Övningstentafrågor i Biokemi, Basåret
VT 2012
1. Förklara kortfattat följande ord/begrepp. (4p)
- gen
- genom
- proteom
- mutation
- kofaktor
- prostetisk grupp
- ATP
- replikation
Celler:
2. Rita en eukaryot cell och namnge de komponenter du ritar
ut. (4p)
3. Nämn tre skillnader mellan en eukaryot och en prokaryot
cell. (3p)
4. Vad är det som skiljer en växtcell från en djurcell ? (2p)
5. Namnge tre olika delar av en eukaryot cell och beskriv
kortfattat en funktion i respektive del. (6p)
6. Neutrallipider och fosfolipider har olika funktioner i levande
celler. Vilka funktioner har de? Vilka egenskaper hos de två
olika lipiderna gör dem lämpliga för sina respektive funktioner?
Förklara. (6p)
7. Virus definieras vanligen inte som liv. Förklara? (2p)
Proteiner och membraner:
8. Aminosyrorna kan delas in i fyra grupper baserade på sina
kemiska egenskaper. Vilka är dessa ? (4p)
1
9. Aminosyror har olika egenskaper. Var i ett globulärt protein
är det störst chans att du hittar en hydrofob respektive en
hydrofil aminosyra? (2p)
10. Namnge en aminosyra som saknar stereogent centrum och en
som har ett stereogent centrum? (2p)
11. Hur många N-terminala aminosyror finns det i ett protein
med 4 subenheter? (1p)
12. Var i ett globulärt protein förväntar du dig att finna
aminosyrorna Arg, Leu, Asp, Val, Ser respektive Thr? (3p)
13. Rita strukturformeln för en tripeptid, som har en polär
oladdad aminosyra som N-terminal, en basisk i mitten och en
opolär, som C-terminal vid pH 7.0. (5p)
14. På bilden ovan ser ni en peptid med aminosyrorna serin, lysin
och glycin. Definiera vad som menas med ryggrad, C-terminal, Nterminal och sidokedja i samband med proteiners struktur. (4p)
15. Proteiner kan denatureras. Nämn två faktorer, som
denaturerar proteiner? Beskriv kortfattat vad som händer med
proteinet under denatureringsprocessen. (4p)
16. Biologiska membraner består av lipider och proteiner. Vilken
är den vanligaste lipiden i ett membran? Nämn två faktorer, som
2
påverkar membranrörligheten? Beskriv hur de påverkar
rörligheten. (8p)
17. Rita en skiss av ett biologiskt membran och förklara vad som
menas med ett perifert respektive integralt membranprotein.
(5p)
18. En fosfolipid är en amfipatisk molekyl. Beskriv hur en
fosfolipiden ser ut och förklara varför den är amfipatisk. Rita
gärna. (3p)
19. En annan vanlig lipid i membranet är utgångssubstans för
syntes av steroidhormoner. Vilken? (1p)
20. Vad menas med “fluid mosaic” model. (2p)
21. Proteiner kan anta en väldigt ordnad 3-dimensionell
struktur.
Vilka typer av sekundärstruktur har detta protein? Beskriv
dessa kortfattat. (4p)
22. Ett protein har fyra strukturella nivåer, sekundär struktur
är en av dem. Namnge de tre andra strukturerna, som ett
protein kan anta och beskriv alla fyra strukturerna kortfattat.
(5p)
23. Har alla proteiner kvartär-struktur? Vilka bindningar och
krafter stabiliserar proteinstrukturen? Vad är den specifika
funktionen för cysteiner? (6p)
24. Var i ett globulärt protein är det störst chans att du hittar
en hydrofob respektive en hydrofil aminosyra? (4p)
3
Enzymer:
25. Vad är ett enzym ? (3p)
26. Vad är ett aktivt centrum hos ett enzym. Måste aminosyror
i det aktiva centret vara nära varandra i primärsekvensen? (3p)
