Marie C Petersson
Leg BMA
Avd för klinisk Mikrobiologi, Karlskrona
MALDI-TOF MS
Matrix Assisted Laser DesorptionTime Of Flight Mass Spectrometry
Har under de senaste åren visats ge en snabb, säker
och effektiv artidentifiering av bakterier och svamp.
Två system på marknaden
BioMèrieux
Bruker Daltonics
Process
Laser
Stålplatta
Matrix
Sluss för
införing av
prov
Jonisering och
fragmentering
av provets
molekyler
Flygkammare
för sortering
av joner
TOF
Detektor
Datasystem
Generering av
masspektrum
MALDI
VAKUUM
Artbestämning
Matchning mot
bibliotek
Identifiering via mönster-matchning
Distribution av topparna i masspektrat jämförs med masspektra i
biblioteket, för närvarande >3700 arter.
Result Report | Detected Species
| Ranking |act Sc |max Sc |Rel Score |PN k |PN b |PN m |Rel P-Num.|I-Corr.|1000*Pro
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Spectrum #12 | Ps. mendocina DSM50017 |
1 | 3813 | 4271 |
0.89 | 41 | 10 | 83 |
0.55 | 0.88 |
438
| Ps. oleovorans B396
|
2 | 1671 | 3450 |
0.48 | 14 |
8 | 83 |
0.22 | 0.39 |
41
| Ps. fluoreszens B340
|
3 |
868 | 4186 |
0.21 |
6 |
7 | 83 |
0.11 | 0.19 |
4
| Ps. veronii DSM11331
|
4 |
847 | 4250 |
0.20 |
5 |
7 | 83 |
0.10 | 0.14 |
3
| Ps. putida DSM291
|
5 |
374 | 2821 |
0.13 |
3 |
3 | 83 |
0.05 | 0.12 |
1
| Ps. putida B401
|
6 |
329 | 2638 |
0.12 |
3 |
2 | 83 |
0.05 | 0.11 |
1
MALDI BioTyper 2.0 – Resultat-tabell
Färgkodad identifiering
Studier utförda i Karlskrona och Växjö
Jämförande studie mellan ordinarie typning och MALDI
Substratberoende
Utarbetat ett förenklat extraktionsprotokoll
Jämförande av olika extraktionsprotokoll
(Oslo, Barcelona, Lund, Karlskrona)
Extraktion på jästsvamp
Studier utförda i Karlskrona och Växjö
Moraxella catharralis
Acinetobacter
Pasteurella multocida
Växjö och SMI (mycket gott resultat)
Växjö och Tromsö (bättre resultat än Phoenix och
Vitek)
Växjö och Holland
Koagulasnegativa Stafylokocker
Växjö, USA och Danmark
Haemophilus influenzae
Växjö, USA och Norge
Tillförlitlighet
Resultaten på de species vi fått fram hittills,
överensstämmer väl med förväntad artID.
De species som inte går bra att artbestämma är
Flera Streptokocker
Shigella
Vilka verifierings tester kan vi INTE ersätta?
Optochin
för pneumokocker
Streptex på betahemolytiska streptokocker
Test för preliminärsvar
Agglutinationstest på stafylokocker
Oxidas på Pseudomonas
Vilka verifieringstester KAN vi ersätta?
Jäsning
på gramnegativa stavar
Koagulas och DNAs på Stafylokocker
Eskulin och arabinos på Enterokocker
API:er (på exempelvis gramnegativer, corynebacterier,
stafylokocker och anaeroba bakterier)
Phoenix och sannolikt även Vitek
EQUALIS och MALDI-TOF
Nya möjligheter
Specifika utskick?
Specifika paneler?
Nätverk?
Tack för uppmärksamheten!
