Forts… ”Enterobacteriaceae” “Salmonella” artrik >2500 O-serotyper, S.smittställe -S. typhi (enterica) S.paratyphi Symptom:Vanliga Salmonellor ger diarré, feber S.Typhi och S.paratyphi ger mycket allvarligare symptom, hög feber och allmänpåverkan, sepsis -Yersinia enterokolitika Symptom: diarré, kraftiga smärtor i magen som påminner om blindtarmsinflammation -Shigella dysenteriae Symptom: Feber, diarréer ibland slemmiga och blodiga sk “rödsot” G- böjd stav Vibrio, aeroba -Vibrio kolera Form: Vibrio, böjd stav Gramfärgning:Gramnegativ Syrebehov: Aerob Virulensfaktorer: Exotoxin Epidemiologi: vanligen smitta via förorenat vatten både barn och vuxna Symptom: Kraftig diarré -Campylobacter jejunii Form: Böjd stav Gramfärgning:Gramnegativ Syrebehov: Aerob Campylo Virulensfaktorer: “faktorer som reglerar adhesion, rörlighet (flageller) och invasion. =kurva Epidemiologi: förekommer i naturen,djur smitta via mat/vatten främst kykling Symptom: feber, ledvärk, diarré och magsmärtor (det finns en autoimmunsjukdom som går på nervvävnad som man tror inducerats pga Campylobacter infektion) -Helicobacter pylori Form: Böjd stav Gramfärgning:Gramnegativ Syrebehov: mikroaerofil Virulensfaktorer: “faktorer som regierar adhesion, rörlighet (flageller) och invasion. För mer info om H.pylori se bok Epidemiologi: förekommer i naturen smitta via mat/vatten Symptom: magsår “Pseudomonas” *Pseudomonas aeruginosa Form: Gramfärgning: Syrebehov: Stav Gramnegativ Aerob Virulensfaktorer: Opportunist! (Vidhäftning, Kapsel Endotoxin, exotoxin) Antibiotika resistens Växer bra i olika temp Epidemiologi: Smitta från “överallt”, intern. För mer info se bok Symptom: UVI Infektiion i liggsår och brännskador “Haemophilus” (H.influenzae, H.parainfluenzae) Subgrupper a-f (b farligaste ingår i vaccin) *Haemophilus influenzae Form: Gramfärgning: Syrebehov: Stav Gramnegativ Aerob Virulensfaktorer: Vidhäftning kapsel pili Epidemiologi: Aerosolsmitta Symptom: Sinuit Otit Pneumoni Meningit “Bordetella” *B.pertussis (B.parapertussis- lite mildare variant) Form: Gramfärgning: Syrebehov: Stav (kockoid stav) Gramnegativ Aerob Virulensfaktorer: Vidhäftning Toxin Epidemiologi: Aerolsol smitta (luftburen) allvarliga infektioner hos nyfödda Symptom: “kikhosta” Vaccin inte riktigt fullgott skydd Kap i bok Francicella och Brucella -Francisella tularense Form: Gramfärgning: Syrebehov: liten kockobacill Gramnegativ Aerob Virulensfaktorer: Kapsel Intracellulär Epidemiologi: Vektorburen kan överföras via myggor eller andra stickande insekter. Sjukdom förekommer främst hos gnagare, kontakt med sjuka och döda djur (vanl. öga). Symptom: “Harpest” insektsbett->sår->lymfan. Öga->Bindhinnekatarr. (Vanligare norra sverige) -Legionella pneumophilia Form: stav Gramfärgning: Gramnegativ Syrebehov: Aerob Virulensfaktorer: Intracellulär i makrofager, invaderar epitel Epidemiologi: Förekommer överallt I vatten. Omgivningssmitta. Aerosol. Symptom: “legionellos” – pneumoni, hög feber huvudvärk, muskelvärk torrhosta 5-30% avlider “pontiac feber” –lnfluensalik symptom Form: Gramfärgning: Syrebehov: Spiroket Gramnegativ, annorlunda i cellvägg Mikroaerofil -Treponema palladium Epidemiologi: smittväg: sexuell virulensfaktorer: adherens, hyaluronidas, vävnads förstörelse som ett resultat av värdens immunsvar, klär in sig i fibronektin som skydd mot immunförsvaret symptom: “syfilis” primär (sår) sekundär (blod) tertiär (neurologiska symptom) -“Borrelia” Epidemiologi: smittväg vektorburen (fästing) virulensfaktorer: förändrar sina antigen, påverkar immunförsvaret symptom: “Borrelia” 3dagar-4veckor hudrodnad I ring 3månader-år neurologiska symptom Annorlunda cellvägg G- kock små, aeroba “Mycoplasma” Form: Gramfärgning: Syrebehov: minsta bakterien, kock Gramnegativ, ingen cellvägg membran med steroler aerob Mycoplasma pneumoniae Epidemiologi: droppsmitta virulensfaktorer: intracellulär, adherens, superantigen symptom: Övre-nedre luftvägsinfektioner, bronchopneumoni Det finns också en Mycoplasma variant som infekterar