27. Vissa proteiner är enzymer och har katalytisk förmåga.
Nämn tre egenskaper, som karakteriserar ett enzym. Vilken
annan typ av molekyl har också katalytisk förmåga? (4p)
28. Enzymaktiviteten kan påverkas? Nämn 3 faktorer. (3p)
29. Kofaktorer behövs för att många proteiner ska fungera
effektivt. Ge exempel på två olika grupper av kofaktorer? (2p)
30. Varför tror du att absoluta merparten av enzymer är
proteiner? (2p)
Genetisk information: DNA/RNA
31. I genomet finns den genetiska informationen lagrad. DNA och
RNA är makromolekyler, som består av nukleinsyror. Ange tre
strukturella skillnader mellan DNA och RNA. Det finns tre
sorters RNA i en cell. Vilka? (6p)
32. Förklara begreppet komplementaritet i samband med
nukleinsyror. (2p)
33. Beskriv kortfattat genetikens centrala dogm (lärosats). (2p)
34. Vilken funktion har tRNA i proteinsyntesen? (2p)
Metabolism, kolhydrater och lipider:
35. Beskriv kortfattat skillnaden mellan anabolism och
katabolism. (4p)
4
36. ATP kan bildas på tre principiellt olika sätt, substratnivå
fosforylering, fotofosforylering och oxidativ fosforylering. Vad
skiljer de tre olika processerna. Förklara och berätta var de
kan ske. (6p)
37. Varför är fett mer energirikt än kolhydrater ? (2p)
38. Beskriv kortfattat hur kan ATP utföra arbete? (2p)
39. Är syre ett oxidationsmedel eller ett reduktionsmedel? (1p)
Glykolysen:
40. Var i cellen sker glykolysen? (1p)
41. Under vilka betingelser sker bildningen av laktat i
glykolysen? Vad är netto utbytet av ATP under dessa
betingelser? (4p)
42. Vilken molekyl bryts ned i glykolysen och vilken produkt
erhålls i slutet? Hur många ATP erhålls? (3p)
43. Visa de reaktioner i glykolysen där ATP bildas respektive
förbrukas. (4p)
44. Viket enzym är ett viktigt nyckelsteg i glykolysen? Hur
påverkas enzymet av ATP, AMP och citrat? (4p)
45. Nämn två elektronbärare? (2p)
46. Vilka två molekyler är kopplingen mellan glykolysen och
citronsyracykeln? (2p)
Citronsyracykeln, β-oxidationen och andningskedjan:
47. Var finns de enzymer som behövs för citronsyracykeln och
β-oxidationen? Vilken molekyl bryts ned under β-oxidationen?
(3p)
5
48. Mitokondrierna kallas för “kraftstationen”. I mitokondrien
utvinns djurcellens huvudsakliga energi (ATP). Rita och beskriv
de olika delarna i en mitokondrie. Visa var i mitokondrien
citronsyracykeln och β-oxidation sker. (6p)
49. Citronsyracykeln är beroende av syre för att kunna
fungera, även fastän inget syre ingår i dess reaktionssteg.
Förklara varför? (2p)
50. Andningskedjan sker i mitokondrierna. Rita schematiskt de
fem komponenterna i andningskedjan. Ange var andningskedjan
sker. Rita in hur protonerna pumpar och elektronernas
transport. Förklara kortfattat med hjälp av bilden hur ATP
bildas. (6p)
51. Vad är det som energimässigt driver ATP syntesen i oxidativ
fosforylering. (2p)
52. Hur många acetyl-CoA kan man få från en fettsyra med
18C? (2p)
Fotosyntesen:
53. Fotosyntesen i gröna växter sker i de organeller, som kallas
kloroplaster. Fotosyntesen delas upp i två faser. Varför är
koldioxid-fixeringen beroende av ljusfasen i fotosyntesen? Vad
gör en klorofyll-molekyl? (5p)
54. Rita en kloroplast, ange de olika delarna och beskriv var
koldioxid-fixeringen (mörkerfasen) respektive ljusfasen sker.
(7p)
Lycka till!
6
