Cellkärnan och nukleinsyror Biovetenskap och teknik Annica Nordvall Bodell, ht-11 [email protected] Läsanvisningar till kursboken ”Cellbiologi”: kap 7,17 (s147-153) De flesta bilder i presentationen är hämtade från ”The Cell, a molecular approach”,Cooper och Hausman Eukaryot cell Eu=äkta karyon=kärna CELLKÄRNAN • Karaktäriserar eukaryota celler • Separerar genomet från cytoplasman • Omgärdas av ett dubbelmembran (envelope) • Transport av molekyler sker genom kärnporer Schematisk bild av cellkärnan EM bilder av kärnan och kärnmembranet. Ytter och innermembranet går ihop vid kärnporerna Ytter membranet fortsätter i Endoplasmatiskt Retikulum Kärnlamina • Ligger under innermembranet • Bildar ett nätverk som ger stadga åt kärnan • Byggs upp av proteiner som kallas lamin • Binder till kromatinet Lamin proteiner associerar med varandra och bildar nätverk EM bild av kärnlamina Kärnporer • Stor struktur som byggs upp ca 30 olika proteiner (125x106 D) • Kanalen har en diameter på ca 9 nm • Styr transporten ut och in ur kärnan – Små molekyler passerar fritt – RNA och större proteiner kräver aktiv transport EM bild av porkomplexen i kärnmembranet Schematisk bild av en kärnpor Transport genom kärnporer Transport genom kärnporerna • Flera miljoner molekyler passerar selektivt mellan kärnan och cytoplasman varje minut • Krävs igenkänningssignaler för denna transport Kärnproteiner har nuclear localisation signals (NLS) NLS känns igen importin eller exportin (Import av proteiner till kärnan) När importin bundit NLS binder det till kärnporens cytoplasmatiska filament. Transporteras sedan genom poren. Inne i kärna binder RAN/GTP till importin, och proteinet frisläpps. Importin-RAN/GTP transporteras sedan ut till cytoplasman. (Transport av RNA ut ur kärnan) Transporteras som ribonuleoproteiner (RNP). Specifika exportproteiner binder RNP och hjälper till med transport genom kärnporen Nukleolen här sker syntes av ribosomer Nukleolen NUKLEINSYROR Vad är nukleinsyrornas funktion? DNA (deoxyribonukleinsyra) RNA (ribonukleinsyra) • Finns i cellkärnan • 46 kromosomer • Innehåller all genetisk information • Humana genomet innehåller ca 21000 gener • Gener är mall för RNA • Bildas i kärnan med DNA som mall • Transporteras ut till cytoplasman • Är mall för proteiner DNA (deoxyribonukleinsyra) RNA (ribonukleinsyra) byggs upp av: • Deoxyribos • Baser: – – – – Adenin Cytosin Guanin Tymin • Fosfatgrupp Nukleotid byggs upp av: • Ribos • Baser: – – – – Adenin Cytosin Guanin Uracil • Fosfatgrupp Nukleotid Nukleotid struktur puriner pyrimidiner deoxyribos ribos Nukleotiderna i DNA eller RNA strängarna hålls ihop av fosfodiesterbindningar DNA struktur 5’ ände 3’ ände 3.4nm Nukleotiderna i en DNA sträng hålls ihop av fosfodiesterbindningar. Strängarna i helixen hålls ihop av vätebindningar som bildas mellan komplementära baser 3’ ände 5’ ände Kromatin består av DNA och proteiner eukromatin heterokromatin nukleolen Kromatin och kromosomer Packning av DNA nukleosom Histonproteiner packar DNA Nukleosomerna packas ihop till kromatinfibrer pärlbandsstruktur 30 nm kromatinfiber Packning av DNA - översikt library.thinkquest.org/C004535/chromosomes.html Några siffror om humana genomet • Storlek • Antal kromosomer • Antal gener • Andel kodande sekvenser • Andel repetitiva sekvenser Organisation av kromosomer i cellkärnan Kromosomer bildar looper som verkar fungera som funktionella enheter Metafas kromosomer förekommer endast vid celldelning www.microscopix.co.uk/chromosomes/index.htm I metafasen är kromosomerna som mest kondenserade och dessutom replikerade Humana karyotypen Exempel på numeriska kromosomavvikelser http://www.emc.maricopa.edu/faculty/farabee/BI OBK/BioBookhumgen.html Exempel på strukturella kromosomavvikelser http://www.rscbayarea.com/articles/pgd_indications.html www.rscbayarea.com/ articles/pgd_indications.html http://www.charite.de/ch/medgen/eumedis/cytogenetics05/va riants-chromosome-polymorph.html