Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Förhindrat cellsjälvmord bidragande orsak till svårartad cancer Markus Heidenblad En av de mest elakartade cancerformerna, pankreasadenocarcinom, utgår från körtelstrukturer i den del av pankreas (bukspottkörteln) som producerar matsmältningsenzymer. Sjukdomen har ett mycket aggressivt och snabbt förlopp med tidig spridning. Detta tillsammans med det faktum att sjukdomen på tidigt behandlingsbart stadium saknar specifika symptom förklarar delvis den dystra prognosen – i Sverige överlever färre än 10% första året efter diagnos. Pankreasadenocarcinom kännetecknas av ett flertal genetiska förändringar hos tumörcellerna av vilka ett exempel är inaktivering av tumörsuppressor-genen TP53 (en gen vars normala funktion är att hämma eller kontrollera celldelning). Denna är för övrigt den gen som hittills visat sig vara oftast inaktiverad i mänskliga cancerformer. TP53:s proteinprodukt har en kritisk funktion när det gäller att kontrollera att DNA:t i varje cell bibehålls intakt för att skydda våra celler från potentiellt cancerframkallande förändringar. Proteinet TP53 agerar som en sorts vakt i cellen som stabiliseras och aktiveras när skada upptäcks i DNA:t, vilket i sin tur leder till aktiveringen av ett flertal andra gener. Konsekvensen av detta är att cellen med skadan antingen stoppas före sin delning, varpå felet rättas till, eller om DNA-skadan är alltför omfattande, genom ett inbyggt självmordsprogram dödas. Målet är detsamma – ingen cell med skadat DNA ska få chansen att dela sig och därmed kunna sprida skadan. För att undersöka hur vanliga felaktigheter i dessa mekanismer är i pankreasadenocarcinom undersöktes 13 tumörprover från 12 patienter behandlade för denna sjukdom. Två av proverna är från samma patient, den ena från ursprungstumören och den andra från en metastas, d.v.s. en annan position till vilken ursprungstumören spridit sig och gett upphov till en ny tumör. Uttrycket av totalt 17 olika gener, samtliga representerande funktioner i de ovan nämnda mekanismerna, analyserades. Undersökningen kompletterades med en mutationsanalys av tumörsuppressor-genen TP53, vilket innebär att man går in och direkt läser den genetiska koden för denna gen, vars korrekthet är av yttersta vikt för bildandet av ett funktionellt protein. Undersökningen visade att en av alla de analyserade generna, BCL-2 A1, var kraftigt överuttryckt i fem av tumörproverna. Denna gen är involverad i cellsjälvmordsprocessen på ett sådant sätt att ju mer det finns av proteinet desto svårare är det för cellen att döda sig själv. Detta innebär att i de fem påverkade tumörerna har eventuellt celler, som kanske borde ha dött p.g.a. kraftiga DNA-skador, möjligen haft en extra chans att överleva och sprida sina skador. Vidare upptäcktes att själva tumörsuppressor-genen TP53, nyckelspelaren i sammanhanget vilken till stor del styr de olika DNA-skaderesponserna, faktiskt hade inaktiverande mutationer i 8 tumörprover av 12 från olika patienter (samma mutation upptäcktes i både ursprungstumör- och metastasprov från den patient där två prover tagits). Detta innebär att selektionen mot celler med skadat DNA, på två olika sätt, ofta verkar vara utslagen i pankreasadenocarcinom, vilket med stor sannolikhet är en bidragande orsak till tumörernas uppkomst och utveckling. Swedish official title: Mutations- och expressionsanalys av apoptosgener i pankreascancer Swedish credits: 20p E-mail address of first author: [email protected] Supervisor: Mattias Höglund, Department of Clinical Genetics Submission date/time: 2002-09-20 Examensarbete i biologi, naturvetenskapliga fakulteten, Lunds universitet Mutation and Expression Analysis of Apoptosis Genes in Pancreatic Cancer Markus Heidenblad Biology, Molecular genetics Spring 1999 Abstract in English Pancreatic ductal adenocarcinoma is the fifth leading cause of cancer related death in the western world partly due to a mortality rate which closely follows the incidence. It is well known that inactivation of the tumor suppressor gene TP53 is a central event leading to malignant transformation in human cancers and it is indeed mutated in 50-75% of pancreatic carcinomas. Among the various biological effects promoted by the transcription factor TP53, the two regarded to be of primary importance in the prevention of carcinogenesis are induction of cell cycle arrest with subsequent repair and apoptosis triggering upon DNA damage. To determine the extent of malfunctions in these events in pancreatic cancer, the expression level of 17 genes involved in apoptosis/cell cycle arrest, were measured in a panel of 13 low-passage tumor cell lines. The expression analysis using semiquantitative PCR was complemented by a mutation analysis of the TP53 gene performed by direct PCR sequencing. Included in the expression analysis were genes representing several different functions in these mechanisms; ATM and PRKDC with TP53 phosphorylating/stabilizing functions, and MDM-2 and ING1 which are involved in the direct physical regulation of TP53. Furthermore three TP53 transactivated genes involved in the execution of cell cycle arrest and DNA repair; CDKN1A, GADD45 and 14.3.3-sigma were investigated as well as 12 key regulators of apoptosis all belonging to the BCL-2 family of proteins. Seven of these were proapoptotic (BAX, BAK, BOK, BIK, BAD, BID and BCL-XS) and five antiapoptotic (BCL-2, BCL-XL, BCLw, BCL-2 A1 and MCL1). Only one gene, BCL-2 A1, showed obvious deviating expression levels when compared to the intertumoral average, being overexpressed in five tumor cell lines, possibly implicating a higher threshold to enter apoptosis in these cell lines. The TP53 mutation analysis confirmed previous findings, showing mutations, predominately transitions, in 8 of 12 (75%) samples originating from different patients, assumably leading dysfunctional apoptosis and cell cycle arrest/DNA damage repair mechanisms in these cell lines.