Carl-Johan Andersson Om jag gör hål på en cell och ingen ser det…går det ändå hål? Ett verktyg som ofta används när funktioner och mekanismer hos celler ska undersökas är membranpermeabilisering. Det innebär att konstgjorda hål eller kanaler görs i cellens plasmamembran eller andra membranstrukturer inuti cellen. Syftet kan vara att en substans ska kunna läcka in i cellen för att påverka den utan att orsaka dödliga skador på den. Det kan också vara att forskare att något ska läcka ut från cellen för därigenom kunna undersöka något i cellens inre. Metoderna för att permeabilisera celler kan vara mer eller mindre spektakulära. Från användandet av en ”kanon” som skjuter hål på membran med små partiklar till kemiska substanser som påverkar membranet på ett sådant sätt att hål bildas. En sådan kemisk substans är alameticin som har sitt ursprung i en parasitisk svamp och som i svampen fungerar som ett skydd mot bakterieangrepp. Alameticinets förmåga att göra hål i cellmembran har människan tagit tillvara på och det är nu en substans som används regelbundet i laboratorier för detta syfte. Hittills har permeabiliseringen med alameticin påvisats genom att mäta substanser som läckt ut från behandlade celler eller indirekta effekter av förlusten av dessa substanser. Målet med den här undersökningen var att för första gången göra direkta observationer på permeabiliserade celler av backtrav (Arabidopsis thaliana). Tanken var att låta fluorescensmarkör som normalt inte kan passera cellmembran, passera genom de hål som alameticin skapar. Ett fluorescerande ämne kan påvisas inuti cellen genom att belysa cellerna med en viss specifik våglängd. Markören fluorescerar då med en annan specifik våglängd som kan observeras och särskiljas. På så vis kan markören med stor säkerhet urskiljas och var den finns i cellen syns tydligt i ett bra mikroskop. När jag gjorde detta och jämförde celler som inte behandlats med alameticin var det tydligt att endast permeabiliserade celler färgats in av markören. Jag kunde till och med visa att mitokondrierna var permeabiliserade eftersom dessa lyste upp som små korn inuti cellen. Att det faktiskt var mitokondrier kunde jag visa genom att använda en annan fluorescensmarkör. Denna markör kan passera cellmembranet men färgar endast in mitokondrier. Detta gjorde att de två infärgningarna kunde jämföras med varandra och på så vis bevisa att det faktiskt var mitokondrier. I undersökningen så visade sig att alla celler i ett prov blev permeabiliserade. Det intressanta med det resultatet var att jag kunde visa att denna permeabilisering fortskred olika i olika celler. Det var nämligen så att det tog längre tid för fluorescensmarkören att läcka in i vissa celler än andra. Detta trots att det inte fanns någon synbar skillnad mellan dem. Resultatet kan betyda att det tar längre tid för alameticin att göra hål i vissa cellers plasmamembran än andras. Det kan också finnas en möjlighet att det blir mycket färre hål i de ”långsamma” cellerna, så att färgämnet inte kan tränga in lika snabbt. Vilket av dessa alternativ det faktiskt rör sig om fanns det tyvärr inte möjlighet för mig att undersöka. Tidigare har forskarna tittat på alla celler i ett prov som en helhet och inte tagit i beaktande att cellerna reagerar individuellt på alameticinbehandlingen. Observationer pekar också på att mitokondriernas struktur blir radikalt omgjord, men det finns även tecken på att andra membranstrukturer genomgår omfattande förändringar i cellens inre. Det är viktigt att vidare undersöka hur cellerna blir påverkade av permeabiliserinegn för att kunna ta hänsyn till detta när alameticin skall användas i forskningen Handledare: Allan Rasmusson, Mari Aidemark, Susanne Widell Examensarbete 10 p i Molekylärbiologi Vt 2007, Institutionen för cell- och organismbiologi, Lunds universitet Carl-Johan Andersson Fluorescence probes as markers for alamethicin permeabilisation in Arabidopsis thaliana ecotype Colombia-0 and Arbidopsis thaliana ecotype Landsbergis The membrane active peptide alamethicin (AlaM) has been shown to permeabilise cells and isolated mitochondria from both mammals and plants. The aim of this study was to use the fluorescent nucleic acid-markers propidium iodide and Yo-Pro-1 and the endocytic marker FM4-64 for investigating AlaM permeabilisation of cell-cultures from two ecotypes of A. thaliana. It was found that cells were homogenously permeabilised although there were temporal differences within a cell culture. After AlaM permeabilisation, Yo-Pro-1 also appeared in mitochondria, as seen using MitoTracker red as marker. AlaM treatment led to a partial reorganisation of e.g. mitochondria and other membranous organelles into ring shaped structures, which could not be fully interpreted in this investigation.