Tentamen i Biokemi, 28 maj 2010 Kurs: BB1080, BB2380 Tid

Bioteknologi, KTH
Martinelle
Tentamen i Biokemi, 28 maj 2010
Kurs: BB1080, BB2380
Tid: 08.00-13.00
Salar: FB52-54
Skriv namn och personnummer på alla blad
Använd separat papper för varje fråga
Maxpoäng
60 p
Godkänt (E)
30 p
Komplettering (Fx) 28 p
Lägsta poäng på tentamen för att erhålla Fx eller E mha KS-poäng är 25 p
Komplettering av betyg Fx sker muntligt efter överenskommelse mellan student och
kursansvarig.
1. Rita i figur hur aktiviteten beror av substratkoncentrationen för ett enzym som visar substratkooperativitet samt beskriv mekanismen till detta. Ge ett specifikt exempel.
3p
2. Du har isolerat ett litet protein X (31 aminosyror) med intressanta egenskaper. Proteinet har
följande aminosyrasammansättning: Gly 4, Ala 3, Arg 2, Leu 3, Val 4, His 1, Phe 4, Trp 1,
Ser 3, Gln 1, Glu 2 och Asp 3. Beskriv de metoder och betingelser du valde att använda för
att separera proteinet från blandningen innehållande ett protein Y (pI 9) med liknande
molekylvikt som X samt från protein Z (300 aminosyror) med samma pI som X. Illustrera
med figur.
4p
3. a) Rita fosfolipiden fosfatidylserin med strukturformel.
b) Beskriv översiktligt aktiv och passiv transport av molekyler över ett membran i en cell.
5p
c) Beskriv mekanismen för Ca2+-ATPas.
4. Hur många NADPH kan erhållas vid oxidation av två vattenmolekyler i fotosyntesens
ljusreaktion? Motivera svaret med att beskriva elektrontransportkedjan i fotosyntesen med
substrat, produkter och ingående elektrontransportkomponenter (Rita figur). Ange tydligt
processens elektrondonator och elektronacceptor. (Namnge de ingående komponenterna).
6p
5. Beskriv syntesen av aminoacyl-tRNA med strukturformler (inkludera den aktiverade
intermediären). Ange enzym samt beskriv även hur enzymet kan välja aminosyra med hög
specificitet.
5p
6. Hur regleras flödet mellan fruktos-6-fosfat och fruktos-1,6-fosfat? Förklara vad de olika
reglerande metaboliterna representerar i cellens metabolism.
5p
7. Beskriv de molekylära händelserna som adrenalin orsakar för att reglera flödet från fett
(triacylglycerol) till fettsyror och glycerol.
5p
Bioteknologi, KTH
Martinelle
8. Kofaktorparen NADPH/NADP+ och NADH/NAD+ är strukturellt mycket lika, men i cellen
har de olika metaboliska funktioner. Hur reduceras och oxideras dessa kofaktorer och vilka
funktioner har de?
5p
9. Beskriv med strukturformler den mitokondriella process som oxiderar acetyl-CoA till
koldioxid. Namnge ingående intermediärer och enzymer. Strukturformler på kofaktorerna
krävs ej.
6p
10. Hur samverkar katabolismen med anabolismen i en cell? Vad överförs mellan dessa
processer?
3p
11. Pyruvat har en strategisk position i metabolismen och kan delta (bildas eller utnyttjas) i ett
flertal olika reaktioner. Ge med strukturformler exempel på fyra sådana reaktioner (första
steget). Föklara vilka metaboliska sekvenser de deltar i samt vad cellen har för mål med
dessa sekvenser.
4p
12. Beskriv i detalj reaktionsmekanismen för glyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas.
5p
13. I köket finner du att din burk med glutamat som du använt i matlagning har fått en
bakterieinfektion. Som nyfiken biokemist funderar du på hur bakterien gör serin för att
kunna överleva på enbart glutamat? Visa ditt förslag med översiktliga metaboliska sekvenser
och nyckelintermediärer som gör det möjligt att följa kolatomerna och kvävet.
4p