Tentamen i Biokemi, 28 maj, 2007 Kurs

Bioteknologi, KTH
Martinelle
Tentamen i Biokemi, 28 maj, 2007
Kurs: 3A1109, 3A1115
Tid: 14.00-19.00
Salar: FB 51-55
Använd ett papper per fråga
Skriv namn och personnummer på alla blad
Maxpoäng är 60 och för godkänt krävs 30 p
Komplettering är möjlig vid resultat 28 p och 29 p. Kontakta Mats Martinelle
([email protected]).
1. a) Beräkna föhållandet i reaktionshastighet, vA/vB, som ett dehydrogenas visar mot substrat
A och B i en blandning av nedanstående substrat.
Substrat A: Km = 4 µM och kcat = 1 s-1
Substrat B: Km = 40 mM och kcat = 10 s-1
b) Beskriv vad en kompetitiv inhibitor är.
c) Beräkna reaktionshastigheten, vS, för ett proteas då [S] = 2 µM, Km = 4 µM och Vmax = 12
µmol/min mg.
d) Beräkna reaktionshastigheten för samma enzym när en kompetitiv inhibitor [I] är
närvarande ([I] = 8 µM. Ki = 8 µM).
4p
2. Du har isolerat ett litet protein A (29 aminosyror) med intressanta antibakteriella
egenskaper. Proteinet har följande aminosyrasammansättning: Gly 4, Ala 3, Glu 5, Asp 3,
Val 4, Lys 2, His 1, Phe 4, Trp 1 och Ser 2. Beskriv de metoder du använde för att separera
proteinet från den orenade blandningen innehållande ett protein B (pI 8) med liknande
molekylvikt som A samt från protein C (300 aminosyror) med samma pI som A.
4p
3. Beskriv hur en acetylcholinberoende nervimpuls initieras, fortskrider samt återgår till
viloläge.
4p
4. Hur fungerar lukten? Beskriv i detalj hur substanser kan generera en nervimpuls.
4p
5. Hur många fotoner krävs för att generera 1 NADPH från NADP+ i fotosyntesen? Motivera
svaret med att beskriva processen från den primära elektron donatorn.
5p
6. Hur många ATP och GTP åtgår vid syntesen av ett protein med 150 aminosyror. Utgå från
fria aminosyror, t-RNA, m-RNA, ribosom samt nödvändiga proteiner/enzymer. Motivera
svaret med att beskriva processerna i detalj.
6p
7. Beskriv med strukturformler den oxidativa del av den metaboliska sekvens röda blodkroppar
använder för att regenerera NADPH från NADP+ för att användas i reduktionen av reaktiva
syreföreningar. Hur regleras denna metaboliska sekvens?
5p
Bioteknologi, KTH
Martinelle
8. För att kunna växa på torrt spannmål håller vissa mögelarter ett högt intracellulärt osmotiskt
tryck genom att ackumulera mannitol. Nedan visas delar av denna metabolism. Föreslå
struktur och namn på intermediären samt vad A, B, C och D står för i schemat nedan.
Slutligen skall du namnge enzymerna.
CH2OH
CH2OH
O
HO
H
A
C
B
D
HO
H
HO
H
H
OH
H
OH
H
OH
H
OH
CH2OPO3
2-
Fruktos-6-fosfat
CH2OH
intermediär
Mannitol
5p
9. Beskriv med strukturformler de steg i metabolismen som reglerar flödet av metaboliter
mellan glukos och pyruvat i katabolismen respektive anabolismen (glöm ej kofaktorerna!).
Vilka signaler förutom hormonsignaler reglerar dessa steg? Är det någon skillnad mellan
leverceller och muskelceller?
6p
10. Hur samverkar katabolismen med anabolismen i en cell? Vad överförs mellan dessa
processer?
3p
11. Beskriv i detalj reaktionsmekanismen för glyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas.
4p
12. Beskriv hur triacylglyceroler i fettceller kan användas för energiproduktion i muskelceller.
Gör en översiktlig beskrivning av händelseförloppet och hur det initieras (regleras).
Strukturformler behöver ej anges annat än för första steget.
6p
13. Många läskedrycker innehåller citronsyra. Vilka kolatomer i citronsyra kan hamna i din
glykogenreserv efter du släckt din törst när du kommit i mål i Stockholm maraton? Förklara
översiktligt med metaboliska sekvenser.
4p