Bioteknologi, KTH Martinelle Tentamen i Biokemi, 22 augusti 2005 Kurs: 3A1109, 3A1115 Tid: 9.00-13.00 Salar: Q 36 Använd ett papper per fråga Skriv namn och personnummer på alla blad Maxpoäng är 54 och för godkänt krävs 27 1. Rita ett energi-reaktionskoordinat-diagram för följande enzymatiska process där jämvikten är förskjuten åt produktbildning. Rita även in transition-state, TS. E+S ES EP E+P E: enzym, S: substrat, P: produkt Ange i figuren ∆G för substratbindning och för hela processen samt aktiveringsenergin. 4p 2. Du vill rena och karakterisera några proteiner. Beskriv följande tekniker: Jonbyteskromatografi SDS-PAGE Mass-spektrometri (t.ex. MALDI-TOF MS) 3p 3. Beskriv på molekylär nivå hur joner (t.ex. Ca2+ ) kan transporteras över ett membran i en cell mot en högre koncentration. 3p 4. Beskriv den molekylära mekanismen hos aktin/myosin vid muskelarbete. 4p 5. Beskriv likheter och olikheter mellan fotosyntesen (ljusreaktionen) i kloroplaster och oxidativa fosforyleringen i mitokondrier vad gäller substrat, produkter, elektrontransport och energitillförsel. 5p 6. Beskriv hur tRNA kopplas till aminosyror. Ange enzym, reaktion med formler och kofaktor, var och med vilken typ av bindning aminosyran kopplas till tRNA. Beskriv hur enzymet kan välja tRNA och aminosyra med hög specificitet. 4p 7. I bilagan finns fem strukturer. Namnge dessa strukturer samt ge med strukturformler exempel på en reaktion de deltager i (som substrat eller produkt). Visa även vilka atomer i dessa strukturer som deltager i reaktionen. Svaren ges på bilagan. 5p 8. Beskriv med formler hur glukos omsätts till laktat i en hårt arbetande muskelcell. Ange namn på ingående intermediärer och enzymer. Kofaktorernas formler behöves ej. 5p 9. Hur regleras flödet genom citronsyracykeln? Hur ersätts oxaloacetat om byggstenar överförs från citronsyracykeln till anabolismen? 4p 10. Pyruvat kan deltaga i ett antal olika reaktioner, som leder till helt olika produkter. Nämn minst fyra med reaktionsformler. Ange även cellens syfte med dessa reaktioner. 4p vänd Bioteknologi, KTH Martinelle 11. Beskriv biosyntesen av fettsyror samt uppbyggnaden av fettsyrasyntas. Börja med acetylSCoA. 5p 12. Hormonet glukagon styr metabolismen i leverceller så att dessa kan leverera glukos till blodbanan. Beskriv de molekylära händelserna i denna hormonreglering. 5p 13. En mus har lyckats finna ett förråd av solrosfrön och äter friskt av det. Vilka kolatomer i solrosfröets triglycerider hamnar i det alanin musen behöver för sin muskeluppbyggnad? Ge en förklaring av ditt förslag genom att följa kolatomerna översiktligt i de metaboliska sekvenser som används. 3p vänd Bioteknologi, KTH Martinelle Biokemi fråga 7 Namn: ................................................... NH2 O N N N N O O O P O P O O O HO O OH O N H Personnummer: ...................................... S N H O O O P Namn: O Reaktion: O O NH 2 Namn: N O O O- P Reaktion: HO OH NH2 O O N O P O O OHO N N N OH Namn: NH2 - O N O- O P O P O O O N O - HO N N OH Namn: O HN Reaktion: Reaktion: NH COOH S OH Namn: O HO ADP Reaktion: OH N O N NH N O vänd