genitalt Mycoplasma genitalium “Chlamydia” Form: Gramfärgning: Syrebehov: kock Gramnegativ annorlunda cellvägg aerob Chlamydia trachomatis Virulensfaktorer: intracellulära Epidemiologi: smittväg direktkontakt sexuelldirektkontakt för urogenitalainfektioner Symptom: Urogenitala infektioner “Chlamydia” – klåda, flytningar, sveda kan orsaka sterilitet Ögoninfektioner Det finns också en Clamydia variant som infekterar i respiratoriska delar Clamydia pneumonie “twar” Följande frågor som har att göra med vilka olika patogena bakterier som kan förekomma i olika patientprov examineras muntligt vid gemensam genomgång. Vid misstanke om sepsis tar man vanligen ett blodprov, vilka bakterier är vanligt förekommande här? Vid misstanke om meningit tar man vanligen ett liqvorprov, vilka bakterier är vanligt förekommande här? Då man konstaterat en lunginflammation (pneumoni) tar man tex ett sputum prov på patienten och odlar från detta, vilka bakterier är vanligt förekommande här? Vilka bakterier är vanligt förekommande vid infektion i svalg (nämn 2)? Vilken bakterie är vanlig vid både otit och sinuit? Nämn 2 bakterier som är vanliga vid sår infektioner? Vilken är den vanligaste bakterien vid urinvägsinfektion (UVI)? Nämn 4 stycken bakterier som är tänkbara patogener i prov från faeces. Nämn 3 stycken bakterier som är tänkbara patogener i prov från uretra, cervix och rektum (dessa är alla tre mycket svårodlade). Diagnostik allmänt •Diagnoser baserar sig mycket på sjukdomens symptom, förlopp och sjukdomens utbreddhet i befolkningen •Utifrån sjukdomens symptom och förlopp finns ofta ett antal möjliga bakterier (och andra mikroorganismer) som kan orsaka sjukdomens symptom och förlopp •Valet av diagnostiska metoder för att säkerställa sjukdomsorsaken bygger på vilka bakterier (och andra mikroorganismer) som man tror orsakar sjukdomen Diagnostik Allmänt •Odling -allmänna odlingsmedium -selektiva medium •Direktpåvisning -färgning -mikroskopi •Serologi -påvisa antigen (proteiner-socker-fett från bakterien) -påvisa antikroppar mot bakteriens antigen hos patienten •Påvisa arvsmassa -PCR Diagnostik (kapitel i boken) ”Mikroskopiska principer och applikationer” Ljusmikroskop, elektronmikroskop, fluorescensmikroskop ”Molekylär diagnostik” RFLP, PCR, Genetiska prober ”Serologisk diagnostik” Serologi, Antikroppar, Antigen Diagnostik allmänt Vilka provtyper kommer man i kontakt med vid provtagning/diagnostik av bakterier? •Sterila punktat •Vävnadsbitar •Sekret •Luftvägsprover •Sårsekret •Faeces •Urin •Genitalia •Vilka olika typer av prover finns från luftvägarna? •Svalg •Nasopharynx •Sputum Mm Vilka olika typer av sterila punktat finns? •Blod •Likvor •ledpunktat Diagnostik allmänt Hur ser provets väg från provtagning till slutsvar ut? Vad är viktigt att tänka på tex. vid transport? •Val av prov – provtagning •Transport – tid - temperatur - transportmedium •Laboratoriet – provsättning - sortering - avläsning - efterarbete - typning - resistens bestämning - slutsvar •Tolkning av svar •Behandling Vad baserar sig indelning/klassificering av bakterier på? Indelning/klassificering av bakterier görs efter; -Cellvägg (Gram negativ (G-), Gram positiv (G+) etc) -Morfologi (kock, stav etc) -Växtsätt (kedjor, klasar, par etc) -Växtkrav (aerob, anaerob etc) -Arvsmassa Följande tre figurer illustrerar principen för ett tillvägagångssätt då man använder odling, gramfärgning och mikroskopering i kombination Med biokemiska test för att identifiera en bakterie Odling Gram positiv Stav Kock Spor+ Aerob Bacillus spor- katalasStreptococcus Anaerob Clostridium Syrafast+ Syrafast – Mycobacterium katalas+ glukos ferm.- katalasLactobacillus glukos ferm.