Bioteknologi, KTH
Martinelle
Tentamen i Biokemi, 20 augusti 2007
Kurs: 3A1109, 3A1115
Tid: 9.00-14.00
Salar: FB41, FB42, FB55
Använd ett papper per fråga
Skriv namn och personnummer på alla blad
Maxpoäng är 60 och för godkänt krävs 30
1. a) Beräkna reaktionshastigheten, v, för ett proteas då [S] = 2 μM, Km = 4 μM och Vmax =
12 μmol/min mg.
b) Rita ett energi-reaktionskoordinat-diagram för följande enzymatiska process där
jämvikten är förskjuten åt produktbildning. Rita även in transition-state, TS.
E+S
ES
EP
E+P
E: enzym, S: substrat, P: produkt
Ange i figuren aktiveringsenergin.
4p
2. Du har isolerat ett enzym med intressant enzymatisk aktivitet. Enzymet använder syre för att
oxidera alkoholer.
a) Beskriv en metod som kan användas för att separera proteinet från lågmolekylära
föreningar (substrat m.m.).
b) Beskriv en metod som kan bestämma proteinets molekylvikt.
4p
3. a) Rita en fosfolipid med strukturformler.
b) Beskriv översiktligt aktiv och passiv transport av molekyler över ett membran i en cell.
c) Beskriv på molekylär nivå hur joner kan transporteras över ett membran i en cell mot en
lägre koncentration.
5p
4. Hur många protoner krävs för att generera 1 ATP med ATP-syntas. Motivera svaret med att
beskriva den molekylära mekanismen hos enzymet.
5p
5. Hur många elektroner krävs för att generera 1 H20 från syre i mitokondrier? Motivera svaret
med att beskriva processen för elektrontransport från den primära elektrondonatorn. Rita
figur.
5p
6. Ange ett enzym som har ”proof-reading” mekanism samt processen enzymet deltar i.
Beskriv ”proof-reading” mekanismen. Ange reaktionsformel samt rita med strukturformler
bindningen som skapas.
4p
7.
Beskriv med strukturformler den mitokondriella process som oxiderar acetyl-CoA till
koldioxid. Namnge ingående intermediärer och enzymer. Strukturformler på kofaktorerna
krävs ej.
5p
Bioteknologi, KTH
Martinelle
8.
Visa med strukturformler de reaktioner som katalyseras av följande enzymer. Var noga med
kofaktorerna (inga strukturformler krävs för dessa). Vilka metaboliska sekvenser ingår de i?
a) Glyceraldehydfosfatdehydrogenas b) Glutamatdehydrogenas
c) Alaninracemas
d) Chymotrypsin
4p
9.
Rita i figur hur aktiviteten beror av substratkoncentrationen för ett enzym som visar substratkooperativivet samt beskriv orsaken till detta. Ge ett specifikt enzym-substrat exempel 5 p
10. Glukos-6-fosfat kan delta i ett antal olika reaktioner, som leder till olika produkter. Beskriv
minst fyra reaktioner med formler och förklara vilken metabolisk sekvens de tillhör och
vilket mål cellen har med denna sekvens.
4p
11. Beskriv i detalj det enzym som omvandlar pyruvat till acetyl-CoA.
5p
12. Beskriv i detalj de molekylära händelserna som ökar eller minskar enzymaktiviteter i en
muskelcell efter att adrenalin har utsöndrats i blodbanan.
6p
13. Under hösten äter våra svenska björnar stora mängder bär för att bygga upp sitt fettförråd
inför vinterns dvala. Naturligtvis är sockret i bären den viktigaste kolkällan för syntes av
fettsyror. Bär innehåller dock även äppelsyra (vars salter heter malater). Vilka kolatomer i
äppelsyra kan de omsätta till triglycerider? Numrera kolatomerna i äppelsyra och visa med
översiktliga metaboliska sekvenser hur och var atomerna kan hamna i triglycerider.
4p
