The Synbiotic LifestyleTM ab-sv-0005 [1] Det stora och det lilla genomet Ester Nylöf, September 13, 2014 Vi har relativt nyligen - på 2000-talet - blivit medvetna om de miljarder encelliga organismer som lever i och på människokroppen. Tidigare har våra vetenskapliga hjälpmedel bara låtit oss se vad som kunnat odlas framgångsrikt i ett laboratorium – vilket är fullt jämförbart med att uteslutande kunna leta efter en borttappad nyckel under en gatlykta. Allt har legat i mörker. Det är inte längre självklart vad som är ”vi” och vad som är ”dem”. Teknisk utveckling har ändrat på det och ställt oss inför en ny, oupptäckt kontinent. Plötsligt kan gener sekvenseras i blindo – och den information som hämtas fram ur den osynliga världen är fascinerande och häpnadsväckande. Interaktionen kan påverka uttrycket av våra gener och antingen aktivera eller dämpa immunförsvaret. Vi påverkar hela deras livsmiljö, vilket avgör vilka arter som dominerar och vilka gener de uttrycker. I vår kropp betyder det följande: Förhållandet mellan våra egna celler och det mikrobiologiska ekosystemets celler är 10 till 1. Deras gener är hundratals gånger fler än våra egna. Deras genom, summan av deras sammanlagda gener, är ”det stora”. Vårt är det lilla. Deras genetiska repertoar är oändligt mycket större än vår egen – och till vår tjänst, i utbyte mot att det främmande ekosystemet får tillgång till en skyddad miljö med jämn temperatur, fuktighet och tillgång på näring. Inom deras eget ekosystem är utbytet vildare: Mikroorganismernas gener blandas, skakas om och muterar snabbt. Genetiskt material kan hoppa runt på DNA-molekylen. Det kan bilda små ringar som bakterier skyfflar mellan sig, och mellan arter. En ständig kommunikation pågår mellan de artfrämmande cellerna och de fria, cirkulerande kroppsceller som igår i immunförsvaret - samt med de celler som ingår i fasta vävnader, till exempel i tarmväggen. Konkurrenskraftiga anlag, i värsta fall antibiotikaresistens, kan därför spridas snabbt. I själva verket är det urbilden för en lysande win-winsituation, och samexistensen är lika gammal som ryggradsdjurens erövring av land. Men vilka är de? Svaret är: främst bakterier, från tre stora övergripande familjer: Firmicutes, Bacteriodetes och Actinobacteria. De har olika egenskaper, olika lager som omsluter dem, vilket påverkar hur de interagerar med omgivningen. Dessutom: arkéer och encelliga organismer med cellkärna – båda, rent evolutionärt, mer släkt med oss än med de bakterier som omger dem. Sedan: virus, i stor mängd. Främst virus som infekterar bakterier, så kallade bakteriofager. Och hela tiden tillförs nya organismer utifrån, genom maten. De passerar, förhoppningsvis obemärkt, utan att infektera eller störa balansen. Mikrobiotans stamorganismer skyddar och försvarar kroppen, i samarbete med immunförsvaret, Den stora flexibiliteten, dynamiken och tänjbarheten i alla system - kroppens och de främmande organismernas - gör att gränserna på mikrobiologisk nivå verkar upplösas. Det stora och det lilla genomet | 1