+ Corynebacterium katalas+ Staphylococcus Odling Gram negativ kock Aerob Stav anaerob Diplokock Oxidas+ Syra från glukos Neisseria Citrat+ H2S+ Indol+ Gelatin- Indol+ gelatin+ Mannitol ferm. Mannitol ej ferm. Proteus Fermenterar glukos Citrat+ H2S- VPProteus Citrobacter Fermenterar ej glukos CitratH2S- VP+ Oxidas+ Casein+ Gelatin+ Vattenlösliga -pigment Pseudomonas VP+ MRlaktos ferm. kapsel ej motil Klebsiella VPMR+ Odling Forts Gram negativ Stav Indol+ Gelatin- Indol+ gelatin+ Mannitol ferm. Mannitol ej ferm. Laktos ferm. ej Salmonella VPProteus Cirobacter Proteus Laktos ferm. VP+ VPMR+ laktos ferm. kapsel ej motil Laktos ferm. ej Klebsiella Laktos ferm. Citrobacter Motil KapselEnterobacter VP+ MR- ej motil kapsel+ Klebsiella Laktos ferm. Motil Escherichia Laktos ferm. Ej ej motil Shigella Ett bra sätt att lära sig den speciella bakteriologin Är att läsa delar av varje enskilt kapitel som tar upp De olika bakterie släktena som vi gjort ovan kap 22-47 Ni kan också läsa kapitel 48 Som listar ett antal -Patogena bakterier -Kliniskbild -Epidemiologiska kännetecken -Virulensfaktoer -Behandling Ni kan också läsa kapitel 21 som kopplar den speciella bakteriologin till Diagnostiken Nedanför här kommer jag att ta upp några vanliga tänkbara bakterier som kan förekomma i prov från; Prov: Organsystem: •Blod hjärtkärl-lymfsystemet •Likvor nervsystemet •Ben/Led eller ben/led yta skelett systemet •Luftvägarna respirationssystemet •Sår hudsystemet •Urin urinvägssystemet •Mag-tarmkanalen digestiva systemet •Uretra, cervix, rektum reproduktionssystemet Tänkbara patogener i prov från: Blod: Sepsis Stafylokock species Streptokock species Salmonella species Övriga Enterobacteriaceae Pseudomonas Och många fler!!! Ökad risk; Hög ålder Immunsupprimerande läkemedel Leukemi Tänkbara patogener i prov från: Likvor: Meningit (hjärnhinneinflammation) Neisseria meningitidis Pneumokock Haemophilus influenzae Grupp B streptocker E.Coli Listeria monocytogenes Borrelia Infektioner i nervsystemet även: Clostridium tetani Clostridium botulinium Tänkbara patogener i prov från: Ben/Led eller benyta/ledyta Oraskat av trauma eller en postoperativ komplikation till ortopediska ingrepp Osteomyelit (infektion i ben) Streptokocker Stafylokocker E.Coli Anaerober Artrit (infektion i led) även protes Stafylokocker Tänkbara patogener i prov från luftvägar: Sputum prov (upphostning): Lunginflammation (pneumoni) Pneumokock (vanligast) Stafylokock aureus Enterobacter pneumonie Mycobacterium tuberculosis Legionella pneumophilia Mycoplasma pneumoniae Clamydophila pneumonie Haemophilus influensae Och Flera opportunister!!! Ex Klebsiella pneumonie Tänkbara patogener i prov från luftvägar: Svalg: Beta-hemolytiska streptokocker dvs Grupp A (Grupp C och G) Corynebacterium diphteriae Tänkbara patogener i prov från luftvägar: Nasopharynx: (man räknar ofta med att de patogener som finns i bihåla respektive mellanöra även finns i nasopahrynx, de återfinns också med stor sannolikhet i svalg eller näsprov) Mediaotit-sinuit (öroninflammation-bihåleinflammation) Oftast är det barn som har öroninflammation Och vuxna har bihåleinflammation Pneumokock Haemophilus influenzae (ger även upphov till bronkit och epiglottit) Moraxella catharralis Grupp A streptokock Grupp C och G streptokock Dessa patogener är ofta en komplikation till en tidigare virus infektion Bordetella pertussis (parapertussis) Ger ofta följd komplikationer Tänkbara patogener i prov från: Sårodling: Beta-hemolytiska streptokocker Grupp A Stafylokock aureus Enterobacteriaceae… (framför allt sår under midjan) Pseudomonas aeruginosa Clostridium perfringens Tänkbara patogener i prov från: Urin: Urinvägsinfektion E.Coli (vanligast) Klebsiella Enterobacter Stafylokock saprofyticus Enterokocker Proteus Pseudomonas Chlamydia trachomatis Tänkbara patogener i prov från: Faeces Mag-tamkanalen Salmonella species Campylobacter jejuni Shigella species Yersinia enterocolitica Vibrio kolera Helicobacter pylori Clostridium difficile ( opportunist - antibiotika orsakad) Patogena E.coli (svåra att skilja från apatogena i prov) Toxin från stafylokocker,Clostridium botulinium, Clostridium perfringens och bacillus cereus i mat Tänkbara patogener i prov från: Uretra, cervix, rectum: Sexuellt överförda sjukdomar Neisseria gonorrhoeae Clamydia trachomatis Treponema palladium