabolismen med anabolismen? Svara med strukturformler. a) Glutamat b) Asparagin c) Alanin d) Serin. 4p 11. Beskriv uppbyggnaden av fettsyrasyntas och de reaktioner som det katalyserar. 12. Hur styrs regleringen av glykolysen och glukoneogenesen i en muskelcell som övergår från vila till hårt arbete? Hur skiljer sig denna reglering från den i levern? Varför skiljer sig regleringarna åt? 5p 13. Hur bildar ett rapsfrö ribulos-5-fosfat för att starta mörkerreaktionen i fotosyntesen när det gror? Fröet är beroende av sitt innehåll av triglycerider som startmaterial för kolskelett och energi. Beskriv översiktligt med angivande av nyckelintermediärer och kofaktorregenerering. 3p 5p vänd