CRISPR revolutionerande genteknik Magnus Lundgren Uppsala Universitet [email protected] Magnus Lundgren • Född 1975 i Malmö • Uppväxt i Malmö, Ockelbo, Gävle • Bor med sambo & barn i Uppsala • Studerat och jobbat med biologi sedan 1996 Vad är jag egentligen? • 20-25 tusen gener • 1000 miljarder mänskliga celler (och 10 ggr. så många bakterier) • 40 års livserfarenhet Vad säger mina gener om mig? • Fräknig, blå ögon, rött hår • Tål alkohol (nåja) • Laktostolerant • Nyser i starkt ljus • Låg känslighet för svettlukt • Hög känslighet för blodproppsmedicin (Waran) • Inga kända anlag för monogena sjukdomar • 2.7% Neandertalare Vi står som första art på jorden inför möjligheten att skriva om våra (och andra arters) gener, med hjälp av CRISPR-tekniken Ändra DNA i celler - varför? • Verktyg i biologisk och medicinsk forskning • Modifiera organismer för industri och jordbruk • Behandling av sjukdomar Hur fungerar CRISPR-tekniken? • Cas9-proteinet har programmerbar DNA-klyvning • DNA-reparation leder till genetisk förändring Specifik DNA-skada DNA repareras, men med liten slumpmässig ändring Cas9 hittar måltavlan Icke-homolog sammanfogning Bild från ”Framtidens Mat” (Mistra Biotech) Hur fungerar CRISPR-tekniken? • Cas9-proteinet har programmerbar DNA-klyvning • DNA-reparation leder till genetisk förändring Specifik DNA-skada Cas9 hittar måltavlan mallDNA Introducerat mall-DNA Homologi-baserad reparation Bild från ”Framtidens Mat” (Mistra Biotech) DNA-skadan lagas med mallen, specifik förändring Hur görs en ny viktig upptäckt? • Bakterier utsätts för virus Virus-DNA • CRISPR-Cas ett immunsystem som sparar bitar av virus-DNA • Kopia av sparade bitar styr Cas9 Cas9 CRISPR-RNA 1 cas-gener 2 3 4 5 6 CRISPR 7 8 9 Utveckling av Cas9 • Upptäckt 2007 • Grundläggande mekanism upptäckt 2010 Philippe Horvath Rodolphe Barrangou Sylvain Moineau • Förenkling av systemet 2012 • Genförändring av mänskliga celler 2013 Jennifer Doudna Barrangou et al. (2007) Garneau et al. (2010) Jinek et al. (2012) Mali et al. (2013) Cong et al. (2013) George Church Emanuelle Charpentier Feng Zhang Genförändring med CRISPR • Effektivare, snabbare, enklare och billigare än tidigare tekniker • Alla typer av genförändringar kan göras • Kan även användas för att reglera gener • Förbättring av tekniken pågår Exempel på arter där Cas9 har använts Människor Andra primater Fisk Poppel Fjärilar Backtrav Grisar Möss och råttor Flugor Maskar Vete Majs Boskap Salamandrar Ris Getter Grodor Jäst Cas9 i industri, jordbruk och naturvård • Skapa genmodifierade organismer, nuvarande GMO-regler inte tillämpbara • Möjliggör förändring/bekämpning av sjukdomsbärande insekter och invasiva arter Aedes aegypti-mygga Rhinella marina (agapadda) Arion vulgaris-snigel Gendrivare • Gör att utvald gen ärvs mer än andra gener, kan användas exempelvis för att förhindra att en insekt bär smitta Vanlig ärftlighet Gendrivare • Gör att utvald gen ärvs mer än andra gener, kan användas exempelvis för att förhindra att en insekt bär smitta Ärftlighet med standard-gendrivare Burt (2003) Esvelt et al. (2014) Gantz och Bier (2015) Gendrivare • Kan slå ut arter som t.ex. sprider sjukdom eller skadar ekosystem Ärftlighet med suppressions-gendrivare Burt (2003) Esvelt et al. (2014) Medicinsk potential för Cas9 • Analysera gener för deras påverkan på sjukdomar och behandling • Kombination med stamcellsteknik • Bota bakterieinfektion • Avlägsna antibiotikaresistens hos bakterier • Behandling av virusinfektion • ”Vaccinering” mot virus (t.ex. HIV) • Behandling av ärftliga sjukdomar Rath et al. (2015) Genterapi Många sjukdomar orsakas/påverkas av gener • 8000 kända monogena sjukdomar (tex. cystisk fibros, sicklecellanemi, PKU) • Komplexa sjukdomar – flera samverkande faktorer (genetik/miljö) Typer av genterapi Somatisk • Behandling av barn/vuxna • Många celler måste förändras • Lokal förändring i kroppen • Förändring ärvs inte Könsceller • Endast en cell behöver förändras • Alla celler i kroppen påverkas • Förändringen ärvs • Alternativ används Riktlinjer för forskning Varför inte genmodifiera människor? • Fel ändring kan ge nya sjukdomar • Oförutsedda sidoeffekter av rätt ändring • Kan förändra synen på människan och våra egenskaper • Inget medgivande från kommande generationer Bota/förhindra sjukdomar Bättre syn, knän, minne, osv. “Det sluttande planet” Längd, ögonfärg, hårfärg Sammanfattning CRISPR • Revolutionerande verktyg för genförändring • Upptäcktes genom grundforskning på bakteriers virusförsvar • Har potential som kräver etiska överväganden