DNA 2011
Börjar vi närma oss “nollvisionen” ??
Equalis användarmöte
Malmö 2011
Deltagare
Antal deltagare
60
50
40
30
20
10
0
2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011
Antal deltagare DNA
30
25
20
15
10
5
0
2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011
Sverige
Övriga Norden
Övriga
DNA
Farmakogenetik
DNA sekvensering
Inrapporterade avvikelser/metodgrupp
18
Allele specific PCR
16
14
Hydrolysis probe
assay
Melting point
analysis
Minisequencing
12
10
8
6
Pyrosequencing
4
RFLP
2
0
2009
2010
2011
Sequencing
• De mest använda metoderna/teknikerna är Hydrolysis probe
assay och Melting point analysis
Antal avvikelser DNA
Antal resultat
60
50
2005: 811
2006: 1150
2007: 1292
2008: 1596
2009: 1548
2010: 1530
2011: 1477
40
30
20
10
0
2005
2006
Antal deltagare
2007
2008
2009
Antal avvikande resultat
2010
2011
% avvikande resultat
4
Orsak till avvikande
svar
35
30
25
20
15
10
5
0
5
Avikelser
2010-40
Allele
specific PCR
18
16
14
12
10
8
6
4
2
0
Hydrolysis
probe assay
Melting
point
analysis
2009
2010
Minisequen
2011 cing
• Kontamination
• Nya prover – inget avvikande
resultat
• 8 har inte rapporterat någon
förklaring
Avikelser
2011 -10
Allele
specific PCR
18
16
14
12
10
8
6
4
2
0
Hydrolysis
probe assay
Melting
point
analysis
2009
2010
Minisequen
2011 cing
•
•
•
•
Kontaminnation
Provförväxlingen
Överföringsfel till Online
Pipetteringsfel.
Avikelser
2011 -40
18
Allele specific
PCR
16
14
Hydrolysis
probe assay
12
2 avvikande resultat
Melting point
analysis
10
8
Minisequenci
ng
6
Pyrosequenci
ng
4
2
RFLP
0
2009
2010
2011
2 resultat kommenterats som
svårtolkade
Histogram
Histogram
DNA
Kommentar till de avvikande resultaten för omgång 2010-40:
Ett av laboratorierna rapporterade att de hade kontamination i
omgången. Ett laboratorium fick nya prover och kunde då rapportera
förväntat svar. För övriga avvikande resultat (åtta deltagare), har ingen
förklaring lämnats.
Kommentar till de avvikande resultaten för omgång 2011-10:
Ett av laboratorierna rapporterade att de hade kontamination i
omgången. Två av laboratorierna hade gjort en provförväxling.
Överföringsfel från svarsblankett till Online orsakade ett avvikande
resultat och ett berodde på pipetteringsfel vid analystillfället.
I omgång 2011-40 fanns två avvikande resultat + två resultat som
angetts som svårtolkade
11
